| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 缩略词 | 第15-16页 |
| 第一章 文献综述 | 第16-44页 |
| 1.1 趋磁细菌在自然界存在的广泛性 | 第16-23页 |
| 1.2 磁小体合成机制的研究现状 | 第23-36页 |
| 1.3 转录组学方法引入生物矿化研究 | 第36-41页 |
| 1.4 本研究的立项依据、理论意义及研究路线设计 | 第41-44页 |
| 第二章 材料与方法 | 第44-60页 |
| 2.1 培养基 | 第44-45页 |
| 2.2 本课题涉及的抗生素 | 第45页 |
| 2.3 酶和试剂 | 第45页 |
| 2.4 菌株与质粒 | 第45-47页 |
| 2.5 质粒小量提取及MSR-1基因组DNA提取 | 第47页 |
| 2.6 载体构建 | 第47页 |
| 2.7 热激转化 | 第47页 |
| 2.8 琼脂糖凝胶电泳 | 第47-48页 |
| 2.9 菌落PCR法快速检测细菌质粒 | 第48页 |
| 2.10 接合 | 第48页 |
| 2.11 缺失突变株的构建 | 第48-49页 |
| 2.12 突变株的互补菌株构建 | 第49页 |
| 2.13 趋磁螺菌MSR-1细胞生长和磁性(Cmag)的测定 | 第49-50页 |
| 2.14 透射电镜观察磁小体颗粒 | 第50页 |
| 2.15 细胞胞内铁含量测定 | 第50页 |
| 2.16 培养基中剩余铁含量测定 | 第50-51页 |
| 2.17 过氧化氢(H_2O_2)耐受性 | 第51页 |
| 2.18 链黑菌素(SNG)耐受性 | 第51页 |
| 2.19 RNA提取及反转录 | 第51-52页 |
| 2.20 RT-PCR | 第52页 |
| 2.21 荧光定量PCR (RT-qPCR) | 第52页 |
| 2.22 DNase I footprinting技术 | 第52-53页 |
| 2.23 GST标签外源蛋白在E.coil中的表达及纯化 | 第53-54页 |
| 2.24 Western blot技术 | 第54-56页 |
| 2.25 EMSA(DIG Gel Shift Kit,Roche) | 第56-60页 |
| 第三章 两种控铁培养条件下MSR-1菌株铁、氧代谢相关基因转录规律分析 | 第60-72页 |
| 3.1 前言 | 第60页 |
| 3.2 实验结果 | 第60-69页 |
| 3.3 小结与分析 | 第69-72页 |
| 第四章 两种控铁条件下MSR-1菌株的转录组分析 | 第72-98页 |
| 4.1 前言 | 第72页 |
| 4.2 实验结果 | 第72-94页 |
| 4.3 小结与分析 | 第94-98页 |
| 第五章 铁吸收调控蛋白Fur(MGMSRv2_3149)的功能分析 | 第98-114页 |
| 5.1 前言 | 第98页 |
| 5.2 实验结果 | 第98-111页 |
| 5.3 小结与分析 | 第111-114页 |
| 第六章 MSR-1菌株中Fur(MGMSRv2_3137)结构与功能的关系 | 第114-132页 |
| 6.1 前言 | 第114页 |
| 6.2 实验结果 | 第114-128页 |
| 6.3 小结与分析 | 第128-132页 |
| 第七章 结论与展望 | 第132-140页 |
| 7.1 总结 | 第132-135页 |
| 7.2 讨论 | 第135-137页 |
| 7.3 本研究创新点 | 第137页 |
| 7.4 展望及建议 | 第137-140页 |
| 参考文献 | 第140-154页 |
| 致谢 | 第154-156页 |
| 附录 引物列表 | 第156-160页 |
| 作者简历 | 第160页 |
