| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第8-33页 |
| 1 引言 | 第8页 |
| 2 小肠的生理学功能 | 第8-16页 |
| ·小肠的结构与功能 | 第8-11页 |
| ·小肠的运动形式及调节 | 第11-12页 |
| ·小肠的分泌功能 | 第12-14页 |
| ·小肠的免疫功能 | 第14-15页 |
| ·小肠的吸收功能 | 第15-16页 |
| 3 小肠长度及其与生产性状的相关性 | 第16-18页 |
| ·小肠长度值及其分布 | 第16-17页 |
| ·小肠长度与体长的相关性 | 第17-18页 |
| ·小肠长度与日增重显著相关 | 第18页 |
| 4 影响小肠长度的因素 | 第18-21页 |
| ·饲养管理因素 | 第18-20页 |
| ·遗传因素 | 第20-21页 |
| 5 数量性状位点(QTL)定位的概况与发展趋势 | 第21-30页 |
| ·经典的QTL定位 | 第21-23页 |
| ·QTL的精细定位 | 第23-26页 |
| ·增加标记密度 | 第23-24页 |
| ·增加样本含量,获得更多的重组个体 | 第24页 |
| ·连锁不平衡分析和连锁分析结合分析(LDLA) | 第24-25页 |
| ·后裔同源定位分析(IBD) | 第25页 |
| ·选择性清除效应(selective sweep)分析 | 第25-26页 |
| ·QTG的鉴别 | 第26-28页 |
| ·功能候选基因的选择与表达分析 | 第26-27页 |
| ·系统生物学分析(eQTL/QTT/Network) | 第27-28页 |
| ·QTN的鉴别 | 第28页 |
| ·从QTL到QTN的经典范例 | 第28-30页 |
| 6 猪小肠长度QTL定位的研究进展 | 第30-32页 |
| 7 本研究的目的和意义 | 第32-33页 |
| 第二章 利用基因组扫描在白色杜洛克X二花脸F_2资源家系群体中定位影响小肠长度的QTL | 第33-43页 |
| 摘要 | 第33-34页 |
| ABSTRACT | 第34页 |
| 1 引言 | 第34-35页 |
| 2 材料和方法 | 第35-36页 |
| ·实验动物和表型测量 | 第35页 |
| ·微卫星基因型判定 | 第35页 |
| ·统计分析 | 第35-36页 |
| 3 结果与讨论 | 第36-43页 |
| 第三章 利用全基因组关联分析在白色杜洛克×二花脸资源群体中精细定位影响猪小肠长度的数量性状位点 | 第43-58页 |
| 摘要 | 第43-44页 |
| Abstract | 第44-45页 |
| 1 引言 | 第45-46页 |
| 2 材料与方法 | 第46-48页 |
| ·实验动物与表型测定 | 第46页 |
| ·基因型的测定 | 第46-47页 |
| ·SNP芯片数据质量控制 | 第47页 |
| ·全基因组关联分析模型 | 第47-48页 |
| ·生物信息学分析及位置候选基因鉴别 | 第48页 |
| 3 结果与讨论 | 第48-57页 |
| ·SNP芯片数据的质量控制 | 第48-51页 |
| ·SNP检出率 | 第48页 |
| ·哈迪-温伯格检验 | 第48-50页 |
| ·次等位基因频率 | 第50页 |
| ·孟德尔错误率 | 第50-51页 |
| ·性别重检验 | 第51页 |
| ·全基因组关联分析定位结果 | 第51页 |
| ·位置候选基因的分析 | 第51-56页 |
| ·小肠长度和生长性状之间的关系 | 第56-57页 |
| 4 结论 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-65页 |
| 致谢 | 第65-66页 |
| 附录一 | 第66-70页 |
| 附录二 | 第70-71页 |
