| 缩写名词表 | 第7-8页 |
| 中文摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 1 前言 | 第12-28页 |
| 1.1 研究水稻开花的意义 | 第12-13页 |
| 1.2 植物开花的调控途径 | 第13-14页 |
| 1.3 水稻抽穗期调控网络 | 第14-23页 |
| 1.3.1 水稻不同时期对光周期的响应 | 第14-15页 |
| 1.3.2 自然条件下水稻抽穗期的变异 | 第15-16页 |
| 1.3.3 不同水稻品种的抽穗期主要由哪些基因控制？ | 第16-17页 |
| 1.3.4 突变体克隆方法对水稻抽穗期网络的完善 | 第17-19页 |
| 1.3.5 不同抽穗期基因之间的遗传互作对抽穗期的影响 | 第19-20页 |
| 1.3.6 水稻感应日长变化的分子机理 | 第20-22页 |
| 1.3.7 拟南芥日照长度识别机制 | 第22-23页 |
| 1.4 水稻抽穗期基因的自然变异与适应性 | 第23-24页 |
| 1.5 水稻抽穗期、株高和产量之间的关联 | 第24-25页 |
| 1.6 水稻和拟南芥生物钟基因的比较 | 第25-27页 |
| 1.7 水稻每穗颖花数的调控机制 | 第27页 |
| 1.8 水稻的驯化与改良 | 第27-28页 |
| 1.9 本研究的目的和意义 | 第28页 |
| 2 材料和方法 | 第28-35页 |
| 2.1 Ghd7.1 的表型考察和定位 | 第28-31页 |
| 2.1.1 使用的水稻品种和材料 | 第28页 |
| 2.1.2 水稻材料的种植和表型考察 | 第28-29页 |
| 2.1.3 DNA的快速提取方法 | 第29页 |
| 2.1.4 DNA小样抽提 | 第29页 |
| 2.1.5 PCR扩增 | 第29-30页 |
| 2.1.6 SSR基因型鉴定 | 第30页 |
| 2.1.7 热图的构建 | 第30页 |
| 2.1.8 PCR产物消化测序 | 第30-31页 |
| 2.2 Ghd7.1 的克隆和功能验证 | 第31-34页 |
| 2.2.1 RNA的抽提 | 第31页 |
| 2.2.2 总RNA反转录 | 第31页 |
| 2.2.3 realtime PCR检测基因表达差异 | 第31-32页 |
| 2.2.4 转化载体构建以及遗传转化 | 第32页 |
| 2.2.5 NIL光周期处理及检测差异表达差异 | 第32-33页 |
| 2.2.6 Ghd7.1 表达谱分析 | 第33页 |
| 2.2.7 Ghd7.1 的亚细胞定位 | 第33页 |
| 2.2.8 幼穗分化时期和大小的确认 | 第33-34页 |
| 2.3 Ghd7.1 的驯化和适应性分析 | 第34-35页 |
| 2.3.1 Ghd7.1 CDS区的比较测序 | 第34页 |
| 2.3.2 Ghd7.1 的基因型分析 | 第34页 |
| 2.3.3 进化树和进化流程图的绘制 | 第34页 |
| 2.3.4 重要等位基因型在各亚种中的分布及关联分析 | 第34-35页 |
| 3 结果与分析 | 第35-61页 |
| 3.1 Ghd7.1 的定位和候选基因的选择 | 第35-41页 |
| 3.1.1 Ghd7.1 的表型确认和定位 | 第35-38页 |
| 3.1.2 候选区段的标记开发 | 第38页 |
| 3.1.3 Ghd7.1 的精细定位 | 第38-39页 |
| 3.1.4 候选基因的选择 | 第39-41页 |
| 3.2 Ghd7.1 的克隆和功能研究 | 第41-53页 |
| 3.2.1 候选基因的功能验证 | 第41-44页 |
| 3.2.2 Ghd7.1 的表达谱 | 第44-45页 |
| 3.2.3 Ghd7.1 在不同光周期情况下的表达规律 | 第45页 |
| 3.2.4 Ghd7.1 的亚细胞定位 | 第45-47页 |
| 3.2.5 Ghd7.1 调控每穗颖花数途径探索 | 第47-48页 |
| 3.2.6 Ghd7.1 的光周期处理及下游调控基因检测 | 第48-51页 |
| 3.2.7 Ghd7.1 与生物钟的关系 | 第51-53页 |
| 3.3 Ghd7.1 的适应性研究 | 第53-61页 |
| 3.3.1 Ghd7.1 自然变异的发掘 | 第54-56页 |
| 3.3.2 Ghd7.1 不同单倍型的分布及其适应性 | 第56-57页 |
| 3.3.3 Ghd7.1 的演化历程 | 第57-61页 |
| 4 讨论 | 第61-68页 |
| 4.1 合理利用数据库资源加速基因克隆 | 第61-62页 |
| 4.2 在染色体的末端有重组热点存在 | 第62-63页 |
| 4.3 水稻生物钟跟拟南芥的差异，为我们研究、利用生物钟提供了巨大机遇 | 第63-64页 |
| 4.4 结合重测序能发现更多的基因变异，但NIL依然是证明变异效应的最佳方法 | 第64页 |
| 4.5 Ghd7.1 在水稻生育期育种中的利用 | 第64-65页 |
| 4.6 如何进一步完善水稻抽穗期的调控网络 | 第65-66页 |
| 4.7 Ghd7.1 的DNA变异验证了水稻的改良和扩散过程 | 第66-67页 |
| 4.8 Ghd7.1 及其同源基因在不同物种的平行进化 | 第67页 |
| 4.9 抽穗期Ghd7.1 的多效性特点 | 第67-68页 |
| 4.10 Ghd7.1 和Ghd7的关系 | 第68页 |
| 参考文献 | 第68-80页 |
| 附录:实验配方和引物 | 第80-83页 |
| 作者简介 | 第83-85页 |
| 致谢 | 第85-86页 |
