| 中文摘要 | 第1-10页 |
| 第一部分： 文献综述 | 第10-52页 |
| 综述一 EST的概念、特点和用途 | 第10-36页 |
| 1 EST研究现状 | 第10-13页 |
| 2 EST的概念和特点 | 第13-14页 |
| 3 EST的用途 | 第14-36页 |
| 3．1 构建物理图谱和遗传图谱时标记的选择与EST | 第14-25页 |
| 3．2 组织特异表达谱的构建与EST | 第25-28页 |
| 3．3 新基因发现与EST | 第28-31页 |
| 3．4 比较图谱和比较基因组研究与EST | 第31-33页 |
| 3．5 索引和基因数量的估计与EST | 第33-35页 |
| 3．6 功能基因组研究与EST | 第35-36页 |
| 综述二 EST产生的策略和方法 | 第36-47页 |
| 1 cDNA文库的构建及文库质量的鉴定 | 第36-40页 |
| 1．1 cDNA文库的构建 | 第36-38页 |
| 1．2 文库的质量鉴定和参数评估 | 第38-39页 |
| 1．3 文库质量的问题及解决办法 | 第39-40页 |
| 2 自动DNA测序与大规模EST序列测定 | 第40-43页 |
| 2．1 自动DNA测序原理及分析方法 | 第40-42页 |
| 2．2 大规模DNA测序 | 第42-43页 |
| 3 生物信息学与EST序列数据整理 | 第43-47页 |
| 3．1 公共数据库 | 第44-45页 |
| 3．2 EST序列的同源性比较 | 第45-47页 |
| 综述三 畜禽基因组计划 | 第47-52页 |
| 1 动物基因组计划的特点 | 第48-49页 |
| 1．1 参考家系的建立 | 第48页 |
| 1．2 资源家系的利用 | 第48页 |
| 1．3 DNA标记辅助选择 | 第48-49页 |
| 1．4 动物基因组克隆技术 | 第49页 |
| 2 畜禽EST研究现状 | 第49页 |
| 3 动物基因组计划对传统育种的影响 | 第49-51页 |
| 4 EST研究展望 | 第51-52页 |
| 第二部分： 研究内容 | 第52-117页 |
| 鸡下丘脑组织cDNA文库的构建 | 第52-60页 |
| 1 材料与方法 | 第52-57页 |
| 1．1 材料 | 第52页 |
| 1．2 方法 | 第52-57页 |
| 2 结 果 | 第57-58页 |
| 2．1 总RNA提取和mRNA的分离 | 第57页 |
| 2．2 双链cDNA的合成 | 第57-58页 |
| 2．3 cDNA的克隆 | 第58页 |
| 2．4 文库滴度的测定 | 第58页 |
| 2．5 文库插入片段大小检测 | 第58页 |
| 3 讨 论 | 第58-60页 |
| 鸡下丘脑组织表达序列标签的测定与分析 | 第60-80页 |
| 1 材料与方法 | 第60-66页 |
| 1．1 材料 | 第60-61页 |
| 1．2 方法 | 第61-66页 |
| 2 结 果 | 第66-76页 |
| 2．1 测序模板的制备 | 第66-67页 |
| 2．2 序列测定结果 | 第67-69页 |
| 2．3 EST序列同源性分析 | 第69-71页 |
| 2．4 已知功能基因分类和表达谱 | 第71-73页 |
| 2．5 已知EST和未知EST序列蛋白质ORF预测 | 第73-76页 |
| 3 讨 论 | 第76-80页 |
| 3．1 测序模板/载体的选择 | 第76页 |
| 3．2 鸡下丘脑组织EST序列同源分析 | 第76-77页 |
| 3．3 已知功能基因分类和表达谱 | 第77-78页 |
| 3．4 已知EST和未知EST的蛋白质阅读框分析 | 第78-80页 |
| 猪脂肪组织表达序列标签的测定与分析 | 第80-117页 |
| 1 材料与方法 | 第81-87页 |
| 1．1 材料 | 第81页 |
| 1．2 方法 | 第81-87页 |
| 2 结 果 | 第87-103页 |
| 2．1 文库质量检测 | 第87页 |
| 2．2 大规模EST序列测定结果 | 第87-89页 |
| 2．3 6494条EST序列Blastn结果 | 第89-90页 |
| 2．4 猪脂肪组织表达谱的构建 | 第90-95页 |
| 2．5 已知EST和未知EST序列蛋白阅读框分析 | 第95-97页 |
| 2．6 6494条EST序列聚类分析 | 第97-98页 |
| 2．7 已知功能基因和已知EST标签序列位点（STS）数据库比较 | 第98-99页 |
| 2．8 家猪、人类、牛和小鼠的种系发生分析 | 第99-102页 |
| 2．9 从EST序列中筛选SNPs | 第102-103页 |
| 3 讨 论 | 第103-117页 |
| 3．1 文库质量检测 | 第103-104页 |
| 3．2 大规模EST序列测定 | 第104-106页 |
| 3．3 大规模序列测定和数据库同源性比较 | 第106-107页 |
| 3．4 猪脂肪组织基因表达谱的构建 | 第107-108页 |
| 3．5 蛋白质阅读框的预测与EST研究 | 第108-109页 |
| 3．6 连续重叠群与EST的聚类 | 第109-111页 |
| 3．7 EST与STS | 第111-112页 |
| 3．8 EST序列在物种种系发生分析中应用 | 第112-115页 |
| 3．9 EST与SNP | 第115-117页 |
| 结 论 | 第117-118页 |
| 参考文献 | 第118-126页 |
| 致 谢 | 第126-127页 |
| CURRICULUM VITAE | 第127-128页 |
| 英文摘要 | 第128-130页 |
| 附 录 | 第130-141页 |
