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小麦抗条锈病相关基因的克隆及功能初步分析

摘要第7-10页
ABSTRACT第10-13页
缩写词第14-15页
第一章 文献综述第15-29页
    1.1 小麦条锈病第15-18页
        1.1.1 小麦条锈病的发生与危害第15页
        1.1.2 小麦抗条锈病基因的研究现状第15-18页
    1.2 植物抗病基因研究进展第18-22页
        1.2.1 植物的抗病性第18-19页
        1.2.2 植物抗病基因结构与功能第19-20页
        1.2.3 植物含F-box结构域类基因研究进展第20-22页
    1.3 基因芯片技术及其在植物抗病性研究中的应用第22-24页
        1.3.1 基因芯片的概念及主要技术流程第22页
        1.3.2 基因芯片技术在植物抗病性研究中的应用第22-24页
    1.4 比较基因组学在小麦基因组学中的应用第24-25页
    1.5 VIGS技术及其在植物抗病性研究中的应用第25-26页
    1.6 本研究的目的意义和技术路线第26-29页
        1.6.1 目的意义第26-27页
        1.6.2 技术路线第27-29页
第二章 利用基因芯片筛选小麦抗条锈病基因Yr26的抗病相关基因第29-49页
    2.1 引言第29页
    2.2 材料与方法第29-31页
        2.2.1 试验材料第29-30页
        2.2.2 方法第30-31页
            2.2.2.1 材料培养与接种第30页
            2.2.2.2 总RNA提取第30-31页
            2.2.2.3 基因芯片杂交第31页
    2.3 结果与分析第31-46页
        2.3.1 抗感材料受条锈菌诱导前后差异表达基因的筛选和分析第31-32页
        2.3.2 条锈菌诱导12h,Y263和92R137(抗病材料)相对于扬麦158(感病材料)差异基因表达谱分析第32-40页
            2.3.2.1 条锈菌诱导12h,抗、感材料差异表达基因数目的分析第32-34页
            2.3.2.2 差异表达基因的基因本体论(gene ontology,GO)分类第34-36页
            2.3.2.3 差异表达基因的染色体电子定位及与二穗短柄草比较基因组学分析第36-40页
        2.3.3 条锈菌诱导36h,Y263和92R137相对于扬麦158差异基因表达谱分析第40-46页
            2.3.3.1 条锈菌诱导36h,抗、感材料差异表达基因数目的分析第40-41页
            2.3.3.2 差异表达基因的基因本体论(gene ontology,GO)分类第41-43页
            2.3.3.3 差异表达基因的染色体电子定位及与二穗短柄草比较基因组学分析第43-46页
    2.4 讨论第46-49页
第三章 小麦中一个含NB-ARC结构域基因TaRPM1的克隆及功能初步分析第49-85页
    3.1 引言第49页
    3.2 材料第49-50页
    3.3 实验方法第50-69页
        3.3.1 TaRPM1的克隆第50-55页
            3.3.1.1 5'RACE-3'RACE第50-53页
                3.3.1.1.1 5'RACE反应第50-52页
                3.3.1.1.2 3'RACE反应第52-53页
            3.3.1.2 PCR产物的回收和克隆第53-55页
                3.3.1.2.1 PCR产物的回收纯化第53页
                3.3.1.2.2 PCR产物的连接第53页
                3.3.1.2.3 大肠杆菌感受态细胞的制备第53-54页
                3.3.1.2.4 连接产物的热击转化第54页
                3.3.1.2.5 阳性克隆的鉴定第54页
                3.3.1.2.6 cDNA及gDNA全长序列的扩增第54-55页
        3.3.2 TaRPMl表达特征分析第55-56页
            3.3.2.1 总RNA的提取及其纯度检测第55页
            3.3.2.2 cDNA第一链浓度调整第55-56页
            3.3.2.3 半定量RT-PCR表达分析第56页
        3.3.3 TaRPMl染色体定位分析第56-59页
        3.3.4 TaRPM1 VIGS功能分析第59-64页
            3.3.4.1 VIGS载体的构建第59-60页
                3.3.4.1.1 VIGS引物设计第59页
                3.3.4.1.2 重组γ载体的构建第59-60页
            3.3.4.2 VIGS载体的线性化第60-61页
            3.3.4.3 体外转录第61-62页
            3.3.4.4 培养和接种第62-63页
                3.3.4.4.1 小麦和菌种的培养第62页
                3.3.4.4.2 病毒载体的摩擦接种参照第62页
                3.3.4.4.3 条锈菌接种第62-63页
            3.3.4.5 取样第63页
            3.3.4.6 实时荧光定量PCR(qRT-PCR)第63-64页
