| 摘要 | 第10-12页 |
| 英文摘要 | 第12-13页 |
| 1 前言 | 第14-23页 |
| 1.1 DNA标记与连锁图谱 | 第14-16页 |
| 1.2 QTL定位的原理及作图方法 | 第16-17页 |
| 1.2.1 QTL的原理 | 第16页 |
| 1.2.2 区间定位法 | 第16页 |
| 1.2.3 复合区间定位法 | 第16-17页 |
| 1.2.4 多区间定位法 | 第17页 |
| 1.2.5 贝叶斯QTL定位 | 第17页 |
| 1.3 QTL定位的杂交群体 | 第17-19页 |
| 1.4 大麦重要QTL的定位现状 | 第19-22页 |
| 1.4.1 蛋白质含量 | 第19页 |
| 1.4.2 糖化力 | 第19页 |
| 1.4.3 产量 | 第19-20页 |
| 1.4.4 株高与抗倒伏 | 第20-21页 |
| 1.4.5 大麦Alpha淀粉酶 | 第21页 |
| 1.4.6 麦芽提取物和花期性状 | 第21-22页 |
| 1.5 研究目的 | 第22-23页 |
| 2 材料与方法 | 第23-39页 |
| 2.1 试验材料 | 第23页 |
| 2.2 单个QTL扫描 | 第23-24页 |
| 2.3 多个QTL的同时分析方法 | 第24-29页 |
| 2.3.1 多元回归模型 | 第25页 |
| 2.3.2 先验分布 | 第25-27页 |
| 2.3.3 后验分布 | 第27-29页 |
| 2.3.4 迭代抽样步骤 | 第29页 |
| 2.4 推断QTL存在的后验分布 | 第29-36页 |
| 2.4.1 贝叶斯压缩估计方法中的QTL检验问题 | 第29-30页 |
| 2.4.2 混合模型推断QTL后验概率——拟合法（Fit Mix） | 第30-36页 |
| 2.4.3 混合模型推断QTL后验概率——直观法（Sim Mix） | 第36页 |
| 2.5 遗传结构的统计方法 | 第36-39页 |
| 2.5.1 模型 | 第37页 |
| 2.5.2 先验分布 | 第37页 |
| 2.5.3 后验分布 | 第37-38页 |
| 2.5.4 迭代抽样步骤 | 第38页 |
| 2.5.5 经验贝叶斯预测遗传效果及显著性体验 | 第38-39页 |
| 3 结果与分析 | 第39-78页 |
| 3.1 北美大麦QTL定位分析 | 第39-57页 |
| 3.1.1 单标记扫描分析北美大麦资料 | 第39页 |
| 3.1.2 四种贝叶斯压缩估计方法分析北美大麦资料 | 第39页 |
| 3.1.3 贝叶斯压缩估计中QTL存在的后验概率 | 第39-40页 |
| 3.1.4 七种方法的整合 | 第40页 |
| 3.1.5 结果输出 | 第40-57页 |
| 3.2 QTL定位方法的模拟研究 | 第57-66页 |
| 3.2.1 四种贝叶斯压缩估计方法性能模拟研究 | 第57-59页 |
| 3.2.2 贝叶斯压缩估计中QTL后验概率推断的模拟研究 | 第59-66页 |
| 3.3 遗传结构解析结果 | 第66-78页 |
| 3.3.1 Alpha淀粉酶性状的遗传结构 | 第66-67页 |
| 3.3.2 糖化力性状的遗传结构 | 第67-69页 |
| 3.3.3 麦芽提取物 | 第69-70页 |
| 3.3.4 蛋白质含量性状的遗传结构 | 第70-72页 |
| 3.3.5 产量性状的遗传结构 | 第72-73页 |
| 3.3.6 株高性状的遗传结构 | 第73-75页 |
| 3.3.7 抗倒伏性状的遗传结构 | 第75-76页 |
| 3.3.8 花期性状的遗传结构 | 第76-78页 |
| 4 讨论 | 第78-86页 |
| 4.1 七种方法整合同时提高检测效率和降低假阳性率 | 第78页 |
| 4.2 不同贝叶斯方法采用不同的先验设置 | 第78-79页 |
| 4.3 贝叶斯方法中QTL效应的检验问题 | 第79-80页 |
| 4.4 遗传结构精细解析 | 第80-81页 |
| 4.5 样本重复验证 | 第81页 |
| 4.6 连锁不平衡精细定位 | 第81页 |
| 4.7 位置候选基因 | 第81-82页 |
| 4.8 全基因组关联研究实现QTL高效检测 | 第82-83页 |
| 4.9 基因和遗传变异水平的精细定位 | 第83-86页 |
| 5 结论 | 第86-87页 |
| 6 创新点 | 第87-88页 |
| 致谢 | 第88-89页 |
| 参考文献 | 第89-98页 |
| 附录 | 第98-102页 |
| 附录1 SimMix的Fortran程序代码 | 第98-102页 |
| 攻读博士学位期间发表的学术论文 | 第102页 |
