摘要 | 第1-6页 |
Abstract | 第6-12页 |
第一章 前言 | 第12-26页 |
1 盐碱地土壤微生物多样性研究目的和意义 | 第12-14页 |
·盐碱地土壤微生物研究的背景 | 第12-13页 |
·盐碱地土壤微生物多样性研究目的 | 第13页 |
·盐碱地土壤微生物多样性研究的意义 | 第13-14页 |
2 盐碱环境微生物多样性研究现状(国内外) | 第14-16页 |
·国外盐碱环境微生物多样性的研究 | 第14页 |
·国内盐碱环境微生物多样性的研究 | 第14-16页 |
3 土壤微生物多样性国内外研究方法 | 第16-24页 |
·生物或化学方法 | 第17-18页 |
·直接观察法((microscopy) | 第17页 |
·纯培养法(culture-dependent methods) | 第17页 |
·Biolog微平板分析 | 第17页 |
·磷脂脂肪酸(phospholipid fatty acid,PLFA)谱图分析 | 第17-18页 |
·分子生物学方法 | 第18-22页 |
·基于分子杂交技术的分子标记法 | 第18-19页 |
·基于PCR技术扩增16S rDNA的分子生物学技术 | 第19-22页 |
·现代微生物多样性研究策略——传统方法和分子生物学方法相并论 | 第22-24页 |
4 研究内容和技术路线 | 第24-26页 |
第二章 新疆盐碱地土壤细菌的多样性分析 | 第26-51页 |
1 材料与方法 | 第26-37页 |
·样品的采集 | 第26-29页 |
·实验方法 | 第29-37页 |
·土壤样品理化指标的测定 | 第29-30页 |
·样品基因组总DNA的提取和PCR扩增 | 第30-31页 |
·土壤样品总DNA的16S rDNAV3区的扩增 | 第31-32页 |
·变形梯度凝胶电泳(DGGE)分析 | 第32-34页 |
·DGGE电泳图谱分析 | 第34页 |
·DGGE优势条带切胶测序分析 | 第34-37页 |
·土样中微生物多样性与环境因子的相关性分析 | 第37页 |
2 结果与分析 | 第37-49页 |
·样品理化性质结果分析 | 第37-38页 |
·土壤样品总DNA提取分光光度计检测浓度结果 | 第38-39页 |
·土样样品16S rDNAV3区的检测结果 | 第39-40页 |
·DGGE指纹图谱分析 | 第40-42页 |
·部分细菌优势条带的序列比对分析结果 | 第42-48页 |
·土样中微生物群落结构与理化性质的相关性分析 | 第48-49页 |
3 结论与讨论 | 第49-51页 |
第三章 新疆盐碱地可培养细菌的多样性研究以及利用DGGE方法评价各个培养基回收土壤细菌的能力 | 第51-66页 |
1 实验材料 | 第51页 |
2 实验方法 | 第51-54页 |
·培养基的设计和配制 | 第51-52页 |
·菌株分离 | 第52页 |
·菌株的形态观察 | 第52页 |
·菌株的纯化和保藏 | 第52页 |
·收集平板上所有的菌落 | 第52-53页 |
·菌株DNA的提取 | 第53-54页 |
·DGGE分析平板上总菌落的16S rDNA的V3区 | 第54页 |
·菌株16S rDNA的扩增 | 第54页 |
·菌株16S rDNA的测序 | 第54页 |
3 实验结果 | 第54-63页 |
·盐碱地土壤样品培养物的纯化和保藏 | 第54页 |
·部分菌株的形态特征 | 第54-56页 |
·DGGE评价不同培养基回收细菌类群的能力 | 第56-58页 |
·可培养菌株16S rDNA测序以及系统发育研究 | 第58-63页 |
4 结论与讨论 | 第63-66页 |
第四章 疑似新种的多相分类鉴定 | 第66-92页 |
1 实验材料 | 第66页 |
2 实验验方法 | 第66-77页 |
·形态鉴定 | 第66-67页 |
·革兰氏染色 | 第66页 |
·电镜观察 | 第66-67页 |
·生理生化鉴定 | 第67-71页 |
·耐盐性试验 | 第67页 |
·生长温度的测定 | 第67页 |
·耐pH值的测定 | 第67页 |
·硝酸盐还原的测定 | 第67-68页 |
·产H2S试验 | 第68页 |
·酪素水解试验(酪蛋白水解) | 第68页 |
·明胶水解试验 | 第68-69页 |
·尿酶测定 | 第69页 |
·酪氨酸水解 | 第69页 |
·柠檬酸利用 | 第69页 |
·淀粉水解 | 第69-70页 |
·酯酶(Tween 80) | 第70页 |
·卵磷脂酶 | 第70页 |
·接触酶 | 第70页 |
·吲哚 | 第70-71页 |
·七叶苷水解 | 第71页 |
·含碳化合物的利用 | 第71页 |
·核酸特征测定 | 第71-72页 |
·G+C%含量的测定 | 第71-72页 |
·细胞化学组分分析 | 第72-77页 |
·脂肪酸测定 | 第72-74页 |
·磷脂的测定 | 第74-77页 |
3 实验结果 | 第77-89页 |
·菌株49(GIMN1.030)的多相分类 | 第77-80页 |
·菌株分离和培养 | 第77页 |
·形态和生理生化描述 | 第77-78页 |
·菌株49(GIMN1.030)G+C含量和系统发育分析 | 第78-80页 |
·菌株79(GIMN1.028)的多相分类 | 第80-82页 |
·菌株分离和培养 | 第80页 |
·形态生理生化和其它化学特征的描述 | 第80-81页 |
·实验菌株79(GIMN1.028)的G+C含量和系统发育分析 | 第81-82页 |
·细胞化学分类特征 | 第82页 |
·菌株133(GIMN1.031)的多相分类 | 第82-84页 |
·菌株的分离和培养 | 第82页 |
·形态生理生化和其它化学特征的描述 | 第82-83页 |
·实验菌株133(GIMN1.031)的G+C含量、系统发育分析 | 第83-84页 |
·细胞化学分类特征 | 第84页 |
·菌株251(GIMN1.032)的多相分类 | 第84-87页 |
·菌株的分离和培养 | 第84页 |
·形态生理生化和其它化学特征的描述 | 第84-86页 |
·实验菌株251(GIMN1.032)的G+C含量和系统发育分析 | 第86-87页 |
·细胞化学分类特性 | 第87页 |
·菌株261(GIMN1.029)的多相分类 | 第87-89页 |
·菌株的分离和培养 | 第87页 |
·形态生理生化和其它化学特征的描述 | 第87-88页 |
·实验菌株261(GIMN1.029)的G+C含量和系统发育分析 | 第88-89页 |
·细胞化学分类特性 | 第89页 |
4 结论与讨论 | 第89-92页 |
参考文献 | 第92-99页 |
致谢 | 第99-100页 |
附录 | 第100页 |