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基于ESTs的蛇毒腺和家猪脑组织基因表达研究以及噬菌体EH3-23P1全基因组序列分析

摘要第1-7页
Abstract第7-10页
缩略词第10-11页
第一章 表达序列标签研究综述第11-16页
   ·EST简介第11-12页
   ·EST技术的应用第12-13页
     ·EST与基因组物理图谱的构建第12页
     ·EST与 SNP第12页
     ·EST与选择性剪接分析第12-13页
     ·EST与系统进化分析第13页
   ·EST与其他技术的比较第13-14页
   ·蛇毒腺组织基因表达研究意义第14页
   ·家猪基因表达序列标签研究现状和意义第14-16页
第二章 五步蛇毒腺表达序列标签分析第16-41页
   ·摘要第16页
   ·引言第16页
   ·材料与方法第16-17页
     ·材料第16页
     ·文库构建及测序第16-17页
     ·序列分析第17页
   ·五步蛇毒腺组织 ESTs结果与分析第17-39页
     ·五步蛇毒腺组织 ESTs概貌第17-21页
     ·蛋白质处理和分泌相关的ESTs第21-29页
     ·细胞结构组分以及能量代谢相关的基因第29-30页
     ·生理代谢相关的酶类基因表达第30-33页
     ·其他功能相关的基因第33-34页
     ·和已知序列没有显著同源性的基因第34-35页
     ·五步蛇毒腺基因表达的比较分析第35页
     ·五步蛇毒素相关基因的系统进化分析第35-39页
   ·讨论与结论第39-41页
     ·蛇毒腺基因表达的特殊性和复杂性第39页
     ·毒素基因的起源与进化第39-41页
第三章 家猪脑组织基因表达序列标签分析第41-49页
   ·摘要第41页
   ·引言第41页
   ·材料和方法第41-42页
     ·组织收集第41-42页
     ·cDNA文库构建、测序和序列分析第42页
     ·显著性差异统计检验第42页
   ·结果与分析第42-48页
     ·cDNA文库和 ESTs聚类概貌第42-43页
     ·基因识别和注释第43-45页
     ·编码多肽类激素的基因第45-46页
     ·家猪脑组织表达基因分类第46页
     ·不同发育阶段差异表达的基因第46-48页
   ·讨论和结论第48-49页
第四章 噬菌体基因组研究文献综述第49-65页
   ·引言第49-50页
   ·噬菌体的多样性第50-51页
   ·溶源性噬菌体第51-53页
   ·裂解性噬菌体 T4全基因组介绍第53-56页
   ·海洋噬菌体基因组概貌第56-59页
   ·噬菌体比较基因组学研究第59-61页
   ·噬菌体基因组进化第61-63页
   ·噬菌体治疗第63-65页
第五章 噬菌体 EH3-23P1基因组测序、外壳蛋白分析及比较研究第65-90页
   ·摘要第65页
   ·引言第65页
   ·材料和方法第65-76页
     ·噬菌体基因组 DNA的提取第65-67页
     ·噬菌体基因组的酶切第67-68页
     ·噬菌体基因组shotgun文库的构建第68-72页
     ·噬菌体全基因组测序第72-73页
     ·酶切验证第73页
     ·全基因组序列生物信息学分析第73-74页
     ·外壳蛋白提取及双向电泳和质谱第74-76页
   ·噬菌体 EH3-23P1全基因组测序结果和序列分析第76-85页
     ·形态学特征及宿主菌属第76-77页
     ·全基因组序列概况第77-78页
     ·基因识别第78-82页
     ·噬菌体基因组 DNA复制重组和包装第82页
     ·核苷酸代谢第82页
     ·磷酸代谢补偿基因phoH第82-83页
     ·噬菌体外壳及尾部基因第83页
     ·tRNA基因及密码子使用第83-84页
     ·外壳蛋白2-D胶分离和质谱分析第84-85页
   ·讨论与结论第85-90页
     ·噬菌体 EH3-23P1全基因组总结第85页
     ·全基因组镶嵌性特点第85-88页
     ·海洋噬菌体基因组测序引发的思考第88-90页
致谢第90-92页
参考文献第92-103页
附录 发表论文第103页

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