| 中文摘要 | 第1-11页 |
| ABSTRACT | 第11-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-32页 |
| 第一节:基因组学研究的主要内容和方法 | 第13-19页 |
| 1.基因组学的定义及其内容 | 第13-14页 |
| 2.结构基因组学研究的主要内容和方法 | 第14-16页 |
| ·遗传图谱 | 第14-15页 |
| ·物理图谱 | 第15-16页 |
| ·基因组测序 | 第16页 |
| 3 功能基因组学研究的主要内容和方法 | 第16-19页 |
| ·基因的功能、表达及调控研究 | 第17-18页 |
| ·蛋白质功能及蛋白质的相互作用研究 | 第18-19页 |
| 第二节:基因组细菌人工染色体(BAC)文库研究概述 | 第19-23页 |
| 1.BAC文库及其载体的发展 | 第19-20页 |
| 2.基因组BAC文库构建中的几个关键问题 | 第20-23页 |
| ·高分子量DNA(HMW DNA)的制备 | 第20-21页 |
| ·适宜DNA片段的获得 | 第21-22页 |
| ·DNA片段的回收方式 | 第22页 |
| ·电转化参数的确定 | 第22页 |
| ·嵌合体检测——FISH or not? | 第22-23页 |
| 3 基因组BAC文库的应用 | 第23页 |
| 第三节 主要组织相容性复合体(MHC)研究概述 | 第23-32页 |
| 1.MHC的组织分布、结构和功能 | 第24-27页 |
| ·MHC Ⅰ类分子的组织分布、结构和功能 | 第25-26页 |
| ·MHC Ⅱ类分子的组织分布、结构和功能 | 第26-27页 |
| ·MHC Ⅲ类分子的结构和功能 | 第27页 |
| 2.MHC的起源和进化 | 第27-28页 |
| 3.MHC多态性及其维持机制 | 第28-30页 |
| 4.MHC在保护生物学中的应用 | 第30-32页 |
| 第二章 论文的立论依据、研究内容和目的 | 第32-33页 |
| 第三章 大熊猫基因组BAC文库构建 | 第33-55页 |
| 第一节 材料和方法 | 第33-47页 |
| 1.材料 | 第33-35页 |
| ·样品来源 | 第33页 |
| ·BAC载体和大肠杆菌菌株 | 第33-34页 |
| ·主要仪器设备 | 第34页 |
| ·主要试剂和耗材 | 第34-35页 |
| 2.方法和步骤 | 第35-47页 |
| ·高分子量DNA(HWM DNA)的制备 | 第35-36页 |
| ·预电泳 | 第36-37页 |
| ·高分子量DNA的不完全酶切 | 第37页 |
| ·适宜DNA片段的选择 | 第37-39页 |
| ·DNA片段的回收 | 第39-40页 |
| ·DNA连接 | 第40页 |
| ·确定适宜的电转化参数 | 第40-42页 |
| ·BAC克隆挑取及保存 | 第42页 |
| ·大熊猫BAC文库的检测和鉴定 | 第42-47页 |
| 第二节 结果和讨论 | 第47-53页 |
| 1.大熊猫基因组BAC文库的特征 | 第47-49页 |
| 2.大熊猫BAC文库的PCR筛选 | 第49-51页 |
| 3.BAC克隆稳定性检测结果 | 第51页 |
| 4.大熊猫基因组BAC文库构建中的几个关键问题 | 第51-53页 |
| ·片段选择与平均插入片段的关系 | 第51-52页 |
| ·DNA回收方式的选择 | 第52页 |
| ·电转化参数与插入片段大小的关系 | 第52-53页 |
| ·基因组BAC文库的筛选 | 第53页 |
| 第三节 结论 | 第53-55页 |
| 第四章 大熊猫主要组织相容性复合体(MHC)基因的染色体定位 | 第55-66页 |
| 第一节 材料和方法 | 第56-61页 |
| 1.材料 | 第56-57页 |
| ·样品来源 | 第56页 |
| ·BAC克隆 | 第56页 |
| ·主要仪器设备 | 第56-57页 |
| ·主要试剂和耗材 | 第57页 |
| 2.实验方法和步骤 | 第57-61页 |
| ·大熊猫成纤维细胞中期染色体制备 | 第57-58页 |
| ·BAC克隆的筛选及BAC DNA的制备 | 第58页 |
| ·阳性BAC克隆的验证 | 第58-59页 |
| ·荧光探针BAC DNA的标记及纯化 | 第59-60页 |
| ·探针与中期染色体的杂交 | 第60页 |
| ·杂交后处理 | 第60-61页 |
| ·镜检及图象处理 | 第61页 |
| 第二节 结果和讨论 | 第61-64页 |
| 第三节 结论 | 第64-66页 |
| 第五章 大熊猫Ⅱ类MHC基因组的物理图谱构建 | 第66-82页 |
| 第一节 材料和方法 | 第67-76页 |
| 1.材料 | 第67-68页 |
| ·材料来源 | 第67页 |
| ·引物设计 | 第67页 |
| ·主要仪器设备 | 第67-68页 |
| ·主要试剂和耗材 | 第68页 |
| 2.方法及步骤 | 第68-76页 |
| ·BAC文库的筛选 | 第68页 |
| ·PCR产物转化 | 第68-69页 |
| ·PCR产物测序 | 第69-73页 |
| ·BAC克隆随机鸟枪法测序(shotgun sequencing) | 第73-74页 |
| ·BAC末端测序 | 第74-75页 |
| ·序列分析 | 第75页 |
| ·大熊猫Ⅱ类MHC基因组物理图谱(BAC contig)组装 | 第75页 |
| ·限制性酶切指纹图谱(DNA Fingerprinting) | 第75-76页 |
| 第二节 结果和讨论 | 第76-80页 |
| 第三节 结论 | 第80-82页 |
| 第六章 主要成果及创新点 | 第82-83页 |
| 一 主要成果 | 第82页 |
| 二 创新点 | 第82-83页 |
| 参考文献 | 第83-103页 |
| 附录 攻读博士学位论文期间发表论文 | 第103-104页 |
| 致谢 | 第104-107页 |
