| 中文摘要 | 第1-5页 |
| 英文摘要 | 第5-8页 |
| 缩略语表 | 第8-12页 |
| 第一章 寄生桡足类与系统发育 | 第12-30页 |
| 1. 分类地位 | 第12-14页 |
| ·鳋科的形态特征及分类地位 | 第13页 |
| ·锚头鳋科的形态特征及分类地位 | 第13-14页 |
| 2. 影响寄生桡足类感染和物种形成的主要因素 | 第14-15页 |
| ·环境因素 | 第14页 |
| ·宿主因素 | 第14-15页 |
| 3. 寄生桡足类对宿主的影响 | 第15-16页 |
| 4. 寄生桡足类在宿主种群的分布 | 第16页 |
| 5. 寄生虫与宿主的协同进化 | 第16-22页 |
| ·协同进化的几种主要事件 | 第16-19页 |
| ·研究协同进化的方法 | 第19-20页 |
| ·寄生虫物种形成的理论与假说 | 第20-22页 |
| 6. 系统发育 | 第22-28页 |
| ·基本概念 | 第22页 |
| ·系统发育与分子系统学 | 第22-23页 |
| ·DNA 标记在分子系统学中的应用 | 第23-25页 |
| ·系统发育推断方法 | 第25-28页 |
| 7. 本研究的目的 | 第28-30页 |
| 第二章 马口鱼和宽鳍鱲鳃上发现的寄生桡足类鳋属一新种，丹江鳋（杯口水蚤目：鳋科) | 第30-44页 |
| 1. 前言 | 第30页 |
| 2. 材料与方法 | 第30-33页 |
| ·样品的收集与形态观察 | 第30-31页 |
| ·基因组DNA 的提取 | 第31-32页 |
| ·PCR 产物扩增与纯化 | 第31-32页 |
| ·PCR 产物连接、转化和测序 | 第32页 |
| ·序列分析 | 第32-33页 |
| 3. 结果 | 第33-41页 |
| ·形态学观察及种的鉴定 | 第33-34页 |
| ·序列特征分析 | 第34-38页 |
| ·系统发育分析 | 第38-41页 |
| 4. 讨论 | 第41-44页 |
| 第三章 以ITS序列探讨中华鳋属种类的系统进化及物种形成机制 | 第44-74页 |
| 1. 前言 | 第44-45页 |
| 2. 材料和方法 | 第45-49页 |
| ·样品的收集和基因组DNA 的提取 | 第45页 |
| ·PCR 产物扩增与纯化 | 第45-46页 |
| ·PCR 产物的连接、转化和测序 | 第46页 |
| ·序列分析和系统发育树的构建 | 第46-49页 |
| 3. 结果 | 第49-69页 |
| ·来自9种不同宿主的中华鳋ITS 序列分析 | 第49页 |
| ·同一湖泊中3种中华鳋种群的ITS序列分析 | 第49-54页 |
| ·系统发育分析 | 第54-69页 |
| ·来自9种不同宿主的中华鳋系统发育分析 | 第54-55页 |
| ·同一湖泊中3 种中华鳋的系统发育 | 第55页 |
| ·中华鳋与宿主的协同进化 | 第55-69页 |
| 4. 讨论 | 第69-74页 |
| ·中华鳋属的系统进化 | 第69-70页 |
| ·中华鳋的物种形成及与其宿主的协同进化 | 第70-74页 |
| 第四章 鳋科（桡足亚纲：杯口水蚤目）和锚头鳋科（桡足亚纲：剑水蚤目）的系统发育及与自由生活桡足类之间的系统发育 | 第74-102页 |
| 1. 前言 | 第74-78页 |
| 2. 材料和方法 | 第78-81页 |
| ·样品的采集与基因组DNA 的提取 | 第78页 |
| ·PCR 产物的扩增、纯化及测序 | 第78-81页 |
| 3. 系统发育分析 | 第81-84页 |
| 4. 结果 | 第84-91页 |
| ·序列变异分析 | 第84页 |
| ·数据中包含的系统发育信息分析 | 第84-87页 |
| ·以部分185rDNA序列为标记对鳋科和锚头鳋科的分析 | 第87-88页 |
| ·以部分285rDNA序列为标记对鳋科和锚头鳋科的分析 | 第88-89页 |
| ·以185-285rDNA 为标记对鳋科和锚头鳋科的分析 | 第89页 |
| ·Kishino-Hasegawa 检验鳋属的单系性 | 第89-90页 |
| ·以部分185 rDNA 序列为标记建立寄生桡足类和自由生活桡足类之间的系统发育关系 | 第90-91页 |
| 5. 讨论 | 第91-102页 |
| ·鳋科的单系性 | 第91-93页 |
| ·锚头鳋科的单系性 | 第93页 |
| ·寄生桡足类和自由生活桡足类的系统发育关系 | 第93-102页 |
| 参考文献 | 第102-114页 |
| 攻读博士学位期间论文情况 | 第114-115页 |
| 致谢 | 第115页 |
