| 摘要 | 第7-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 前言 | 第10-12页 |
| 第1章 文献综述 | 第12-26页 |
| 1.1 生物信息学概论 | 第12-17页 |
| 1.1.1 生物信息学 | 第12-13页 |
| 1.1.2 生物信息学公共数据库 | 第13-14页 |
| 1.1.3 水稻功能基因研究相关的数据库 | 第14-17页 |
| 1.2 真核启动子的研究 | 第17-18页 |
| 1.3 胚乳特异性启动子的研究进展 | 第18-22页 |
| 1.3.1 谷蛋白基因启动子 | 第18-21页 |
| 1.3.2 醇溶蛋白基因启动子 | 第21页 |
| 1.3.3 球蛋白基因启动子 | 第21页 |
| 1.3.4 其他种子特异性基因的启动子 | 第21-22页 |
| 1.4 胚乳特异性启动子核心调控元件的功能研究 | 第22-24页 |
| 1.5 本课题的研究内容和目标 | 第24-26页 |
| 第2章 水稻胚乳特异表达基因的生物信息学筛选及表达模式分析 | 第26-40页 |
| 2.1 材料与试剂 | 第26页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第26页 |
| 2.1.2 实验试剂 | 第26页 |
| 2.2 实验方法 | 第26-29页 |
| 2.2.1 生物信息学数据库的应用和查找水稻种子特异的功能基因 | 第26-27页 |
| 2.2.2 水稻RNA的提取及反转录合成cDNA | 第27页 |
| 2.2.3 半定量RT-PCR分析 | 第27-28页 |
| 2.2.4 实时荧光定量realtime-PCR分析 | 第28-29页 |
| 2.2.5 水稻胚乳灌浆速率的测定 | 第29页 |
| 2.3 结果与分析 | 第29-38页 |
| 2.3.1 生物信息学方法获得候选基因 | 第29-31页 |
| 2.3.2 候选基因的半定量RT-PCR分析 | 第31-34页 |
| 2.3.3 Latex-1基因的real time-PCR分析 | 第34-36页 |
| 2.3.4 水稻胚乳的灌浆速率与Latex-1基因定时定量表达的内在关联 | 第36-38页 |
| 2.4 小结 | 第38-40页 |
| 第3章 Latex-1基因生物信息学分析及其启动子功能初步验证 | 第40-50页 |
| 3.1 实验材料 | 第40页 |
| 3.1.1 供试水稻品种 | 第40页 |
| 3.1.2 菌株和质粒 | 第40页 |
| 3.1.3 主要试剂 | 第40页 |
| 3.2 实验方法 | 第40-43页 |
| 3.2.1 生物信息学分析 | 第40-41页 |
| 3.2.1.1 Latex-1基因的功能和蛋白结构域分析 | 第40-41页 |
| 3.2.1.2 Latex-1基因的启动子序列分析 | 第41页 |
| 3.2.2 Latex-1基因的启动子不同片段长度的克隆 | 第41-42页 |
| 3.2.3 构建启动子与GUS基因融合表达载体 | 第42页 |
| 3.2.4 基因组DNA的提取 | 第42页 |
| 3.2.5 转基因植株的分子检测 | 第42-43页 |
| 3.2.5.1 转基因植株的潮霉素抗性检测 | 第42-43页 |
| 3.2.5.2 转基因植株的PCR检测 | 第43页 |
| 3.2.5.3 转基因植株的GUS活性检测 | 第43页 |
| 3.3 结果和分析 | 第43-49页 |
| 3.3.1 Latex-1基因的功能和蛋白质结构域特征 | 第43-44页 |
| 3.3.2 Latex-1基因的启动子序列特征 | 第44-45页 |
| 3.3.3 Latex-1基因的5’端缺失启动子的克隆 | 第45-46页 |
| 3.3.4 分段缺失的Latex-1启动子-GUS双元表达载体的构建 | 第46-48页 |
| 3.3.5 转基因植株叶片潮霉素抗性筛选 | 第48页 |
| 3.3.6 转基因植株的PCR扩增结果 | 第48页 |
| 3.3.7 转基因植株的GUS活性检测结果 | 第48-49页 |
| 3.4 小结 | 第49-50页 |
| 第4章 讨论 | 第50-53页 |
| 4.1 胚乳特异性强表达基因的筛选 | 第50页 |
| 4.2 胚乳特异性基因Latex-1的研究 | 第50-51页 |
| 4.3 胚乳特异性启动子的调控基序研究 | 第51页 |
| 后续的工作 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-58页 |
| 附录1 | 第58-60页 |
| 附录2 | 第60-61页 |
| 附录3 | 第61-68页 |
| 附录4 | 第68-72页 |
| 致谢 | 第72页 |
