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N-糖基化修饰对瑞氏木霉纤维二糖水解酶I分泌、酶活和蛋白稳定性的影响及影响机制的研究

摘要第9-13页
ABSTRACT第13-16页
缩略词(Abbreviation)第18-20页
第一章:绪论第20-59页
    1.1 纤维素的微生物降解第20-22页
    1.2 纤维素酶第22-26页
        1.2.1 纤维素酶的命名方式第22-23页
        1.2.2 瑞氏木霉的纤维素酶系统第23-26页
    1.3 糖蛋白的糖基化第26-34页
        1.3.1 糖蛋白糖基化修饰的种类第26-28页
        1.3.2 N-糖基化修饰产生及修饰过程第28-30页
        1.3.3 N-糖基化修饰与糖蛋白折叠第30-32页
        1.3.4 糖蛋白糖基化修饰的重要性第32-34页
    1.4 内质网中的质量控制系统第34-41页
        1.4.1 蛋白折叠与ER中的QC系统第34-35页
        1.4.2 主要的QC系统第35-37页
        1.4.3 Calnexin/calreticulin循环第37-41页
    1.5 折叠缺陷蛋白的ERAD途径第41-45页
        1.5.1 ERAD的降解信号第41-43页
        1.5.2 EDEM第43-44页
        1.5.3 错误折叠蛋白的降解第44-45页
    1.6 真菌的糖基修饰酶类第45-48页
        1.6.1 真菌糖基修饰酶的种类第45-47页
        1.6.2 糖基修饰酶对N-糖基的修饰与蛋白折叠降解第47-48页
        1.6.3 糖基修饰酶的研究与纤维素酶的研究第48页
    1.7 纤维素酶的糖基化修饰第48-57页
        1.7.1 纤维素酶糖基化修饰的特点第48-49页
        1.7.2 瑞氏木霉纤维二糖水解酶CBH1的N-糖基化修饰第49-51页
        1.7.3 其他主要纤维素酶的N-糖基化位点及其糖基化修饰形式第51-52页
        1.7.4 糖基化修饰对纤维素酶的重要性第52-57页
    1.8 论文的立题依据及主要内容第57-59页
第二章 △cbh1敲除菌株、CBH1原位回补及N-糖基化位点突变菌株的构建第59-91页
    2.1 材料与方法第60-79页
        2.1.1 菌株和质粒第60页
        2.1.2 试剂和仪器第60-61页
        2.1.3 PCR引物第61-64页
        2.1.4 培养基第64-65页
        2.1.5 常用缓冲液的配制第65-66页
        2.1.6 培养条件第66-67页
        2.1.7 原生质体转化与菌种筛选第67页
        2.1.8 Bp克隆(Dels gateway系统)构建载体的原理及其实验方法第67-70页
        2.1.9 敲除载体的构建第70-73页
        2.1.10 Southren blot第73-77页
        2.1.11 pNPC酶活的测定方法第77页
        2.1.12 pNP标准曲线的制作第77页
        2.1.13 蛋白质含量测定第77-78页
        2.1.14 SDS-PAGE第78-79页
    2.2 结果与讨论第79-90页
        2.2.1 纤维二糖水解酶I(CBH1)敲除菌株(△cbh1)的构建第79-82页
        2.2.2 △cbh1-FS菌株的构建第82-83页
        2.2.3 △cbh1△eg1敲除菌株的构建及反筛第83-84页
        2.2.4 野生回补菌株WT的构建第84-86页
        2.2.5 CBH1N-糖基化位点突变的瑞氏木霉菌株(M45 M270 M384 MD1 MD2MT)的构建第86-88页
        2.2.6 WT△cne1和MT△cne1敲除菌株的构建第88-90页
    2.3 小结与讨论第90-91页
第三章 N-糖基化修饰缺失对CBH1分泌和胞内分子伴侣转录量的影响第91-107页
    3.1 材料与方法第91-96页
        3.1.1 主要仪器及试剂第91-92页
        3.1.2 常用缓冲液的配制第92页
        3.1.3 蛋白质含量测定第92页
        3.1.4 SDS-PAGE第92页
        3.1.5 western Blot检测第92-93页
        3.1.6 CBH1胞外分泌情况的研究第93页
        3.1.7 CBH1胞内滞留情况的研究第93-94页
