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13C标记技术测定zwf敲除E.coli厌氧中心代谢通量的初步研究

中文摘要第1-4页
ABSTRACT第4-8页
前言第8-9页
第一章 文献综述第9-20页
   ·~(13)C标记测定代谢通量技术产生的背景第9-11页
   ·MFA的发展历程第11-12页
   ·~(13)C 标记实验的原理与方法第12-15页
   ·~(13)C标记实验的测试平台第15-18页
     ·核磁共振测试平台简介第15-17页
     ·质谱测试平台简介第17-18页
   ·~(13)C标记实验数据处理方法第18-19页
   ·本实验研究的主要任务第19-20页
第二章 底物标记策略及最小测定代谢物组的确定第20-29页
   ·底物标记策略的选择第20-22页
     ·标记策略的种类划分第20页
     ·单标记和全标记对网络通量分辨的差异比较第20-22页
   ·最小测定代谢物组的确定第22-29页
     ·各个代谢物基本解NMR谱分辨率的比较第22-24页
     ·各个代谢物组合通量解析能力的比较第24-27页
     ·各个代谢物组合经济因素的考虑第27-29页
第三章 恒化实验及NMR样品制备第29-37页
   ·zwf基因敲除大肠杆菌的恒化培养第29-35页
     ·实验仪器及设备第29页
     ·实验药品及试剂的配制第29-31页
     ·菌种的活化和摇瓶培养第31-32页
     ·发酵罐恒化操作、培养参数及OD值走势第32-33页
     ·发酵罐恒化操作的结果与讨论第33-35页
   ·~(13)C标记过程及NMR样品制备第35-37页
第四章 2D NMR谱图的解析及网络通量的计算第37-63页
   ·2D NMR谱图的获得第38-39页
   ·用NUTs做实验2D NMR谱图分析第39-44页
   ·同位素分布向量(IDV)的基本概念第44-45页
   ·最小测定代谢物组IDV的计算第45-50页
     ·α-酮戊二酸IDV的计算第45-48页
     ·草酰乙酸IDV的计算第48-50页
   ·生物质组成和能量需求的测定第50页
   ·胞外代谢通量的测定第50页
   ·天然存在的同位素对实验结果的影响及消除第50-51页
   ·同位素作图矩阵(IMM)的计算第51-54页
     ·原子作图矩阵(AMM)的基本概念第51-53页
     ·原子作图矩阵(AMM)的计算第53页
     ·同位素作图矩阵(IMM)的基本概念第53-54页
     ·同位素作图矩阵(IMM)的计算第54页
   ·混合整数线性规划(MILP)计算通量解空间的所有基本解第54-58页
   ·采用非线性优化计算中心代谢网络通量第58-63页
     ·GAMS平台的介绍第58页
     ·GAMS程序编写第58-61页
     ·非线性优化计算中心代谢通量分布的结果第61-63页
第五章 结论与展望第63-64页
参考文献第64-69页
致谢第69-70页
附录第70-78页

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