| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5-6页 |
| 一. 引言 | 第7-8页 |
| 二. 研究对象与方法 | 第8-16页 |
| 1. 研究对象 | 第8-9页 |
| 2. 研究方法 | 第9-16页 |
| 2.1. RNA-seq来源的表达数据预筛选 | 第9-10页 |
| 2.2. 差异表达基因筛选 | 第10页 |
| 2.3. 加权基因共表达网络分析 | 第10-16页 |
| 2.4. KEGG生物通路分析及Gene Ontology富集分析 | 第16页 |
| 三. 研究结果 | 第16-35页 |
| 1. RNA-seq来源的表达数据预筛选 | 第16-17页 |
| 2. 差异表达基因筛选 | 第17-19页 |
| 3. 加权基因共表达网络分析 | 第19-34页 |
| 3.1. 肿瘤样本加权基因共表达网络 | 第20-25页 |
| 3.2. 肿瘤加权基因共表达网络与临床信息的联系 | 第25-27页 |
| 3.3. 肿瘤-瘤旁组织联合加权基因共表达网络 | 第27-31页 |
| 3.4. 联合加权基因共表达网络与样本类型的联系 | 第31-32页 |
| 3.5. 联合网络A及网络B的基因模块重叠分析 | 第32-34页 |
| 4. 部分重要基因模块的GO及KEGG汇总 | 第34-35页 |
| 四. 讨论 | 第35-39页 |
| 1. PCG | 第36-38页 |
| 2. LncRNA | 第38-39页 |
| 五. 总结 | 第39-40页 |
| 六. 参考文献 | 第40-42页 |
| 附录一 相关代码 | 第42-65页 |
| 附录二 文献综述 | 第65-70页 |
| 参考文献 | 第69-70页 |
| 致谢 | 第70-71页 |