        3.1.8 与折叠相关的转录因子转录量的研究第94-96页
        3.1.9 pNPC酶活的测定方法第96页
        3.1.10 WT△cne1和MT△cne1胞外分泌情况的研究第96页
        3.1.11 瑞氏木霉CBH1催化结构域的三维结构分析第96页
    3.2 结果与讨论第96-105页
        3.2.1 瑞氏木霉CBH1催化结构域上N-糖基化位点的分析第96-97页
        3.2.2 N-糖基化的缺失对突变菌株粗酶液水解活性的影响第97-98页
        3.2.3 N-糖基化的缺失对CBH1分泌的影响第98-101页
        3.2.4 CBH1N-糖基缺失的突变菌株体内CBH1的滞留量研究第101页
        3.2.5 N-糖基化修饰的缺失对CBH1电泳速率的影响第101-102页
        3.2.6 MT中与折叠相关的分子伴侣的转录量的研究第102-104页
        3.2.7 WT△cne1和MT△cne1菌株中CBH1分泌量的研究第104-105页
    3.3 小结与讨论第105-107页
第四章 N-糖基化缺失的CBH1蛋白的纯化、酶活及蛋白稳定性的研究第107-134页
    4.1 材料与方法第107-112页
        4.1.1 主要试剂及仪器第107-108页
        4.1.2 CBH1的诱导发酵第108-109页
        4.1.3 发酵液的浓缩第109页
        4.1.4 浓缩样品的除盐第109页
        4.1.5 阴离子交换层析DEAE Sepharose Fast Flow第109-110页
        4.1.6 阴离子交换柱层析Mono Q~(TM)5/50 GL第110页
        4.1.7 目的蛋白的鉴定和性质分析第110-112页
    4.2 结果与讨论第112-132页
        4.2.1 重组表达的CBH1的分离纯化条件的摸索第112-118页
        4.2.2 N-糖基化的缺失蛋白的质谱鉴定第118-119页
        4.2.3 SDS-PAGE检测重组CBH1的纯化第119-120页
        4.2.4 不同N-糖基缺失的CBH1水解活性的变化第120-123页
        4.2.5 N-糖基缺失CBH1蛋白的热稳定性检测第123-129页
        4.2.6 pH对N-糖基缺失CBH1的结构影响第129-130页
        4.2.7 C-末端融合的HA免疫标记并未改变重组CBH1的性质第130-132页
    4.3 小结与讨论第132-134页
第五章 瑞氏木霉α-1,2甘露糖苷酶(mns1p)和内质网降解增强α-甘露糖苷酶类似蛋白1(mnl1p)的体内功能研究第134-157页
    5.1 材料与方法第135-139页
        5.1.1 仪器和试剂第135页
        5.1.2 菌株、质粒第135页
        5.1.3 PCR引物第135-137页
        5.1.4 PNGase F处理糖蛋白第137页
        5.1.5 其他实验方法第137页
        5.1.6 敲除载体的构建策略第137-139页
    5.2 结果与讨论第139-155页
        5.2.1 △mns1p菌株的构建第139-141页
        5.2.2 △mnl1p菌株的构建第141-142页
        5.2.3 △UGT菌株的构建第142-143页
        5.2.4 △mns1p和△mnl1p菌株在不同碳源上的生长实验第143-144页
        5.2.5 △mns1p和△mnl1p菌株菌丝形态的变化第144页
        5.2.6 mns1p和mnl1p基因的敲除对CBH1分泌的影响第144-146页
        5.2.7 △mns1p和Amnl1p敲除菌株诱导上清的Avicel酶活第146-147页
        5.2.8 △mns1p和△mnl1p敲除菌株诱导上清的pNPC酶活和CMC酶活第147-148页
        5.2.9 △mns1p和△mnl1p菌株分泌的CBH1的纯化第148-152页
        5.2.10 △mns1p和△mnl1p菌株来源的CBH1纯化蛋白的酶活检测第152-153页
        5.2.11 mns1p和mnl1p基因的敲除对CBH1热稳定性的影响第153-155页
    5.3 小结与讨论第155-157页
全文总结与展望第157-160页
参考文献第160-177页
致谢第177-178页
攻读博士学位期间发表的学术论文第178-179页
附件第179-189页

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