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苏云金芽胞杆菌菌株YBT-1520中Zwittermicin A的生物合成调控研究

摘要第1-10页
ABSTRACT第10-12页
缩略语表第12-14页
1 前言第14-35页
   ·ZmA的性质第14-18页
     ·ZmA的发现第14页
     ·ZmA的生物活性第14-17页
       ·ZmA的抑菌活性第14-15页
       ·ZmA对苏云金芽胞杆菌杀虫晶体蛋白的增效活性第15-16页
       ·ZmA的作用机理第16-17页
     ·ZmA的产生菌第17-18页
   ·抗生素的合成第18-23页
     ·抗生素的类别和作用方式第18-19页
     ·抗生素的合成途径第19-23页
       ·聚酮合成酶途径第19-20页
       ·非核糖体肽合成酶途径第20页
       ·聚酮合成酶-非核糖体肽合成酶杂合途径第20-23页
   ·ZmA生物合成研究基础第23-33页
     ·ZmA抗性基因zmaR第23-25页
       ·zmaR的克隆第23-24页
       ·另外一种抗性机制的存在第24-25页
     ·ZmA生物合成相关的16kb DNA序列第25-26页
     ·ZmA生物合成相关的62.5kb基因簇第26-27页
     ·ZmA的生物合成途径第27-33页
       ·ZmA生物合成所需的前体物及前体物的合成第27-29页
       ·ZmA生物合成基因簇中的PKS模块第29页
       ·ZmA生物合成基因簇中的NRPS模块第29-30页
       ·ZmA的组装合成和修饰第30-33页
   ·本研究的目的与意义第33-35页
     ·ZmA产生菌的产量达不到规模化生产的要求第33页
     ·ZmA的生物合成基因簇与合成途径未经证实第33页
     ·ZmA产生菌对ZmA的自我抗性机制不完善第33页
     ·探索克隆、鉴定DNA大片段功能基因簇新的方法第33-35页
2 材料与方法第35-48页
   ·实验材料第35-40页
     ·菌株、质粒和引物第35-39页
     ·培养基第39页
     ·试剂第39-40页
     ·仪器第40页
   ·实验方法第40-48页
     ·DNA常规操作第40-42页
       ·质粒的提取与纯化第40-41页
       ·DNA体外重组操作第41页
       ·大肠杆菌CaCl_2感受态的制备及转化第41页
       ·苏云金芽胞杆菌/蜡状芽胞杆菌的电转化第41-42页
     ·菌株YBT-1520细菌人工染色体文库的构建第42-44页
       ·外源DNA片段的制备第42-43页
       ·细菌人工染色体载体的制备第43页
       ·大肠杆菌DH10B电转化感受态细胞的制备第43页
       ·连接与转化第43-44页
       ·文库的筛选与保存第44页
     ·荧光定量PCR第44页
     ·晶体蛋白表达的检测第44-45页
       ·SDS-PAGE样品的制备第44页
       ·SDS-PAGE检测第44-45页
     ·ZmA的纯化与检测第45-46页
       ·ZmA的初步纯化第45页
       ·ZmA的HPLC检测与HPLC制备柱纯化第45-46页
       ·ZmA的抑菌活性和产量检测第46页
       ·ZmA的飞行时间质谱检测第46页
     ·ZmA敏感性检测第46页
     ·乙酰化ZmA分子的胞内质谱检测第46-47页
     ·序列分析第47-48页
       ·DNA的测序与序列分析第47页
       ·蛋白序列的分析第47-48页
3 结果和分析第48-76页
   ·苏云金芽胞杆菌菌株YBT-1520基因组BAC文库的构建第48页
   ·覆盖ZmA合成基因簇的重叠联合群的建立第48-50页
   ·序列分析揭示潜在的完整的ZmA合成基因簇第50-53页
     ·推测可转座的72 Kb区域第50页
     ·ORF123推测为潜在的调控蛋白第50-51页
     ·zmaWXY推测为ZmA的抗性基因第51-53页
   ·大片段功能基因簇异源表达平台的建立第53-64页
     ·穿梭载体pEMB0603及pEMB0606的构建第54-56页
     ·pEMB0603、pEMB0606及pEMB0557的性质第56-58页
       ·pEMB0603,pEMB0606及pEMB0557的转化效率和稳定性第56页
       ·pEMB0603,pEMB0606及pEMB0557在BMB171中的拷贝数第56-58页
     ·pEMB0603、pEMB0606及pEMB0557的应用第58-63页
       ·pEMB0603和pEMB0606对DNA大片段的克隆能力第58-60页
       ·pEMB0603和pEMB0606对克隆基因的表达能力第60-62页
       ·pEMB0603、pEMB0606和pEMB0557在BMB171中的兼容性第62-63页
     ·pEMB0603、pEMB0606及pEMB0557的宿主广泛性第63-64页
   ·异源表达确定ZmA合成功能基因簇第64-67页
   ·zmaWXY是ZmA的抗性基因第67-70页
     ·zmaWXY可以给BMB171带来对ZmA的抗性表型第67-69页
     ·zmaWXY可以增加ZmA的产量第69-70页
   ·ZmaWXY阻止ZmA进入胞内第70-74页
   ·ORF123是ZmA合成潜在的负调控蛋白第74-76页
4. 讨论第76-81页
   ·大片段功能基因簇研究平台的建立第76页
   ·完整ZmA合成基因簇的展示和验证第76-77页
   ·ZmA产生菌对ZmA完整的抗性免疫模式第77-79页
   ·ZmA合成的调控第79页
   ·利用组合生物合成对ZmA进行改造第79-81页
参考文献第81-91页
致谢第91-92页
附录A 本研究所用工具载体的物理图谱第92-93页
附录B 已发表和待发表论文第93页

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