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梨资源ISSR分析与花芽休眠解除研究

摘要第1-11页
Abstract第11-13页
第一章 前言第13-21页
 1.本研究的意义第13-14页
 2.ISSR分子标记的研究进展第14页
 3.蔷薇科植物花芽休眠解除的需冷量研究进展第14-19页
   ·需冷量概念第14页
   ·需冷量的计算方式第14-15页
     ·冷温单位(chillingunit,C.U)第14页
     ·≤7.2℃模式和0~7.2℃模式第14-15页
     ·动力学模型(dynamicmodel)第15页
   ·蔷薇科植物花芽休眠解除的研究进展第15-19页
     ·蔷薇科植物花芽休眠解除与低温的研究进展第15页
     ·蔷薇科不同植物花芽休眠解除低温需求的研究进展第15-17页
       ·桃树花芽休眠解除的低温需求第15-16页
       ·苹果树花芽休眠解除的低温需求第16页
       ·梨树花芽休眠解除的低温需求第16-17页
       ·杏树花芽休眠解除的低温需求第17页
     ·蔷薇科植物花芽休眠解除的其它可能机制第17-19页
       ·休眠解除与激素的关系第17-18页
       ·休眠解除的相关分子机理第18-19页
 4.本研究的技术路线第19-21页
   ·38份梨花品种基于ISSR聚类结果的低需冷量特性分析第19-20页
   ·梨花芽休眠差减文库的构建及相关基因的分离第20-21页
     ·正向文库第20页
     ·反向文库第20-21页
第二章 38份梨花品种基于ISSR聚类结果的需冷量特性分析第21-37页
 1 实验材料第21-23页
   ·供试材料第21-22页
   ·实验主要仪器、试剂第22-23页
     ·主要仪器第22页
     ·主要试剂第22-23页
   ·分析处理软件第23页
 2 实验方法第23-26页
   ·实验所需药品配制方法第23页
   ·供试材料DNA的提取方法第23-24页
   ·DNA质量的检测方法第24页
   ·ISSR体系的优化方法第24-25页
   ·引物筛选及PCR扩增第25页
   ·ISSR-PCR聚类结果分析方法第25-26页
 3 结果与分析第26-35页
   ·DNA模板的提取结果与分析第26页
   ·ISSR-PCR体系优化的结果与分析第26-32页
     ·适宜模板DNA用量的确定第26-27页
     ·引物浓度的确定第27页
     ·dNTP浓度的确定第27-28页
     ·TaqDNA聚合酶用量的确定第28-29页
     ·Mg~(2+)浓度的确定第29-30页
     ·退火温度的确定第30页
     ·反应循环数的确定第30-31页
     ·最佳反应体系和退火温度的验证第31-32页
   ·引物筛选结果第32-33页
   ·ISSR多态性分析第33页
   ·遗传相似性系数分析第33-34页
   ·ISSR聚类结果与低需冷量关系的分析第34-35页
 4 讨论第35-37页
   ·梨基因组DNA提取的讨论第35页
   ·影响ISSR-PCR反应的因素分析第35-37页
     ·模板DNA的用量的讨论第36页
     ·Mg~(2+)浓度的讨论第36页
     ·TaqDNA聚合酶用量的讨论第36页
     ·dNTP和引物浓度的讨论第36页
     ·PCR反应循环数的讨论第36-37页
     ·退火温度范围的讨论第37页
   ·ISSR聚类结果与低需冷量之间的讨论第37页
第三章 梨花芽休眠解除差减文库的构建第37-60页
 1 材料第37-39页
   ·实验样品第37页
   ·石蜡切片相关材料和试剂第37-38页
     ·实验器具第37-38页
     ·实验药品及其配制第38页
   ·差减文库相关材料和试剂第38-39页
     ·实验试剂第38页
     ·实验所需药品的配制第38-39页
     ·实验所用器材第39页
 2 实验方法第39-45页
   ·实验样品处理方法第39页
     ·实验样品的采集方法第39页
     ·实验样品的处理方法第39页
   ·石蜡切片制作方法第39-40页
     ·材料的固定第39页
     ·脱水第39-40页
     ·透明第40页
     ·浸蜡与包埋第40页
     ·切片第40页
     ·贴片与干片第40页
     ·材料的脱蜡,染色,脱水,透明及封片第40页
     ·镜鉴观察拍照第40页
   ·单链差减文库(DSN-mediatedsinglestrandscDNAsubtraction)的构建方法第40-45页
     ·RNA的提取方法(CTAB-Trizol法)28第40-41页
     ·Tester的制备(正向记为ZT,反向记为FT)29第41页
     ·Driver(正向记为ZD,反向记为FD)的制备(正、反向各两管)第41-42页
     ·Tester与Driver的杂交第42页
     ·杂交产物的DSN处理第42页
     ·第一轮LA-PCR扩增第42-43页
     ·第二轮LA-PCR扩增第43页
     ·第三轮LA-PCR扩增第43页
     ·蛋白酶K处理和纯化第43-44页
     ·扩增产物的sfiⅠ酶切及切胶半透膜回收第44页
     ·酶切产物与定向克隆的连接第44页
     ·连接产物的电转化第44页
     ·插入片段大小的检测第44页
     ·DSN-mediatedsinglestrandscDNAsubtraction的测序及EST分析第44页
     ·QRT-PCR检测文库质量第44-45页
       ·材料第44页
       ·主要试剂与仪器第44页
       ·引物设计第44-45页
       ·RNA的提取第45页
       ·cDNA第一链的合成及实时PCR操作方法第45页
       ·相对表达量计算方法第45页
 3 结果与分析第45-57页
   ·样品处理过程结果分析第45页
   ·石蜡切片结果分析第45-46页
   ·差减文库结果分析第46-57页
     ·总RNA质量的检测第46-47页
     ·Tester和Driver的检测第47-48页
     ·DSN梯度筛选第48页
     ·第一轮LA-PCR扩增第48页
     ·第二轮LA-PCR扩增第48-49页
     ·第三轮LA-PCR扩增第49-50页
     ·PCR产物的酶切透析回收第50页
     ·酶切产物的克隆及插入片段的PCR检测第50-51页
     ·花芽休眠解除正、反向差减文库(PZ,PF)相关EST测序及分析第51-55页
     ·生物信息学分析第55-56页
     ·文库质量检测结果及分析第56-57页
 4 讨论第57-60页
   ·石蜡切片第57-58页
   ·差减文库的构建第58-60页
     ·梨花芽总RNA的提取第58页
     ·Tester与Driver的制备第58页
     ·DSN技术与LA-PCR结合保证差异基因的筛选和富集第58页
     ·梨花芽休眠解除相关基因分析第58-60页
参考文献第60-64页
附录第64-83页
 附录1:哥伦比亚大学(UBC)公布的100条ISSR引物序列及其最适解链温度第64-66页
 附录2:不同引物的扩增结果第66-76页
 附录3:不同时期黄花梨花芽采样情况第76页
 附录4:花芽采集与处理过程第76-77页
 附录5:正、反向差减文库EST序列结果与Phytozome植物基因组学数据库的苹果基因组进行比对第77-83页
致谢第83-84页

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