RNA编辑事件的可视化与多样本特性分析
| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-17页 |
| 1.1 研究目的和意义 | 第10-11页 |
| 1.2 当前研究现状 | 第11-13页 |
| 1.3 论文研究内容 | 第13-15页 |
| 1.3.1 关键技术难点 | 第13-14页 |
| 1.3.2 解决方案 | 第14-15页 |
| 1.4 论文章节安排 | 第15-16页 |
| 1.5 本章小结 | 第16-17页 |
| 第二章 RNA编辑事件概述 | 第17-36页 |
| 2.1 RNA编辑事件介绍 | 第17-21页 |
| 2.1.1 碱基互补配对原则 | 第17-18页 |
| 2.1.2 遗传信息流向 | 第18-20页 |
| 2.1.3 RNA编辑产生原理 | 第20-21页 |
| 2.2 RNA编辑事件检测与识别 | 第21-30页 |
| 2.2.1 检测类型 | 第21-23页 |
| 2.2.2 检测流程 | 第23-27页 |
| 2.2.3 识别算法介绍 | 第27-29页 |
| 2.2.4 识别流程 | 第29-30页 |
| 2.3 RNA编辑事件结果验证方法 | 第30-32页 |
| 2.3.1 双脱氧链终止法 | 第30-31页 |
| 2.3.2 焦磷酸测序法 | 第31-32页 |
| 2.4 分子生物学可视化技术简介 | 第32-35页 |
| 2.4.1 基因组可视化 | 第32-34页 |
| 2.4.2 RNA编辑可视化 | 第34-35页 |
| 2.5 本章小结 | 第35-36页 |
| 第三章 RNA编辑检测器软件的设计与实现 | 第36-55页 |
| 3.1 软件总体架构设计 | 第36-43页 |
| 3.1.1 UML类图设计 | 第38-39页 |
| 3.1.2 模型层设计 | 第39-41页 |
| 3.1.3 视图层设计 | 第41-42页 |
| 3.1.4 控制层设计 | 第42-43页 |
| 3.2 原始数据处理 | 第43-46页 |
| 3.2.1 测序数据处理 | 第43-44页 |
| 3.2.2 参考文件处理 | 第44-46页 |
| 3.3 可视化 | 第46-51页 |
| 3.3.1 可视化模块设计原则 | 第46-48页 |
| 3.3.2 位点可视化 | 第48-49页 |
| 3.3.3 染色体组型可视化 | 第49-50页 |
| 3.3.4 RNA编辑分布可视化 | 第50-51页 |
| 3.4 结果持久化设计 | 第51-54页 |
| 3.5 本章小结 | 第54-55页 |
| 第四章 基于多肝癌样本的RNA编辑特性分析 | 第55-71页 |
| 4.1 多肝癌样本RNA编辑特性分析概述 | 第55-56页 |
| 4.2 样本来源及数据提取 | 第56-59页 |
| 4.2.1 样本来源及处理 | 第56页 |
| 4.2.2 数据提取 | 第56-59页 |
| 4.3 RNA编辑位点识别 | 第59-60页 |
| 4.4 多样本编辑位点分析 | 第60-67页 |
| 4.4.1 位点分布情况 | 第61-66页 |
| 4.4.2 特定功能区域位点分析 | 第66-67页 |
| 4.5 ADAR家族影响分析 | 第67-70页 |
| 4.5.1 ADAR家族介绍 | 第67-68页 |
| 4.5.2 ADAR表达水平分析 | 第68-70页 |
| 4.6 本章小结 | 第70-71页 |
| 第五章 总结与展望 | 第71-73页 |
| 5.1 工作总结 | 第71页 |
| 5.2 下一步工作展望 | 第71-73页 |
| 参考文献 | 第73-78页 |
| 致谢 | 第78-80页 |
| 攻读硕士学位期间发表论文及专利申请 | 第80页 |
