| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 前言 | 第9-15页 |
| 1 研究背景 | 第9-10页 |
| 2 香猪简介 | 第10-11页 |
| 3 单核苷酸多态性检测方法 | 第11-14页 |
| 3.1 基于在凝胶电泳中迁移率不同的检测方法 | 第12-13页 |
| 3.2 基于与模板DNA互补与否的检测方法 | 第13页 |
| 3.3 基于芯片的SNP分型技术 | 第13-14页 |
| 3.4 DNA测序法 | 第14页 |
| 4 研究目的及意义 | 第14-15页 |
| 第二章 实验材料与方法 | 第15-37页 |
| 1 实验材料与试剂仪器 | 第15-19页 |
| 1.1 实验材料 | 第15页 |
| 1.2 实验药品 | 第15-16页 |
| 1.3 试剂配制 | 第16-18页 |
| 1.4 实验仪器 | 第18-19页 |
| 2 实验方法 | 第19-37页 |
| 2.1 香猪耳组织基因组的提取及检测 | 第19-21页 |
| 2.2 样本纯合度检测 | 第21-22页 |
| 2.3 Illumina Porcine SNP60k芯片基因分型及数据分析 | 第22-25页 |
| 2.4 AS-PCR反应体系的建立 | 第25-30页 |
| 2.5 目的DNA片段的克隆及测序 | 第30-33页 |
| 2.6 AS-PCR检测SNP在香猪群体中的基因型 | 第33页 |
| 2.7 基因型与繁殖性状的关联分型 | 第33页 |
| 2.8 显著差异位点的生物信息学分析 | 第33-34页 |
| 2.9 RT-PCR检测香猪子宫角miRNA | 第34-37页 |
| 第三章 结果 | 第37-97页 |
| 1 香猪繁殖性状统计 | 第37-38页 |
| 2 香猪基因组质量检测 | 第38页 |
| 3 样本纯合度检测 | 第38-39页 |
| 4 AS-PCR精准性验证 | 第39-78页 |
| 4.1 测序验证AS-PCR精准性 | 第39-62页 |
| 4.2 芯片验证AS-PCR精准性 | 第62-63页 |
| 4.3 克隆测序验证目的片段的特异性 | 第63-78页 |
| 5 香猪SNP位点的基因频率及基因型与繁殖性状的关联分析 | 第78-91页 |
| 5.1 位点MARC0031843 | 第78-80页 |
| 5.2 位点INRA0026400 | 第80-82页 |
| 5.3 位点ALGA0117046 | 第82-84页 |
| 5.4 位点ASGA0095691 | 第84-85页 |
| 5.5 位点H3GA0036168 | 第85-86页 |
| 5.6 位点H3GA0040561 | 第86-88页 |
| 5.7 位点INRA0046993 | 第88-89页 |
| 5.8 位点ALGA0119050 | 第89-91页 |
| 6 三个猪品种的SNP基因频率差异比较 | 第91-93页 |
| 6.1 MARC0031843位点在三个猪品种间的差异 | 第91-92页 |
| 6.2 INRA0026400位点在三个猪品种间的差异 | 第92-93页 |
| 7 关联SNP的生物信息学分析 | 第93-94页 |
| 7.1 MARC0031843位点的生物信息学分析 | 第93-94页 |
| 7.2 INRA0026400位点的生物信息学分析 | 第94页 |
| 8 香猪子宫角RNA提取 | 第94-95页 |
| 9 miR-4331检测结果 | 第95-97页 |
| 第四章 讨论 | 第97-103页 |
| 1 位点MARC0031843 | 第98-99页 |
| 2 位点INRA0026400 | 第99-100页 |
| 3 位点ALGA0117046 | 第100-101页 |
| 4 位点ASGA0095691 | 第101页 |
| 5 位点H3GA0036168 | 第101-102页 |
| 6 位点H3GA0040561 | 第102页 |
| 7 位点INRA0046993 | 第102页 |
| 8 位点ALGA0119050 | 第102-103页 |
| 第五章 结论 | 第103-104页 |
| 致谢 | 第104-105页 |
| 参考文献 | 第105-110页 |
| 附录 | 第110-111页 |
| 缩略词表 | 第111页 |
