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苯系物暴露引起的仿刺参管足转录组差异表达基因分析

摘要第1-4页
Abstract第4-8页
第一章 研究综述第8-17页
   ·苯系物简介第8-11页
     ·苯系物的理化性质第8-9页
     ·苯系物的生物毒性第9页
     ·苯系物对海洋生物影响及研究现状第9-11页
   ·仿刺参生物学研究概况第11-14页
     ·仿刺参的生物学特性第11-12页
     ·仿刺参的免疫系统及防御机制第12-13页
     ·苯系物对仿刺参的影响第13-14页
   ·转录组学研究概况第14-16页
     ·转录组学研究方法第14-16页
     ·仿刺参转录组学的研究进展第16页
   ·本文研究的目的和意义第16-17页
第二章 苯系物联合暴露后仿刺参管足RNA提取及转录组测序和分析第17-30页
   ·材料与方法第17-22页
     ·实验样本第17页
     ·实验药品第17页
     ·主要仪器设备第17-18页
     ·仿刺参的处理及取样第18页
     ·仿刺参样品总RNA提取第18-19页
     ·总RNA纯度和浓度测定第19页
     ·转录组测序文库构建第19-20页
     ·Illumina测序第20页
     ·序列处理与拼接拼接第20-21页
     ·基因表达分析第21页
     ·基因结构注释第21-22页
   ·结果第22-28页
     ·总RNA纯度和浓度的检测第22页
     ·测序结果统计第22-23页
     ·基因表达统计分析第23-24页
     ·组装结果统计、表达分析及unigene的功能注释第24-28页
   ·讨论第28-30页
第三章 苯系物暴露引起仿刺差异表达基因的筛选及分析第30-54页
   ·实验方法第30-32页
     ·苯系物联合暴露仿刺参管足差异表达基因的筛选第30页
     ·苯系物联合暴露仿刺参管足差异表达基因的聚类分析第30页
     ·差异表达基因功能注释分类第30-31页
     ·差异基因的GO和KEGG富集第31页
     ·差异基因网络互作分析第31-32页
   ·结果与分析第32-48页
     ·苯系物联合暴露仿刺参管足差异表达基因的筛选第32-36页
     ·苯系物联合暴露仿刺参管足差异表达基因聚类分析第36-37页
     ·差异表达基因功能注释分类分析第37-39页
     ·差异表达基因的GO和Pathway富集分析第39-47页
     ·差异表达基因网络互作分析结果第47-48页
   ·讨论第48-54页
第四章 苯系物暴露仿刺参管足差异表达基因验证第54-60页
   ·实验方法第54-56页
     ·受试生物第54页
     ·苯系物暴露浓度及取样第54页
     ·RNA提取及质量检测第54页
     ·实时定量PCR第54-55页
     ·数据处理第55-56页
   ·验证结果第56-59页
     ·细胞色素P450 A46基因第56页
     ·谷胱甘肽-S-转移酶 σ 基因第56-57页
     ·乙酰胆碱酯酶基因第57-58页
     ·过氧化氢酶基因第58页
     ·实时定量PCR结果与转录组分析结果比较第58-59页
   ·讨论第59-60页
结论第60-61页
参考文献第61-68页
攻读硕士学位期间发表的学术论文第68-71页
致谢第71页

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