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铁离子对大肠杆菌外膜蛋白OmpW的调控机制研究

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-7页
缩略表第7-11页
第一章 绪论第11-17页
 1. 革兰氏阴性菌第11页
 2. 铁是病原菌毒力的关键调控因子第11-13页
 3. 外膜蛋白 OmpW 为毒力相关蛋白第13-15页
 4. 研究目的和意义第15-16页
 5. 技术路线和方法第16-17页
第二章 ompW 基因补救菌的构建第17-35页
 1. 前言第17-18页
 2. 实验材料、试剂和仪器第18-21页
   ·材料第18页
   ·试剂第18-19页
   ·仪器第19页
   ·主要试剂的配置第19-21页
 3. 方法第21-30页
   ·大肠杆菌 K12 基因组的提取第21页
   ·ompW 基因的引物设计第21-22页
   ·ompW 基因的扩增第22页
   ·pACYC184 质粒的提取第22-23页
   ·ompW 基因的单酶切第23页
   ·pACYC184 质粒的单酶切及去磷酸化第23-24页
   ·pACYC184 与 ompW 基因酶切片段连接第24-25页
   ·大肠杆菌 DH5α感受态细胞的制备第25页
   ·连接产物转化 DH5α感受态细胞第25页
   ·重组质粒 pACYC184-ompW 的鉴定第25-27页
     ·重组质粒 pACYC184-ompW 的单酶切鉴定第25-26页
     ·重组质粒 pACYC184-ompW 的 PCR 鉴定第26-27页
     ·重组质粒 pACYC184-ompW 的测序鉴定第27页
   ·重组质粒 pACYC184-ompW 转化 ompW 基因敲除菌第27页
     ·ompW 基因敲除菌感受态细胞的制备第27页
     ·重组质粒 pACYC184-ompW 转化ΔompW 的 PCR 鉴定第27页
   ·提取大肠杆菌 K12、ΔompW、ΔompW+pACYC184-ompW 膜蛋白第27-28页
   ·Western blot 验证ΔompW+pACYC184-ompW第28页
   ·质谱鉴定 OmpW第28-30页
     ·胶内酶解第28-29页
     ·质谱鉴定第29-30页
 4. 结果第30-34页
   ·PCR 扩增 ompW 基因第30页
   ·重组质粒 pACYC184-ompW 的鉴定第30-32页
     ·重组质粒 pACYC184-ompW 的单酶切鉴定第30-31页
     ·重组质粒 pACYC184-ompW 的 PCR 鉴定第31-32页
     ·重组质粒 pACYC184-ompW 的测序鉴定第32页
   ·重组质粒 pACYC184-ompW 转化ΔompW 的 PCR 鉴定第32页
   ·Western blot 验证ΔompW+pACYC184-ompW第32-33页
   ·MALDI-TOF/TOF 质谱鉴定 OmpW 蛋白第33-34页
 5. 讨论第34-35页
第三章 OmpW 与铁平衡间的关系第35-45页
 1. 前言第35页
 2. 实验材料第35-38页
   ·试剂第35-36页
   ·仪器第36页
   ·主要试剂的配置第36-38页
 3. 方法第38-40页
   ·确定 OmpW 表达受铁离子调控第38-39页
     ·Western blot 检测 OmpW 在 M9 培养基中铁离子浓度增加的表达情况第38-39页
     ·Western blot 检测 OmpW 在 LB 培养基中铁离子浓度降低的表达情况第39页
   ·确定 OmpW 对铁离子的转运作用第39-40页
     ·检测细菌对铁离子的摄取第39-40页
 4. 结果第40-43页
   ·OmpW 表达受铁离子的调控第40-42页
     ·M9 培养基中 OmpW 随铁离子浓度增加而上调第40-41页
     ·LB 培养基中 OmpW 随铁离子浓度降低而下调第41-42页
   ·OmpW 可能与对铁离子的摄取有关第42-43页
 5. 讨论第43-45页
第四章 铁对 OmpW 调控的转录因子第45-61页
 1. 前言第45页
 2. 材料第45-48页
   ·菌株和质粒第45页
   ·实验试剂第45-46页
   ·仪器第46-47页
   ·主要试剂的配置第47-48页
 3. 方法第48-54页
   ·Real-Time PCR 检测 K12 菌在正常和限铁条件下 Fur 和 SoxS 的表达情况第48-50页
     ·Real-Time PCR 引物的设计第48页
     ·细菌总 RNA 的提取第48-49页
     ·总 RNA 的反转录第49页
     ·Real-Time PCR第49-50页
   ·检测 Fur、SoxS 高表达菌中 OmpW 的表达情况第50-54页
     ·Fur、SoxS 高表达菌的构建第50-53页
     ·Real-Time PCR 检测 Fur、SoxS 高表达菌分别在正常和铁限制培养条件下的OmpW 的表达情况第53页
     ·Westernblot 检测 Fur、SoxS 高表达菌分别在正常和铁限制条件下的 OmpW 的表达情况第53-54页
 4. 结果第54-59页
   ·转录因子 Fur 可能参与铁对 OmpW 调控第54页
   ·Fur、SoxS 高表达菌的构建第54-56页
     ·PCR 扩增 fur 、soxS 基因第54-55页
     ·重组质粒 pET-28a(+)-fur、pET-28a(+)-soxS 的鉴定第55-56页
     ·Fur、SoxS 蛋白的诱导表达第56页
   ·OmpW 在 Fur 高表达菌中表达上调、SoxS 高表达菌中表达下调第56-59页
 5. 讨论第59-61页
第五章 OmpW 在氧化应激中的作用第61-66页
 1. 前言第61页
 2. 材料第61-62页
   ·实验试剂第61页
   ·仪器第61-62页
   ·主要试剂的配置第62页
 3. 方法第62-63页
   ·检测 K12、ΔompW 和+ompW 在不同浓度 H2O2应激处理下的存活情况第62-63页
   ·检测 K12 在不同浓度 H2O2处理下 OmpW 的表达情况第63页
 4. 结果第63-65页
   ·K12、ΔompW 和+ompW 在不同浓度 H2O2应激处理下的存活情况第63-65页
   ·K12 的 OmpW 表达量在 H2O2处理后下调第65页
 5. 讨论第65-66页
第六章 结论与展望第66-67页
 1. 结论第66页
 2. 展望第66-67页
参考文献第67-74页
攻读学位期间发表的论文第74-75页
致谢第75页

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