| 摘要 | 第1-5页 |
| Summary | 第5-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-27页 |
| 1 牛产肉性能分子遗传研究 | 第11-17页 |
| ·分子遗传标记的种类及应用 | 第11-12页 |
| ·牛分子育种研究进展 | 第12-13页 |
| ·牛肉质性状相关候选基因研究概况 | 第13-17页 |
| ·脂肪酸结合蛋白（fatty acid-binding proteins, FABPs）家族基因 | 第15页 |
| ·肥胖基因（obesity gene, OB） | 第15-16页 |
| ·抑肌素基因(myostatin, MSTN) | 第16页 |
| ·生肌调节因子家族基因 (myogenic regulatory factor，MRF) | 第16页 |
| ·钙蛋白酶抑制蛋白(Calpastatin, CAST) | 第16-17页 |
| 2 钙蛋白酶概述 | 第17-22页 |
| ·钙蛋白酶基因家族 | 第17-18页 |
| ·钙蛋白酶基因结构 | 第18-20页 |
| ·钙蛋白酶的代谢及生理功能 | 第20-21页 |
| ·钙蛋白酶的活性调节 | 第21页 |
| ·钙蛋白酶与肌肉嫩度的关系 | 第21-22页 |
| 3 CAPN3 基因研究进展 | 第22-25页 |
| ·CAPN3 基因概述 | 第22-23页 |
| ·CAPN3 亚细胞定位 | 第23-24页 |
| ·CAPN3 的生理功能 | 第24页 |
| ·CAPN3 与畜禽产肉性能 | 第24-25页 |
| 4 牦牛资源概况 | 第25-26页 |
| 5 本研究的目的和意义 | 第26-27页 |
| 第二章 试验材料与研究方法 | 第27-40页 |
| 1 试验材料 | 第27-29页 |
| ·试验牦牛样品来源 | 第27页 |
| ·试验主要试剂 | 第27页 |
| ·试验主要仪器设备 | 第27-28页 |
| ·主要容液的配制 | 第28-29页 |
| 2 试验方法 | 第29-36页 |
| ·牦牛胴体及肉质性状测定方法 | 第29-30页 |
| ·牦牛基因组 DNA 提取 | 第30-31页 |
| ·牦牛骨骼肌组织总 RNA 提取 | 第31-32页 |
| ·CAPN3 基因克隆测序 | 第32-35页 |
| ·PCR 引物设计 | 第32页 |
| ·PCR 扩增体系 | 第32-33页 |
| ·PCR 扩增产物检测 | 第33页 |
| ·CAPN3 基因的克隆测序 | 第33-35页 |
| ·质粒 DNA 的小量制备 | 第33-34页 |
| ·目的片段琼脂糖凝胶回收 | 第34页 |
| ·DNA 片段的连接反应 | 第34页 |
| ·连接产物的转化 | 第34-35页 |
| ·重组质粒的快速鉴定 | 第35页 |
| ·PCR 扩增产物的 SSCP 分析 | 第35-36页 |
| ·PCR 扩增产物设计 | 第35页 |
| ·PCR 扩增条件 | 第35-36页 |
| ·SSCP 电泳 | 第36页 |
| ·银染 | 第36页 |
| 3 数据统计分析 | 第36-40页 |
| ·CAPN3 基因生物信息学分析软件 | 第36-37页 |
| ·基因多态性分析方法 | 第37-40页 |
| ·基因型频率和基因频率 | 第37页 |
| ·基因纯合度（Ho）、杂合度（He）、有效等位基因数（Ne）和多态信息含量（PIC） | 第37-38页 |
| ·胴体及肉质性状数据统计分析 | 第38-40页 |
| 第三章 结果与分析 | 第40-56页 |
| 1 牦牛 CAPN3 基因 CDS 区克隆及生物信息学分析 | 第40-47页 |
| ·牦牛 CAPN3 基因 CDS 区克隆 | 第40-41页 |
| ·牦牛 CAPN3 基因总 RNA 检测及 RT-PCR 扩增 | 第40-41页 |
| ·牦牛 CAPN3 基因 CDS 区克隆及重组子鉴定 | 第41页 |
| ·牦牛 CAPN3 基因生物信息学分析 | 第41-47页 |
| ·牦牛 CAPN3 基因开放阅读框分析 | 第41-42页 |
| ·牦牛与普通牛 CAPN3 基因序列比对 | 第42页 |
| ·牦牛及普通牛 CAPN3 基因编码蛋白序列比对 | 第42-43页 |
| ·牦牛 CAPN3 基因编码蛋白的理化性质预测 | 第43-44页 |
| ·牦牛 CAPN3 基因编码蛋白的二级与三级结构预测 | 第44-45页 |
| ·牦牛及其它物种 CAPN3 基因编码蛋白系统发育分析 | 第45-47页 |
| 2 牦牛 CAPN3 基因多态性和群体遗传分析 | 第47-53页 |
| ·牦牛 CAPN3 基因第 1 外显子多态性分析 | 第47-51页 |
| ·牦牛 CAPN3 基因第 1 外显子检测区 PCR 扩增 | 第47-48页 |
| ·牦牛 CAPN3 基因第 1 外显子 PCR 扩增产物 SSCP 检测 | 第48页 |
| ·牦牛 CAPN3 基因第 1 外显子扩增区等位基因序列比对 | 第48-50页 |
| ·牦牛 CAPN3 基因第 1 外显子扩增区等位基因频率和基因型频率 | 第50页 |
| ·甘南牦牛 CAPN3 基因第 1 外显子扩增区的纯合度、杂合度、有效等位基因数及多态信息含量 | 第50-51页 |
| ·牦牛 CAPN3 基因第 2 内含子多态性分析 | 第51-53页 |
| ·牦牛 CAPN3 基因第 2 内含子检测区的 PCR 扩增 | 第51页 |
| ·牦牛 CAPN3 基因第 2 内含子 PCR 扩增产物 SSCP 检测 | 第51页 |
| ·牦牛 CAPN3 基因第 2 内含子扩增区等位基因序列比对 | 第51-52页 |
| ·牦牛 CAPN3 第 2 内含子扩增区等位基因频率和基因型频率 | 第52-53页 |
| ·甘南牦牛 CAPN3 基因第 2 内含子扩增区的纯合度、杂合度、有效等位基因数和多态信息含量 | 第53页 |
| 3 甘南牦牛 CAPN3 基因第 2 内含子扩增区多态性对胴体及肉质性状的影响 | 第53-56页 |
| 第四章 讨论 | 第56-60页 |
| 1.牦牛 CAPN3 生物信息学特征 | 第56-57页 |
| 2.甘南牦牛 CAPN3 基因多态性较丰富 | 第57-58页 |
| 3.CAPN3 基因第 2 内含子突变影响部分甘南牦牛胴体及肉质性状 | 第58-60页 |
| 第五章 结论 | 第60-61页 |
| 参考文献 | 第61-71页 |
| 附录 | 第71-72页 |
| 致谢 | 第72-74页 |
| 作者简介 | 第74-75页 |
| 导师简介 | 第75-76页 |
