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铝胁迫下杉木无性系苗若干生理过程及转录组的研究

中文摘要第11-13页
Abstract第13-16页
第一章 综述第17-39页
    1.1 植物铝毒害研究进展第17-32页
        1.1.1 铝毒害与活性氧、氧化胁迫有关第17-18页
        1.1.2 铝毒害与pH之间的关系第18-19页
        1.1.3 缓解铝毒害的机制第19-23页
            1.1.3.1 添加外源物质第19-20页
            1.1.3.2 有机酸的分泌第20-21页
            1.1.3.3 铝毒害与酶活性第21-22页
            1.1.3.4 植株自身的调控以及有机阴离子的释放第22页
            1.1.3.5 铝毒害的新机制:细胞质中Ca信号的消极调节第22页
            1.1.3.6 蛋白质的变化第22-23页
        1.1.4 铝毒害对植物生理方面的影响第23-24页
        1.1.5 铝毒害分子方面研究进展第24-28页
            1.1.5.1 与铝毒害相关基因的研究第24-26页
            1.1.5.2 与铝毒害相关的micRNA研究进展第26页
            1.1.5.3 与转录组相关第26-28页
        1.1.6 提高植物的耐铝机制及策略第28-29页
            1.1.6.1 提高耐铝性的两种策略第28页
            1.1.6.2 调节激素水平第28页
            1.1.6.3 某些酶活相关基因等的过表达可提高耐铝性第28-29页
            1.1.6.4 筛选耐铝突变体第29页
            1.1.6.5 从分子育种角度第29页
        1.1.7 筛选耐铝毒植物的方法第29-31页
        1.1.8 铝毒害与细胞程序性死亡第31-32页
    1.2 杉木铝毒害研究进展第32页
    1.3 叶绿素荧光动力学技术在植物逆境中的研究进展第32-34页
    1.4 离子流研究进展第34-36页
    1.5 立题依据和研究意义第36-39页
第二章 铝胁迫对杉木无性系地上、地下部分6种矿质元素吸收的影响第39-79页
    2.1 材料与方法第39-43页
        2.1.1 供试材料第39页
        2.1.2 仪器第39页
        2.1.3 试验方法第39-41页
            2.1.3.1 培养基的配制第39页
            2.1.3.2 溶液的配制第39-41页
        2.1.4 铝胁迫对杉木无性系地上、地下部分磷、钾、钙、镁、铝、铁含量的影响第41页
        2.1.5 应用全自动间断化学分析仪测定铝、铁含量的方法编制第41-42页
            2.1.5.1 方法原理第41页
            2.1.5.2 仪器操作步骤第41-42页
        2.1.6 数据分析第42-43页
    2.2 结果与分析第43-74页
        2.2.1 应用全自动间断化学分析仪测定铝含量的方法第43-47页
            2.2.1.1 吸收光谱第43页
            2.2.1.2 最佳实验条件选择第43-45页
            2.2.1.3 铝标准曲线的制备第45页
            2.2.1.4 准确度和精密度考察第45-46页
            2.2.1.5 加标回收率第46-47页
        2.2.2 应用全自动间断化学分析仪测定铁含量的方法第47-51页
            2.2.2.1 吸收光谱第47-48页
            2.2.2.2 最佳实验条件选择第48-49页
            2.2.2.3 铁标准曲线的制备第49页
            2.2.2.4 准确度和精密度考察第49-50页
            2.2.2.5 加标回收率第50-51页
        2.2.3 铝胁迫对杉木无性系地下、地上部分磷、钾、钙、镁、铝、铁含量的影响第51-71页
            2.2.3.1 铝胁迫对杉木无性系地下、地上部分磷含量的影响第51-54页
            2.2.3.2 铝胁迫对杉木无性系地下、地上部分钾含量的影响第54-57页
            2.2.3.3 铝胁迫对杉木无性系地下、地上部分钙含量的影响第57-61页
            2.2.3.4 铝胁迫对杉木无性系地下、地上部分镁含量的影响第61-64页
            2.2.3.5 铝胁迫对杉木无性系地下、地上部分铝含量的影响第64-67页
            2.2.3.6 铝胁迫对杉木无性系地下、地上部分铁含量的影响第67-71页
        2.2.4 铝胁迫对杉木无性系磷、钾、钙、镁、铝、铁含量的方差及极差分析第71-74页
    2.3 讨论第74-77页
    2.4 小结第77-79页
第三章 铝胁迫对杉木叶绿素荧光特性的影响第79-87页
    3.1 材料与方法第79页
        3.1.1 供试材料第79页
        3.1.2 仪器第79页
        3.1.3 试验方法第79页
            3.1.3.1 培养基的配制第79页
            3.1.3.2 溶液的配制第79页
        3.1.4 数据分第79页
    3.2 结果与分析第79-84页
        3.2.1 铝胁迫对杉木无性系叶绿素荧光参数F_o的影响第79-80页
        3.2.2 铝胁迫对杉木无性系叶绿素荧光参数F_m的影响第80-81页
        3.2.3 铝胁迫对杉木无性系叶绿素荧光参数F_v的影响第81-82页
        3.2.4 铝胁迫对杉木无性系叶绿素荧光参数F_v/F_m的影响第82-84页
    3.3 讨论第84-85页
    3.4 小结第85-87页
第四章 铝胁迫对杉木根系离子吸收过程的影响第87-95页
    4.1 材料与方法第87-88页
        4.1.1 供试材料第87页
        4.1.2 试验方法第87页
            4.1.2.1 培养基的配制第87页
            4.1.2.2 溶液的配制第87页
            4.1.2.3 苗木培养第87页
