| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 引言 | 第7-9页 |
| 1 理论基础 | 第9-25页 |
| ·分子结构 | 第9-13页 |
| ·构象 | 第9-11页 |
| ·丙氨酸三肽分子结构 | 第11-13页 |
| ·高斯优化及频率计算 | 第13-15页 |
| ·分子力场 | 第15-19页 |
| ·密度泛函理论及 ABEEMσπ/MM 方法 | 第19-25页 |
| ·密度泛函理论 | 第19-20页 |
| ·ABEEMσπ/MM 方法 | 第20-25页 |
| 2 以丙氨酸三肽分子为例用从头算方法和 ABEEMσπ/MM 探究不同氨基酸三肽分子稳定构象 | 第25-41页 |
| ·从头算方法 | 第25-31页 |
| ·确定丙氨酸二肽稳定构象的方法 | 第25-26页 |
| ·扫描寻找丙氨酸三肽稳定构象 | 第26-28页 |
| ·优化丙氨酸三肽分子不同构象 | 第28-30页 |
| ·优化不同氨基酸三肽分子稳定构象 | 第30-31页 |
| ·用 ABEEMσπ/MM 优化得到丙氨酸三肽分子不同稳定构象和其它氨基酸三肽分子稳定构象 | 第31-41页 |
| ·丙氨酸三肽分子不同稳定构象 | 第31-34页 |
| ·优化得到其它不同氨基酸三肽分子稳定构象 | 第34-36页 |
| ·计算不同氨基酸三肽分子总能量 | 第36-41页 |
| 结论 | 第41-42页 |
| 参考文献 | 第42-46页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第46-47页 |
| 致谢 | 第47页 |