| 致谢 | 第1-5页 |
| 中文摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 目录 | 第9-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-23页 |
| ·鱼类的抗寒性状 | 第11-13页 |
| ·鱼类抗寒相关研究进展 | 第13-15页 |
| ·杂交育种提高鱼类的低温适应能力 | 第13页 |
| ·抗寒分子标记的筛选 | 第13-15页 |
| ·转抗寒相关基因研究进展 | 第15页 |
| ·鱼类抗寒相关基因的研究进展 | 第15-18页 |
| ·高通量测序技术 | 第18-21页 |
| ·主流高通量测序平台 | 第18-19页 |
| ·RNA 测序（RNA-seq） | 第19-20页 |
| ·Illumina Miseq 测序技术 | 第20-21页 |
| ·本研究内容及目标 | 第21-23页 |
| ·研究的目的和意义 | 第21页 |
| ·研究思路 | 第21-22页 |
| ·预期目标 | 第22-23页 |
| 第二章 低温胁迫对养殖牙鲆苗种组织学、酶活及基因表达谱影响研究 | 第23-72页 |
| 第一节 低温胁迫对养殖牙鲆苗种细胞学及酶活影响研究 | 第23-30页 |
| ·材料与方法 | 第24-25页 |
| ·实验材料 | 第24页 |
| ·实验仪器 | 第24页 |
| ·试剂 | 第24页 |
| ·实验方法 | 第24-25页 |
| ·结果 | 第25-29页 |
| ·低温对牙鲆体表形态的影响 | 第25-26页 |
| ·低温胁迫下牙鲆组织学的变化 | 第26-27页 |
| ·牙鲆 ATP 含量以及丙酮酸激酶和胰蛋白酶活力的变化 | 第27-29页 |
| ·讨论 | 第29-30页 |
| 第二节 基于 Miseq 测序技术的低温胁迫下牙鲆的转录组分析 | 第30-55页 |
| ·材料与方法 | 第30-35页 |
| ·实验材料 | 第30页 |
| ·实验仪器设备 | 第30-31页 |
| ·实验试剂及引物 | 第31-32页 |
| ·转录组数据分析 | 第32-35页 |
| ·real time RT-PCR 对转录组数据进行验证 | 第35页 |
| ·实验结果 | 第35-52页 |
| ·样品制备 | 第36-37页 |
| ·Miseq 测得的牙鲆转录组数据 | 第37-41页 |
| ·低温耐受组、低温敏感组、对照组差异表达基因筛选 | 第41-42页 |
| ·低温耐受组、低温敏感组、对照组转录组数据 GO 分析 | 第42-44页 |
| ·低温耐受组、敏感组、对照组转录组数据 KEGG 富集分析 | 第44-46页 |
| ·抗寒候选基因以及相关的代谢通路 | 第46-51页 |
| ·转录组数据的 Real time PCR 验证 | 第51-52页 |
| ·讨论 | 第52-54页 |
| ·信号通路以及信号转导 | 第52-53页 |
| ·能量代谢相关 | 第53-54页 |
| ·膜的流动性相关 | 第54页 |
| ·小结 | 第54-55页 |
| 第三节 牙鲆耐寒相关基因 CIRP、HMGB1 和 APO-AIV 克隆及表达特征分析 | 第55-72页 |
| ·材料与方法 | 第55-61页 |
| ·实验材料 | 第55-56页 |
| ·实验仪器 | 第56页 |
| ·试剂 | 第56页 |
| ·引物 | 第56-58页 |
| ·基因克隆 | 第58-60页 |
| ·RT-PCR 和 real time RT-PCR | 第60-61页 |
| ·实验结果 | 第61-68页 |
| ·牙鲆 CIRP、HMGB1、APO-AIV 的 cDNA 序列及结构 | 第61-66页 |
| ·CIRP、HMGB1、APO-AIV 的组织差异表达谱 | 第66页 |
| ·低温胁迫下 CIRP、HMGB1、APO-AIV 的时空差异表达谱 | 第66-68页 |
| ·讨论 | 第68-71页 |
| ·牙鲆 CIRP，HMGB1 和 APO-AIV 基因结构分析 | 第68-69页 |
| ·牙鲆 CIRP、HMGB1、APO-AIV 的组织差异表达谱比较 | 第69页 |
| ·低温胁迫下 CIRP、HMGB1、APO-AIV 基因表达的变化 | 第69-71页 |
| ·小结 | 第71-72页 |
| 第三章 抗寒相关基因的 SNP 位点筛选 | 第72-84页 |
| ·材料与方法 | 第72-75页 |
| ·实验材料 | 第72页 |
| ·实验仪器 | 第72页 |
| ·实验试剂 | 第72-73页 |
| ·引物 | 第73页 |
| ·抗寒相关基因 SNP 标记筛选 | 第73-75页 |
| ·牙鲆基因组 DNA 提取 | 第73-74页 |
| ·抗寒相关基因的基因组序列扩增 | 第74页 |
| ·抗寒相关基因 SNP 位点筛选 | 第74-75页 |
| ·实验结果 | 第75-84页 |
| ·抗寒相关基因的筛选及基因组序列 | 第75-76页 |
| ·牙鲆 CIRP 基因组序列 | 第75页 |
| ·牙鲆 HMGB1 基因组序列 | 第75-76页 |
| ·SNP 位点的初步筛选 | 第76-82页 |
| ·牙鲆 CIRP 基因 SNP 位点的初步筛选 | 第76-79页 |
| ·牙鲆 HMGB1 基因 SNP 位点的初步筛选 | 第79-82页 |
| ·讨论 | 第82-84页 |
| 结论 | 第84-85页 |
| 参考文献 | 第85-92页 |
| 作者简历 | 第92-93页 |
| 硕士期间论文撰写及专利申请情况 | 第93页 |
