| 摘要 | 第1-10页 |
| ABSTRACT | 第10-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-32页 |
| ·引言 | 第12-13页 |
| ·外耳的结构、功能和发育 | 第13-16页 |
| ·外耳功能、结构与外耳缺陷简介 | 第13-15页 |
| ·外耳的形成和发育 | 第15-16页 |
| ·外耳相关性状的遗传学研究进展 | 第16-23页 |
| ·外耳相关性状的QTL定位研究进展 | 第16-19页 |
| ·外耳相关性状候选基因的研究进展 | 第19-23页 |
| ·家猪数量性状主效基因(QTG)鉴别 | 第23-31页 |
| ·家猪数量性状主效基因鉴别的经典策略 | 第23-28页 |
| ·家猪数量性状主效基因鉴别的新策略 | 第28-31页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第31-32页 |
| ·本研究的目的 | 第31页 |
| ·本研究的意义 | 第31-32页 |
| 第二章 基于微卫星标记的猪5号染色体耳面积QTL精细定位 | 第32-40页 |
| ·引言 | 第32页 |
| ·材料与方法 | 第32-35页 |
| ·实验动物 | 第32页 |
| ·表型测定 | 第32-33页 |
| ·微卫星标记基因型检测 | 第33-35页 |
| ·统计方法 | 第35页 |
| ·结果 | 第35-38页 |
| ·资源群体耳面积表型分布 | 第35页 |
| ·微卫星标记基因型检测结果 | 第35-37页 |
| ·SSC5上微卫星标记的遗传图谱 | 第37页 |
| ·SSC5耳面积QTL精细定位结果 | 第37-38页 |
| ·分析与讨论 | 第38-39页 |
| ·小结 | 第39-40页 |
| 第三章 候选基因HMGA2、SOX5、PTHLH与耳面积的关联性研究 | 第40-60页 |
| ·引言 | 第40页 |
| ·材料与方法 | 第40-51页 |
| ·实验动物 | 第40页 |
| ·耳面积的测定 | 第40-41页 |
| ·耳组织总RNA的提取及逆转录 | 第41页 |
| ·位置候选基因的选择与耳组织表达谱分析 | 第41-42页 |
| ·HMGA2、SOX5和PTHLH三个基因多态位点的鉴别 | 第42-48页 |
| ·三个基因7个SNP位点的分型 | 第48-50页 |
| ·统计分析 | 第50-51页 |
| ·结果 | 第51-57页 |
| ·耳面积表型分析结果 | 第51页 |
| ·三个位置候选基因在耳组织中的表达分析结果 | 第51-52页 |
| ·HMGA2、SOX5和PTHLH三个基因多态位点鉴别结果 | 第52页 |
| ·三个基因7个SNP位点分型结果 | 第52-54页 |
| ·在F2资源家系中候选基因SNP位点与耳面积的标准关联分析、标记辅助关联和F-drop分析结果 | 第54-55页 |
| ·候选基因单倍型与耳面积大小的关联性分析 | 第55-56页 |
| ·在3个商业合成系中HMGA2基因g.2836 A>G位点与耳面积的关联性 | 第56-57页 |
| ·分析与讨论 | 第57-58页 |
| ·小结 | 第58-60页 |
| 第四章 利用全基因组高通量SNP标记精细定位猪5号染色体耳面积QTL | 第60-75页 |
| ·引言 | 第60页 |
| ·材料与方法 | 第60-63页 |
| ·实验动物 | 第60页 |
| ·表型测定 | 第60-61页 |
| ·全基因组60K SNP芯片扫描 | 第61页 |
| ·精细定位后QTL置信区间内所有基因在耳组织中的表达分析 | 第61-62页 |
| ·统计分析 | 第62-63页 |
| ·结果 | 第63-71页 |
| ·耳面积表型分析结果 | 第63-64页 |
| ·全基因组60K SNP基因分型结果 | 第64页 |
| ·全基因组关联分析结果 | 第64-71页 |
| ·分析与讨论 | 第71-74页 |
| ·全基因组关联分析讨论 | 第71-72页 |
| ·全基因组LDLA分析讨论 | 第72页 |
| ·全基因组连锁分析和F_0个体QTL区域单倍型分析讨论 | 第72-73页 |
| ·位置候选基因的表达分析讨论 | 第73-74页 |
| ·小结 | 第74-75页 |
| 第五章 在苏太猪群体中利用191个SNP标记精细定位猪5号染色体耳面积QTL | 第75-86页 |
| ·引言 | 第75页 |
| ·材料与方法 | 第75-78页 |
| ·实验动物 | 第75页 |
| ·耳面积的测定 | 第75-76页 |
| ·SNP鉴别与选择 | 第76页 |
| ·SNP分型分析 | 第76-78页 |
| ·统计分析 | 第78页 |
| ·结果 | 第78-83页 |
| ·苏太猪群体耳面积表型统计分析结果 | 第78-79页 |
| ·192个SNP分型结果 | 第79-80页 |
| ·SNP与耳面积的关联分析结果 | 第80-83页 |
| ·分析与讨论 | 第83-85页 |
| ·小结 | 第85-86页 |
| 全文总结与展望 | 第86-87页 |
| 参考文献 | 第87-96页 |
| 附录1 HMGA2基因组部分序列 | 第96-103页 |
| 附录2 SOX5基因组部分序列 | 第103-115页 |
| 附录3 PTHLH基因组部分序列 | 第115-120页 |
| 附录4 作者简历 | 第120-121页 |
| 附录5 博士研究生学习期间发表论文情况 | 第121-122页 |
| 致谢 | 第122-123页 |
