List of Abbreviation | 第7-8页 |
Abstract | 第8-9页 |
Chapter 01 Introduction | 第10-22页 |
1.1. Cotton Introduction | 第10-11页 |
1.1.1. Economic importance of cotton fiber | 第10-11页 |
1.2. Functional analysis of genes | 第11-12页 |
1.2.1. Functional study through gene silencing | 第11-12页 |
1.2.2. Functional study through over expressing gene | 第12页 |
1.3. Genetic engineering of commercially important plants | 第12-14页 |
1.3.1. Agrobacterium mediated transformation | 第12-14页 |
1.3.2. Transformation in Cotton | 第14页 |
1.4. Mechanism of fiber development in cotton | 第14-19页 |
1.4.1. Introduction of flavonoid | 第15页 |
1.4.2. Flavonoids in plants | 第15-16页 |
1.4.3. Flavonoid meabolic pathway in cotton | 第16-19页 |
1.5 Historical Background | 第19-22页 |
1.5.1. Major Findings in Cotton | 第20-22页 |
Chapter 02 Material and methods | 第22-37页 |
2.1. Study of F3'H gene in cotton | 第22-24页 |
2.1.1 RNAi vector construction | 第22-23页 |
2.1.2 Over expression vector construction | 第23-24页 |
2.2. Genetic transformation and growth of cotton | 第24-27页 |
2.3. DNA,RNA extraction,PCR and Southern blot analysis | 第27-29页 |
2.4. Ovule culture assay | 第29-32页 |
2.4.1. Chemical and hormones preparation | 第29-30页 |
2.4.2. Stock solutions and BT medium preparation | 第30页 |
2.4.3. Ovary Sterilization and culture | 第30-31页 |
2.4.4. Fiber Yield Analysis(FL and TFU measurement) | 第31-32页 |
2.5. Expression analysis of F3'H candidate genes | 第32-34页 |
2.5.1. Quantitative Real time(qRT)PCR | 第33-34页 |
2.6. Bioinformatics analysis of F3'H putative candidate genes | 第34-36页 |
2.6.1. Sequence retrieval and analysis of F3'H from Arabidopsis thaliana | 第34-35页 |
2.6.2. Sequences retrieval putative F3'H candidates from Gossypium lineage | 第35页 |
2.6.3. Sequences retrieval putative F3'H candidales from other plant species | 第35页 |
2.6.4. Protein domain,motif, annotation,and GO analysis | 第35-36页 |
2.6.5. Phylogenetic tree and structure analysis | 第36页 |
2.7. Statistical analysis | 第36-37页 |
Chapter 03 Results | 第37-51页 |
3.1. In-silico sequence identification and analysis of F3'H proteins | 第37-38页 |
3.2. Phylogenetic analysis of F3'H gene family | 第38-40页 |
3.3. Collateral insights into F3'H evolution in Gossypium lineage | 第40-41页 |
3.4. Sequence analysis of putative F3'H genes in cotton | 第41-43页 |
3.5. Expression analysis eight cotton F3'H genes | 第43-45页 |
3.6. Exogenous ERI in ovule cullture assay promoted fiber length | 第45-47页 |
3.7. Expression profiling of cotton F3'H genes from D-genome | 第47-49页 |
3.8. Results from Cotton Transgenic Plants | 第49-51页 |
3.8.1. Confirmation of F3'H silence plants and Southern blot analysis | 第49-51页 |
Chapter 04 Discussion | 第51-54页 |
4.1. Future Considerations | 第52-54页 |
References | 第54-65页 |
Acknowledgements | 第65-67页 |
Suplementry Data | 第67-78页 |
Supplementary table S1 | 第68-72页 |
Supplementary table S2 | 第72-78页 |