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植物病害分子监测技术研究

摘要第1-12页
Abstract第12-15页
第一章 绪论第15-21页
 1.植物病害第15页
  1.1 植物病害概念第15页
  1.2 真菌病害第15页
 2.植物病原菌的诊断技术第15-21页
  2.1 植物病原菌的田间传统诊断第15-16页
  2.2 植物病害免疫诊断第16页
  2.3 植物病害的分子诊断第16-21页
   2.3.1 聚合酶链式反应(PCR)技术的应用第16-20页
   2.3.2 限制性片断长度多态性(RFLP)分析第20-21页
第二章 病原真菌基因组DNA提取方法优化第21-26页
 前言第21页
 1.材料与方法第21-23页
  1.1 菌种第21页
  1.2 病原菌培养第21页
  1.3 病菌菌丝预处理第21-22页
  1.4 DNA提取方法第22-23页
   1.4.1 尿素提取法第22页
   1.4.2 CTAB提取法第22页
   1.4.3 氯化苄提取法第22-23页
   1.4.4 SDS-CTAB提取法第23页
  1.5 DNA的电泳分析及含量测定第23页
 2.结果与分析第23-25页
  2.1 4种方法提取步骤比较第23页
  2.2 4种方法提取DNA纯度和效率比较第23-25页
  2.3 琼脂糖凝胶电泳检测第25页
 3.讨论第25-26页
第三章 病原真菌rDNA的ITS序列的扩增与测定第26-38页
 前言第26页
 1.材料与方法第26-27页
  1.1 病原菌第26页
  1.2 病原菌基因组DNA第26页
  1.3 通用引物第26页
  1.4 真菌核糖体基因转录间隔区(ITS)的PCR扩增第26-27页
 2.PCR扩增片段的连接与转化第27-30页
  2.1 PCR产物的回收纯化第27页
  2.2 连接反应第27-28页
   2.2.1 连接反应使用的载体系统第27页
   2.2.2 连接反应体系和条件第27-28页
  2.3 转化反应第28-29页
   2.3.1 氯化钙法制备感受态细胞第28-29页
   2.3.2 转化反应第29页
  2.4 重组质粒的筛选第29页
   2.4.1 细菌培养物的生长和收获第29页
  2.5 质粒提取和酶切鉴定第29-30页
   2.5.1 质粒的提取第29-30页
   2.5.2 酶切鉴定第30页
 3.扩增片断的序列分析第30-31页
 4.Blastn序列比对第31页
 5.结果与分析第31-37页
  5.1 植物病原真菌ITS区域的PCR扩增第31页
  5.2 重组质粒筛选第31-32页
  5.3 重组质粒的酶切鉴定第32页
  5.4 菌株rDNA的ITS区域DNA序列测定第32-34页
   5.4.1 西瓜蔓枯病菌第32-33页
   5.4.2 西瓜炭疽病菌第33页
   5.4.3 西瓜枯萎病菌第33页
   5.4.4 草莓炭疽病菌第33-34页
   5.4.5 番茄灰霉病菌第34页
  5.5 数据库中Blast网上比对结果第34-37页
   5.5.1 西瓜蔓枯病菌第34-35页
   5.5.2 西瓜炭疽病菌第35页
   5.5.3 西瓜枯萎病菌第35-36页
   5.5.4 草莓炭疽病菌第36页
   5.5.5 番茄灰霉病菌第36-37页
 6.讨论第37-38页
第四章 特异性引物的设计第38-52页
 前言第38页
 1.试验材料与方法第38-41页
  1.1 病原菌及其近缘种、相关种的ITS序列第38页
  1.2 序列比对软件第38页
  1.3 引物设计软件第38页
  1.4 特异性引物设计第38-41页
   1.4.1 引物设计的原则第38-39页
   1.4.2 应用Primer Premier 5.0对引物进行分析第39-41页
 2 结果与分析第41-50页
  2.1 西瓜蔓枯病菌第41-44页
   2.1.1 近缘种间比对结果第41-42页
   2.1.2 同一寄主上不同病原菌间同源性比对第42页
   2.1.3 西瓜蔓枯病菌特异性引物设计第42-44页
  2.2 西瓜炭疽病菌第44-46页
   2.2.1 近缘种间ITS同源性比较第44页
   2.2.2 同一寄主上不同病原菌间同源性比对第44-45页
   2.2.3 引物的设计第45-46页
  2.3.西瓜枯萎病菌第46-47页
   2.3.1 近缘种间ITS同源性比对第46页
   2.3.2 同一寄主上不同病原菌间同源性比对第46页
   2.3.3 引物的设计第46-47页
  2.4 草莓炭疽病菌第47-48页
   2.4.1 近缘种间ITS同源性比第47-48页
   2.4.2 引物的设计第48页
  2.5 番茄灰霉病菌第48-50页
   2.5.1 近缘种间ITS同源性比对第48-49页
   2.5.2 同一寄主上不同病原菌间同源性比对第49页
   2.5.3 引物的设计第49-50页
 3 讨论第50-52页
第五章 引物的特异性与灵敏度检测第52-62页
 前言第52页
 1.材料与方法第52-53页
  1.1 目标病菌、对照病菌的基因组DN第52页
  1.2 寄主植物基因组DNA第52页
  1.3 引物第52页
  1.4 引物特异性的检验第52-53页
  1.5 PCR反应灵敏度检测第53页
 2.结果与分析第53-61页
  2.1 引物的特异性第53-58页
   2.1.1 西瓜蔓枯病菌第53-54页
   2.1.2 西瓜炭疽病菌第54-55页
   2.1.3 西瓜枯萎病菌第55-56页
   2.1.4 草莓炭疽病菌第56-57页
   2.1.5 番茄灰霉病菌第57-58页
  2.2 PCR扩增的灵敏度第58-61页
   2.2.1 西瓜蔓枯病菌引物XM-2灵敏度测定第58-59页
   2.2.2 西瓜炭疽病菌引物XT-3灵敏度测定第59页
   2.2.3 西瓜枯萎病菌引物XK-1灵敏度测定第59-60页
   2.2.4 草莓炭疽病菌引物CT-1灵敏度测定第60页
   2.2.5 番茄灰霉病菌引物B01-3灵敏度测定第60-61页
 3.讨论第61-62页
第六章 田间病样的检测第62-65页
 前言第62页
 1.疑似病原的采集和处理第62页
  1.1 病样的采集第62页
  1.2 样品的处理第62页
 2.病样中西瓜蔓枯病菌的检测第62页
 3.结果与分析第62-64页
 4.讨论第64-65页
第七章 全文小结第65-66页
附录Ⅰ 主要实验溶液及培养基第66-69页
附录Ⅱ 硕士期间发表的论文第69-70页
参考文献第70-75页
致谢第75页

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