| 摘要 | 第5-7页 |
| abstract | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第11-17页 |
| 1.1 研究背景 | 第11-12页 |
| 1.2 细菌必需基因的研究 | 第12-16页 |
| 1.2.1 实验方法确定细菌必需基因 | 第12-13页 |
| 1.2.2 理论计算确定细菌必需基因 | 第13-16页 |
| 1.3 本文结构安排 | 第16-17页 |
| 第二章 细菌必需基因团簇模型及数据库构建 | 第17-26页 |
| 2.1 引言 | 第17-18页 |
| 2.2 细菌必需基因团簇模型介绍及数据收集 | 第18-22页 |
| 2.2.1 细菌必需基因团簇模型 | 第18-19页 |
| 2.2.2 CEG 2.0 数据收集与整理 | 第19-22页 |
| 2.3 数据库的构建 | 第22-24页 |
| 2.4 小结 | 第24-26页 |
| 第三章 CEG2.0 数据库的介绍及使用 | 第26-34页 |
| 3.1 CEG 2.0 数据库界面概述 | 第26页 |
| 3.2 CEG2.0 数据库的使用 | 第26-34页 |
| 3.2.1 CEG 2.0 主页 | 第26-27页 |
| 3.2.2 CEG 2.0 浏览页面 | 第27-31页 |
| 3.2.3 CEG 2.0 BLAST比对页面 | 第31-32页 |
| 3.2.4 CEG 2.0 其他页面 | 第32-34页 |
| 第四章 基于团簇模型的细菌必需基因识别工具 | 第34-43页 |
| 4.1 引言 | 第34-35页 |
| 4.2 K-value算法的数据来源和原理 | 第35-37页 |
| 4.2.1 K-value算法的数据来源 | 第35页 |
| 4.2.2 K-value算法的主要原理 | 第35-37页 |
| 4.3 CEG_ Match的使用 | 第37-40页 |
| 4.3.1 在线版本CEG_ Match的使用 | 第37-39页 |
| 4.3.2 本地版CEG_ Match的使用 | 第39-40页 |
| 4.4 CEG_Match功能更新前后性能比对 | 第40-42页 |
| 4.5 小结 | 第42-43页 |
| 第五章 CEG 2.0 数据库信息统计分析 | 第43-50页 |
| 5.1 CEG2.0 中物种信息统计 | 第43-44页 |
| 5.2 CEG 2.0 中团簇分布统计 | 第44页 |
| 5.3 CEG 2.0 中必需基因功能统计 | 第44-48页 |
| 5.4 CEG 2.0 中有关药物靶标新增内容介绍 | 第48-49页 |
| 5.5 CEG 2.0 与CEG 1.0 数据比较 | 第49-50页 |
| 第六章 全文总结及展望 | 第50-53页 |
| 6.1 本文总结 | 第50-51页 |
| 6.2 后续工作展望 | 第51-53页 |
| 致谢 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-58页 |
| 附录 | 第58-61页 |
| 硕士期间取得的成果 | 第61-62页 |