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北极冰川冻土Polaromonas属细菌R3-9的基因组学研究

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
第一章 前言第11-23页
    1.1 微生物资源简介第11-16页
        1.1.1 冰川微生物资源第11-13页
        1.1.2 微生物的分离第13-15页
        1.1.3 微生物资源的开发利用第15-16页
    1.2 微生物组学研究现状第16-21页
        1.2.1 基因组学第16-18页
        1.2.2 转录组学第18-19页
        1.2.3 蛋白组学第19-20页
        1.2.4 代谢组学第20页
        1.2.5 基因型特性分类第20-21页
    1.3 本研究的意义第21-23页
第二章 材料与方法第23-35页
    2.1 实验材料第23-25页
        2.1.1 样品与菌株第23页
        2.1.2 培养基第23页
        2.1.3 试剂和药品第23-25页
        2.1.4 主要仪器与设备第25页
    2.2 实验方法第25-35页
        2.2.1 冻土中微生物的分离纯化第25页
        2.2.2 革兰氏染色与显微观察第25-26页
        2.2.3 16S rRNA基因序列分析第26-27页
        2.2.4 全基因组DNA提取及测序第27-32页
        2.2.5 基因组组装第32-33页
        2.2.6 基因组的注释第33-35页
第三章 结果与讨论第35-57页
    3.1 菌株的分离第35页
    3.2 R3-9菌株的形态特征第35-36页
    3.3 R3-9菌株的16S rRNA基因序列分析第36-37页
    3.4 全基因组DNA提取及测序第37页
    3.5 基因组组装第37-41页
        3.5.1 测序数据量第37页
        3.5.2 原始数据的过滤第37-38页
        3.5.3 15-mer分析结果第38-39页
        3.5.4 组装结果第39-40页
        3.5.5 GC-Depth分析第40-41页
    3.6 R3-9基因组的注释第41-57页
        3.6.1 基因预测结果第41-42页
        3.6.2 重复序列测序结果第42-43页
        3.6.3 ncRNA的预测结果第43-44页
        3.6.4 基因功能注释结果第44-56页
        3.6.5 基因组序列提交第56-57页
第四章 结果与展望第57-60页
参考文献第60-64页
攻读硕士学位期间取得的研究成果第64-65页
致谢第65-66页
附件第66页

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