缩略语表 | 第6-11页 |
中文摘要 | 第11-15页 |
ABSTRACT | 第15-19页 |
前言 | 第20-22页 |
文献回顾 | 第22-33页 |
第一部分 体外RNA亲和捕捉法分离DENV-2 RNA UTR区结合蛋白及功能鉴定 | 第33-79页 |
1 材料 | 第33-38页 |
1.1 仪器 | 第33-34页 |
1.2 细胞、病毒、菌株和质粒载体 | 第34-36页 |
1.3 试剂 | 第36-38页 |
2 方法 | 第38-50页 |
2.1 体外转录生物素化的 5'-3'UTR-bio RNA | 第38-40页 |
2.2 DENV-2 扩增和浓缩 | 第40-41页 |
2.3 病毒空斑形成单位(pfu)测定 | 第41页 |
2.4 Hep G2细胞胞浆蛋白的提取 | 第41-42页 |
2.5 蛋白的定量(BCA法) | 第42页 |
2.6 RNA亲和捕捉实验 | 第42-43页 |
2.7 质谱检测 | 第43-44页 |
2.8 相对实时定量PCR(RT-q PCR) | 第44-46页 |
2.9 SDS-PAGE和Western blotting | 第46-47页 |
2.10 流式细胞术检测细胞上清中DENV-2 | 第47页 |
2.11 RNA干涉 | 第47-48页 |
2.12 RNA免疫共沉淀测定 | 第48-49页 |
2.13 双荧光素酶活性实验 | 第49页 |
2.14 免疫荧光与激光共聚焦显微镜分析 | 第49-50页 |
2.15 统计学分析 | 第50页 |
3 结果 | 第50-72页 |
3.1 与DENV 5'-3'UTR潜在相互作用的宿主RNA结合蛋白质谱鉴定结果 | 第50-61页 |
3.2 PB蛋白LSm-1 在DENV复制过程中的作用 | 第61-66页 |
3.3 DDX蛋白家族参与DENV-2 在细胞内的复制过程 | 第66-72页 |
4 讨论 | 第72-79页 |
4.1 基于生物素标签的RNA亲和捕捉法可用于高效筛选RBP | 第72-73页 |
4.2 PB蛋白LSm1正调控DENV RNA的复制过程 | 第73-75页 |
4.3 DDX蛋白家族与病毒的复制 | 第75-79页 |
第二部分 细胞内分离DENV-2 RNA 5'-3'UTR结合蛋白的新方法的建立 | 第79-99页 |
1 材料 | 第79-80页 |
1.1 仪器 | 第79页 |
1.2 细胞、病毒、菌株和质粒载体 | 第79-80页 |
1.3 试剂 | 第80页 |
2 方法 | 第80-83页 |
2.1 质粒构建 | 第80-81页 |
2.2 DENV-2 的扩增和浓缩 | 第81页 |
2.3 病毒空斑测定实验 | 第81页 |
2.4 质粒转染细胞以及蛋白提取 | 第81-82页 |
2.5 BCA法测定蛋白浓度 | 第82页 |
2.6 细胞内组装RNA-结合蛋白的亲和捕捉实验 | 第82-83页 |
2.7 质谱分析 | 第83页 |
2.8 RT-q PCR | 第83页 |
2.9 SDS-PAGE和Western blot分析 | 第83页 |
2.10 RNA免疫共沉淀实验 | 第83页 |
2.11 免疫荧光与共聚焦分析实验 | 第83页 |
2.12 统计学分析 | 第83页 |
3 结果 | 第83-94页 |
3.1 细胞内转录 5'-3'U-S1 RNA的质粒构建及功能鉴定结果 | 第83-86页 |
3.2 分离细胞内组装 5'-3'-U-S1 RNA-RBP复合物的新方法 | 第86-92页 |
3.3 RPS8与DENV 5'和 3' UTR结合促进DENV复制 | 第92-94页 |
4 讨论 | 第94-99页 |
4.1 一步法分离细胞内组装RNA-RBP复合物的新方法 | 第94-97页 |
4.2 第一部分实验与本部分实验质谱结果的比较 | 第97页 |
4.3 RPS8作为新发现RBP促进DENV RNA复制 | 第97-99页 |
小结 | 第99-100页 |
参考文献 | 第100-112页 |
个人简历和研究成果 | 第112-114页 |
致谢 | 第114-115页 |