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新疆阿克苏地区盐碱地土壤细菌多样性及菌株的分离鉴定

摘要第1-6页
Abstract第6-12页
第一章 前言第12-26页
 1 盐碱地土壤微生物多样性研究目的和意义第12-14页
   ·盐碱地土壤微生物研究的背景第12-13页
   ·盐碱地土壤微生物多样性研究目的第13页
   ·盐碱地土壤微生物多样性研究的意义第13-14页
 2 盐碱环境微生物多样性研究现状(国内外)第14-16页
   ·国外盐碱环境微生物多样性的研究第14页
   ·国内盐碱环境微生物多样性的研究第14-16页
 3 土壤微生物多样性国内外研究方法第16-24页
   ·生物或化学方法第17-18页
     ·直接观察法((microscopy)第17页
     ·纯培养法(culture-dependent methods)第17页
     ·Biolog微平板分析第17页
     ·磷脂脂肪酸(phospholipid fatty acid,PLFA)谱图分析第17-18页
   ·分子生物学方法第18-22页
     ·基于分子杂交技术的分子标记法第18-19页
     ·基于PCR技术扩增16S rDNA的分子生物学技术第19-22页
   ·现代微生物多样性研究策略——传统方法和分子生物学方法相并论第22-24页
 4 研究内容和技术路线第24-26页
第二章 新疆盐碱地土壤细菌的多样性分析第26-51页
 1 材料与方法第26-37页
   ·样品的采集第26-29页
   ·实验方法第29-37页
     ·土壤样品理化指标的测定第29-30页
     ·样品基因组总DNA的提取和PCR扩增第30-31页
     ·土壤样品总DNA的16S rDNAV3区的扩增第31-32页
     ·变形梯度凝胶电泳(DGGE)分析第32-34页
     ·DGGE电泳图谱分析第34页
     ·DGGE优势条带切胶测序分析第34-37页
     ·土样中微生物多样性与环境因子的相关性分析第37页
 2 结果与分析第37-49页
   ·样品理化性质结果分析第37-38页
   ·土壤样品总DNA提取分光光度计检测浓度结果第38-39页
   ·土样样品16S rDNAV3区的检测结果第39-40页
   ·DGGE指纹图谱分析第40-42页
   ·部分细菌优势条带的序列比对分析结果第42-48页
   ·土样中微生物群落结构与理化性质的相关性分析第48-49页
 3 结论与讨论第49-51页
第三章 新疆盐碱地可培养细菌的多样性研究以及利用DGGE方法评价各个培养基回收土壤细菌的能力第51-66页
 1 实验材料第51页
 2 实验方法第51-54页
   ·培养基的设计和配制第51-52页
   ·菌株分离第52页
   ·菌株的形态观察第52页
   ·菌株的纯化和保藏第52页
   ·收集平板上所有的菌落第52-53页
   ·菌株DNA的提取第53-54页
   ·DGGE分析平板上总菌落的16S rDNA的V3区第54页
   ·菌株16S rDNA的扩增第54页
   ·菌株16S rDNA的测序第54页
 3 实验结果第54-63页
   ·盐碱地土壤样品培养物的纯化和保藏第54页
   ·部分菌株的形态特征第54-56页
   ·DGGE评价不同培养基回收细菌类群的能力第56-58页
   ·可培养菌株16S rDNA测序以及系统发育研究第58-63页
 4 结论与讨论第63-66页
第四章 疑似新种的多相分类鉴定第66-92页
 1 实验材料第66页
 2 实验验方法第66-77页
   ·形态鉴定第66-67页
     ·革兰氏染色第66页
     ·电镜观察第66-67页
   ·生理生化鉴定第67-71页
     ·耐盐性试验第67页
     ·生长温度的测定第67页
     ·耐pH值的测定第67页
     ·硝酸盐还原的测定第67-68页
     ·产H2S试验第68页
     ·酪素水解试验(酪蛋白水解)第68页
     ·明胶水解试验第68-69页
     ·尿酶测定第69页
     ·酪氨酸水解第69页
     ·柠檬酸利用第69页
     ·淀粉水解第69-70页
     ·酯酶(Tween 80)第70页
     ·卵磷脂酶第70页
     ·接触酶第70页
     ·吲哚第70-71页
     ·七叶苷水解第71页
     ·含碳化合物的利用第71页
   ·核酸特征测定第71-72页
     ·G+C%含量的测定第71-72页
   ·细胞化学组分分析第72-77页
     ·脂肪酸测定第72-74页
     ·磷脂的测定第74-77页
 3 实验结果第77-89页
   ·菌株49(GIMN1.030)的多相分类第77-80页
     ·菌株分离和培养第77页
     ·形态和生理生化描述第77-78页
     ·菌株49(GIMN1.030)G+C含量和系统发育分析第78-80页
   ·菌株79(GIMN1.028)的多相分类第80-82页
     ·菌株分离和培养第80页
     ·形态生理生化和其它化学特征的描述第80-81页
     ·实验菌株79(GIMN1.028)的G+C含量和系统发育分析第81-82页
     ·细胞化学分类特征第82页
   ·菌株133(GIMN1.031)的多相分类第82-84页
     ·菌株的分离和培养第82页
     ·形态生理生化和其它化学特征的描述第82-83页
     ·实验菌株133(GIMN1.031)的G+C含量、系统发育分析第83-84页
     ·细胞化学分类特征第84页
   ·菌株251(GIMN1.032)的多相分类第84-87页
     ·菌株的分离和培养第84页
     ·形态生理生化和其它化学特征的描述第84-86页
     ·实验菌株251(GIMN1.032)的G+C含量和系统发育分析第86-87页
     ·细胞化学分类特性第87页
   ·菌株261(GIMN1.029)的多相分类第87-89页
     ·菌株的分离和培养第87页
     ·形态生理生化和其它化学特征的描述第87-88页
     ·实验菌株261(GIMN1.029)的G+C含量和系统发育分析第88-89页
     ·细胞化学分类特性第89页
 4 结论与讨论第89-92页
参考文献第92-99页
致谢第99-100页
附录第100页

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