        4.1.3 仪器与试剂第87页
        4.1.4 非损伤微测技术测定杉木幼苗根系H~+、K~+、Ca~(2+)、Mg~(2+)净流第87-88页
    4.2 结果与分析第88-92页
        4.2.1 铝胁迫对杉木根系H~+流的影响第88-89页
        4.2.2 铝胁迫对杉木根系K~+流的影响第89-90页
        4.2.3 铝胁迫对杉木根系Ca~(2+)流的影响第90-91页
        4.2.4 铝胁迫对杉木根系Mg~(2+)流的影响第91-92页
    4.3 讨论第92-94页
    4.4 小结第94-95页
第五章 杉木根系应答铝胁迫的转录组分析第95-145页
    5.1 材料与方法第95-102页
        5.1.1 杉木材料与铝胁迫处理方法第95页
            5.1.1.1 供试材料第95页
            5.1.1.2 仪器与试剂第95页
            5.1.1.3 材料培养第95页
        5.1.2 总RNA提取、cDNA文库构建及Illumina测序第95-101页
            5.1.2.1 总RNA提取第95-96页
            5.1.2.2 总RNA质量检测第96-97页
            5.1.2.3 文库构建和转录组测序第97页
            5.1.2.4 测序数据及质量控制第97-98页
            5.1.2.5 Unigene功能注释第98-99页
            5.1.2.6 基因结构分析第99-100页
            5.1.2.7 基因表达量分析第100页
            5.1.2.8 差异表达分析第100-101页
        5.1.3 实时荧光定量PCR验证第101-102页
        5.1.4 数据处理与分析第102页
    5.2 结果与分析第102-140页
        5.2.1 总RNA提取质量分析第102-109页
        5.2.2 测序数据统计与评估第109-111页
            5.2.2.1 测序碱基质量值第109-110页
            5.2.2.2 碱基分布检查第110-111页
        5.2.3 测序数据组装第111-113页
        5.2.4 转录组测序文库质量评估第113-116页
            5.2.4.1 mRNA片段化随机性检验第114页
            5.2.4.2 插入片段长度检验第114-115页
            5.2.4.3 转录组测序数据饱和度检验第115-116页
        5.2.5 Unigene的功能注释第116页
        5.2.6 基因结构分析第116-121页
            5.2.6.1 编码区序列预测第116-118页
            5.2.6.2 SNP分析第118页
            5.2.6.3 SSR分析第118-121页
        5.2.7 基因表达量分析第121-122页
            5.2.7.1 Unigene表达量分析第121页
            5.2.7.2 两个转录组样品基因表达量分析第121-122页
        5.2.8 差异表达分析第122-139页
            5.2.8.1 差异表达基因筛选第122-124页
            5.2.8.2 差异表达基因聚类分析第124-126页
            5.2.8.3 差异表达基因功能注释和富集分析第126-139页
        5.2.9 qPCR验证第139-140页
    5.3 讨论第140-142页
    5.4 小结第142-145页
第六章 铝胁迫对杉木根中与铝、钙、磷元素吸收与运输相关的三个基因的表达分析第145-151页
    6.1 材料与方法第145-146页
        6.1.1 材料第145页
        6.1.2 总RNA的提取第145页
        6.1.3 反转录cDNA第一链的合成第145页
        6.1.4 铝胁迫对杉木根中与铝、钙、磷的吸收与利用相关的基因的表达分析第145-146页
    6.2 结果与分析第146-148页
        6.2.1 不同铝胁迫时间处理对杉木根中Cl-TSJT1基因的qPCR表达分析第146-147页
        6.2.2 不同铝胁迫时间处理对杉木根中ClCa-uptake1基因的qPCR表达分析第147-148页
        6.2.3 不同铝胁迫时间处理对杉木根中ClPt1基因的qPCR表达分析第148页
    6.3 讨论第148-150页
        6.3.1 铝胁迫对杉木根中Cl-TSJT1基因表达的影响第148-149页
        6.3.2 铝胁迫对杉木根中ClCa-uptake1基因表达的影响第149页
        6.3.3 铝胁迫对杉木根中ClPt1基因表达的影响第149-150页
    6.4 小结第150-151页
第七章 铝胁迫对杉木根中与元素参与调控相关的差异表达基因的影响第151-165页
    7.1 杉木根中与元素参与调控相关的差异表达基因的影响第151-162页
        7.1.1 杉木根中与磷元素参与调控相关的差异表达基因的影响第151-152页
        7.1.2 杉木根中与钾元素参与调控相关的差异表达基因的影响第152-154页
        7.1.3 杉木根中与钙元素参与调控相关的差异表达基因的影响第154-156页
        7.1.4 杉木根中与镁元素参与调控相关的差异表达基因的影响第156-158页
        7.1.5 杉木根中与铝元素参与调控相关的差异表达基因的影响第158-160页
        7.1.6 杉木根中与铁元素参与调控相关的差异表达基因的影响第160-162页
    7.2 讨论第162-164页
    7.3 小结第164-165页
第八章 结论与展望第165-169页
    8.1 结论第165-166页
    8.2 创新点第166-167页
    8.3 展望第167-169页
参考文献第169-191页
附录第191-207页
攻读博士学位期间发表的学术论文及其他成果第207-209页
致谢第209页

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