猪骨骼肌发育相关基因的差异表达和多态性研究
| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-17页 |
| 第一部分 肌肉发育相关基因的鉴定分析 | 第17-58页 |
| 第一章 文献综述 | 第17-26页 |
| ·细胞外基质 | 第17-19页 |
| ·糖蛋白类 | 第17-18页 |
| ·葡萄糖胺聚糖和蛋白胺聚糖 | 第18页 |
| ·胶原蛋白 | 第18-19页 |
| ·细胞外基质与肌肉生长发育 | 第19-20页 |
| ·不同猪种间的肌肉生长发育 | 第20-21页 |
| ·cDNA 微芯片技术 | 第21-24页 |
| ·研究目的和意义 | 第24-26页 |
| 第二章 材料与方法 | 第26-34页 |
| ·实验材料 | 第26-29页 |
| ·实验动物 | 第26页 |
| ·cDNA 芯片 | 第26页 |
| ·常规试剂和试剂盒 | 第26-27页 |
| ·实验试剂及其配制 | 第27-28页 |
| ·主要仪器及设备 | 第28页 |
| ·分析工具及网站 | 第28-29页 |
| ·方法 | 第29-34页 |
| ·总RNA 提取 | 第29页 |
| ·变性琼脂糖凝胶电泳 | 第29-30页 |
| ·cDNA 合成 | 第30页 |
| ·芯片实验 | 第30-32页 |
| ·QPCR 及数据分析 | 第32-33页 |
| ·聚类分析 | 第33页 |
| ·差异表达基因的GO 和PATHWAY 分析 | 第33-34页 |
| 第三章 结果与分析 | 第34-53页 |
| ·RNA 提取 | 第34-35页 |
| ·QPCR 实验 | 第35-36页 |
| ·芯片杂交 | 第36-37页 |
| ·芯片结果 | 第37-39页 |
| ·芯片结果验证 | 第39-41页 |
| ·聚类分析 | 第41页 |
| ·差异表达基因的 GO 和 PATHWAY 分析 | 第41-50页 |
| ·不同品种间的差异表达基因分析 | 第50页 |
| ·ECMs 和 CAMs 基因动态表达 | 第50-53页 |
| 第四章 讨论 | 第53-57页 |
| ·差异表达基因的 GO 和 PATHWAY 分析 | 第53页 |
| ·三个品种间的差异表达基因 | 第53-55页 |
| ·差异表达基因的分类 | 第53-54页 |
| ·差异表达基因的分布 | 第54-55页 |
| ·基因表达模式分析 | 第55-57页 |
| 第五章 结论 | 第57-58页 |
| 第二部分 MSTN 基因多态性分析 | 第58-89页 |
| 第一章 文献综述 | 第58-70页 |
| ·MSTN 研究进展 | 第58-66页 |
| ·MSTN 基因结构和功能 | 第58-62页 |
| ·MSTN 活性调控 | 第62-64页 |
| ·MSTN 与细胞 | 第64-65页 |
| ·MSTN 信号途径 | 第65-66页 |
| ·MSTN 的应用 | 第66页 |
| ·分子遗传标记 | 第66-68页 |
| ·限制性片段多态性 | 第67页 |
| ·微卫星标记 | 第67-68页 |
| ·单核苷酸多态性 | 第68页 |
| ·SNP 检测方法 | 第68-70页 |
| ·未知SNP 检测方法 | 第68-69页 |
| ·已知SNP 检测方法 | 第69-70页 |
| 第二章 材料与方法 | 第70-77页 |
| ·实验材料 | 第70-72页 |
| ·实验动物 | 第70页 |
| ·菌株和载体 | 第70页 |
| ·常规试剂和试剂盒 | 第70页 |
| ·实验试剂及配制 | 第70-71页 |
| ·主要仪器与设备 | 第71页 |
| ·分析工具及网站 | 第71-72页 |
| ·方法 | 第72-77页 |
| ·基因组DNA 提取 | 第72页 |
| ·PCR 反应 | 第72-73页 |
| ·PCR 产物的回收纯化 | 第73页 |
| ·连接反应 | 第73页 |
| ·转化 | 第73页 |
| ·阳性克隆鉴定 | 第73-74页 |
| ·测序验证 | 第74页 |
| ·MALDI-TOF-MS 法 SNP 分型 | 第74-76页 |
| ·数据分析 | 第76-77页 |
| 第三章 结果与分析 | 第77-86页 |
| ·基因组提取 | 第77页 |
| ·引物的设计 | 第77-78页 |
| ·SNPs 位点筛选 | 第78-79页 |
| ·突变前后转录因子结合位点的预测 | 第79-81页 |
| ·质谱法 SNP 分型 | 第81-82页 |
| ·多态位点的关联性分析 | 第82-86页 |
| ·生长性状统计 | 第82页 |
| ·等位基因频率和基因型频率 | 第82-83页 |
| ·多态位点不同基因型与体重的关系分析 | 第83-86页 |
| 第四章 讨论 | 第86-88页 |
| ·MSTN 基因 SNPs 的筛选 | 第86页 |
| ·转录因子结合位点的预测 | 第86页 |
| ·猪 MSTN 基因多态性与体重的关联性分析 | 第86-88页 |
| 第五章 结论 | 第88-89页 |
| 参考文献 | 第89-100页 |
| 附录 | 第100-104页 |
| 致谢 | 第104-105页 |
| 个人简历 | 第105页 |