            3.3.4.7 条锈菌侵染过程组织学观察第64页
        3.3.5 TaRPM1转基因功能分析第64-68页
            3.3.5.1 受体材料准备第64页
            3.3.5.2 培养基配置第64-65页
            3.3.5.3 表达载体的构建及转化第65-66页
            3.3.5.4 微弹制备及基因枪轰击第66-67页
                3.3.5.4.1 质粒DNA的提取第66页
                3.3.5.4.2 微弹制备第66页
                3.3.5.4.3 轰击转化第66-67页
                3.3.5.4.4 抗性愈伤组织的筛选及植株再生第67页
            3.3.5.5 转基因植株的分子鉴定第67-68页
                3.3.5.5.1 CTAB法提取再生植株的基因组DNA第67页
                3.3.5.5.2 再生植株的PCR检测第67-68页
            3.3.5.6 转基因植株的条锈病抗性鉴定第68页
        3.3.6 候选基因的生物信息学分析第68-69页
    3.4 结果与分析第69-83页
        3.4.1 总RNA样品的质量检测第69页
        3.4.2 TaRPM1基因的克隆和特征分析第69-75页
            3.4.2.1 92R137中TaRPM1基因的克隆及序列结构分析第69-72页
            3.4.2.2 TaRPM1染色体定位分析第72-73页
            3.4.2.3 TaRPM1表达特征分析第73-74页
            3.4.2.4 TaRPM1多序列比对及进化树的构建第74-75页
        3.4.3 TaRPM1 VIGS功能分析第75-80页
            3.4.3.1 BSMV-VIGS载体构建第75-76页
            3.4.3.2 重组病毒的线性化和体外转录第76页
            3.4.3.3 接种病毒后表现及qRT-PCR对目标基因的沉默效率分析第76-78页
            3.4.3.4 接种条锈菌后的表型观察第78-79页
            3.4.3.5 接种条锈菌后的组织学观察第79-80页
        3.4.4 TaRPM1转基因功能分析第80-83页
            3.4.4.1 TaRPM1表达载体构建第80页
            3.4.4.2 TaRPM1转基因植株的获得第80-81页
            3.4.4.3 TaRPM1转基因植株的条锈病抗性鉴定第81-83页
                3.4.4.3.1 苗期条锈病抗性鉴定第81-83页
                3.4.4.3.2 成株期条锈病抗性鉴定第83页
            3.4.4.4 TaRPM1转基因植株T_1代目标基因的转录水平检测第83页
    3.5 讨论第83-85页
第四章 小麦中一个含F-box蛋白基因TaFBK的克隆及功能初步分析第85-107页
    4.1 引言第85页
    4.2 材料第85页
    4.3 实验方法第85-87页
        4.3.1 TaFBK的电子克隆第85-86页
        4.3.2 TaFBK-B转基因表达载体的构建第86-87页
    4.4 结果与分析第87-104页
        4.4.2 TaFBK基因的克隆和特征分析第87-94页
            4.4.2.2 92R137中TaFBK基因的克隆及序列结构分析第87-89页
            4.4.2.3 TaFBK表达特征分析第89-90页
            4.4.2.4 抗、感小麦材料中TaFBK同源基因的克隆及TaFBK拷贝数分析第90-93页
            4.4.2.5 TaFBK多序列比对及进化树的构建第93-94页
        4.4.3 TaFBK的VIGS功能分析第94-98页
            4.4.3.1 BSMV-VIGS载体构建第94-95页
            4.4.3.2 重组病毒的线性化和体外转录第95-96页
            4.4.3.3 对TaFBK沉默效率的qRT-PCR分析第96页
            4.4.3.4 接种条锈菌后的表型观察第96-97页
            4.4.3.5 接种条锈菌后的组织学观察第97-98页
        4.4.4 TaFBK转基因功能分析第98-104页
            4.4.4.1 TaFBK-D转基因表达载体构建第98-99页
            4.4.4.2 TaFBK-D转基因植株的获得第99页
            4.4.4.3 TaFBK-D转基因植株的条锈病抗性鉴定第99-103页
                4.4.4.3.1 苗期条锈病抗性鉴定第100-101页
                4.4.4.3.2 成株期条锈病抗性鉴定第101-103页
            4.4.4.5 TaFBK-B转基因表达载体构建第103-104页
            4.4.4.6 TaFBK-B转基因植株的获得第104页
    4.5 讨论第104-107页
全文结论第107-109页
参考文献第109-121页
附录第121-123页
致谢第123页

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