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DExH/D-box RNA解螺旋酶Ded1p解螺旋机制的单分子研究

摘要第7-9页
ABSTRACT第9-10页
本文部分缩写的中英文对照第11-12页
引言第12-13页
第一章 文献综述第13-33页
    1 RNA解螺旋酶的概述第13-14页
    2 SF2 RNA解螺旋的概述第14-16页
    3 DEAD-box RNA解螺旋酶的概述第16-23页
        3.0 DExH/D-box RNA蛋白的概述第16页
        3.1 DEAD-box RNA解螺旋酶的结构特征第16-18页
        3.2 DEAD-box RNA解螺旋酶的生物学功能第18-20页
        3.3 DEAD-box RNA解螺旋酶的生物化学活性第20-22页
            3.3.1 ATP酶活性第20页
            3.3.2 RNA解螺旋活性第20-22页
            3.3.3 其它活性第22页
        3.4 DEAD-box蛋白的ATP利用第22-23页
    4 Ded1p RNA解螺旋酶的研究现状第23-24页
    5 单分子荧光共振能量转移技术的概述第24-26页
    参考文献第26-33页
第二章 Ded1p解螺旋酶的表达纯化与活性验证第33-51页
    1 材料与方法第34-42页
        1.1 试验材料第34-36页
            1.1.1 主要仪器第34页
            1.1.2 主要试剂第34页
            1.1.3 主要溶液的配制第34-36页
            1.1.4 菌株第36页
            1.1.5 Ded1p表达质粒第36页
        1.2 试验方法第36-42页
            1.2.1 引物设计第36页
            1.2.2 Ded1p-pET22b表达质粒的扩增和保存第36-38页
            1.2.3 质粒转化进入BL21 (DE3)感受态细胞并进行表达验证第38-39页
            1.2.4 Ded1p大量表达与纯化第39-40页
            1.2.5 Ded1p浓度测定与保存第40-41页
            1.2.6 Ded1p解螺旋活性验证第41-42页
    2 结果与分析第42-47页
        2.1 Ded1p-pET22b阳性克隆结果第42-43页
            2.1.1 Ded1p-pET22b阳性克隆结果第42页
            2.1.2 阳性菌落验证结果第42-43页
            2.1.3 阳性菌落的测序结果第43页
        2.2 Ded1p诱导表达验证结果第43页
        2.3 Ded1p大量表达纯化第43-46页
            2.3.1 Ni-NTA亲和层析纯化第43-44页
            2.3.2 Q-Sephrose纯化第44-45页
            2.3.3 Capto-DEAE纯化第45页
            2.3.4 Ded1p浓度测定第45-46页
        2.4 Ded1p解螺旋活性验证第46-47页
    3 讨论与小结第47-50页
        3.1 讨论第47-48页
        3.2 小结第48-50页
    参考文献第50-51页
第三章 Ded1p解螺旋机制的单分子研究第51-77页
    1 材料与方法第52-61页
        1.1 试验材料第52-54页
            1.1.1 主要仪器第52页
            1.1.2 主要试剂第52-53页
            1.1.3 订购序列第53页
            1.1.4 主要溶液配制第53-54页
        1.2 试验方法第54-61页
            1.2.1 RNA的荧光标记第54-55页
            1.2.2 样品通道的制备第55-57页
            1.2.3 荧光珠校准样的制备第57-58页
            1.2.4 RNA底物的制备第58-59页
            1.2.5 sm-FRET实验第59-60页
            1.2.6 数据处理第60-61页
    2 结果与分析第61-71页
        2.1 RNA的Cy5荧光标记效率与FRET验证第61-62页
        2.2 PEG非特异性吸附结果第62页
        2.3 荧光珠校准效果第62-63页
        2.4 RNA的转录和纯化第63-64页
        2.5 Ded1p单分子解螺旋实验结果第64-71页
            2.5.1 Ded1p解开双链RNA存在中间态第64-66页
            2.5.2 Ded1p的解螺旋速率具有ATP浓度和双链长度依赖性第66-67页
            2.5.3 Ded1p以一步解开双链为主,两步解开为辅第67-68页
            2.5.4 完全解链前的小峰是对双链RNA的前干扰状态第68-71页
    3 讨论与小结第71-74页
        3.1 讨论第71-72页
        3.2 小结第72-74页
    参考文献第74-77页
全文结论第77-79页
本文创新点第79-81页
攻读学位期间发表的学术论文目录第81-83页
致谢第83页

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