| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-14页 |
| 第1章 引言 | 第14-22页 |
| ·生物信息学概况 | 第14-16页 |
| ·生物信息学 | 第14-15页 |
| ·生物信息学与生物统计学 | 第15页 |
| ·生物信息学与机器学习 | 第15-16页 |
| ·人类RNA POL Ⅱ启动子识别问题 | 第16-17页 |
| ·课题的来源及意义 | 第17-19页 |
| ·课题的来源 | 第17-18页 |
| ·课题的理论意义和实际研究价值 | 第18-19页 |
| ·论文的主要内容 | 第19-22页 |
| 第2章 启动子及启动子识别 | 第22-34页 |
| ·生物学知识基础 | 第22-26页 |
| ·核酸的化学组成 | 第22-23页 |
| ·DNA的分子结构 | 第23页 |
| ·基因 | 第23-24页 |
| ·真核生物的基因结构特征 | 第24-25页 |
| ·基因结构复杂性的认识过程 | 第25-26页 |
| ·基因识别 | 第26页 |
| ·启动子 | 第26-28页 |
| ·启动子识别问题 | 第28页 |
| ·启动子数据库 | 第28-29页 |
| ·启动子识别的研究方法 | 第29-32页 |
| ·基于统计学习理论的支持向量机(SVM) | 第32-34页 |
| 第3章 实验数据选取及结果评价方法 | 第34-38页 |
| ·实验数据的来源 | 第34-35页 |
| ·EPD数据库 | 第34页 |
| ·转录起始位点数据库(DBTSS) | 第34-35页 |
| ·GenBank数据库 | 第35页 |
| ·实验数据分析及预处理 | 第35-36页 |
| ·启动子数据 | 第35页 |
| ·非启动子数据 | 第35-36页 |
| ·结果评价方法 | 第36-38页 |
| 第4章 启动子数据编码研究 | 第38-52页 |
| ·CpG编码方法识别启动子数据 | 第38-40页 |
| ·编码方法 | 第38-39页 |
| ·5-fold交叉验证检验及识别结果 | 第39页 |
| ·10-fold交叉验证检验及识别结果 | 第39-40页 |
| ·五联体(Pentamers)编码方法识别启动子数据 | 第40-43页 |
| ·β值编码方法 | 第40-41页 |
| ·lmp(X)值编码方法 | 第41-42页 |
| ·5-fold交叉验证检验及识别结果 | 第42-43页 |
| ·10-fold交叉验证检验及识别结果 | 第43页 |
| ·基于知识的统计特征编码方法识别启动子数据 | 第43-48页 |
| ·编码方法 | 第43-47页 |
| ·5-fold交叉验证检验及识别结果 | 第47-48页 |
| ·10-fold交叉验证检验及识别结果 | 第48页 |
| ·Pattern Dictionary编码方法识别启动子数据 | 第48-52页 |
| ·编码方法 | 第49-50页 |
| ·识别结果 | 第50页 |
| ·扩展双联体Pattern Dictionary编码及识别结果 | 第50-52页 |
| 第5章 双层SVM识别启动子 | 第52-57页 |
| ·共识模型思想 | 第52页 |
| ·双层SVM的应用 | 第52-54页 |
| ·变量参数的选择 | 第53-54页 |
| ·预报结果及讨论 | 第54-57页 |
| ·基于知识的统计编码方法的双层SVM结果 | 第54-55页 |
| ·基于生物学意义的编码方法进入双层SVM计算 | 第55-57页 |
| 第6章 识别方法在人类22号染色体启动子识别中的应用 | 第57-63页 |
| ·人类染色体启动子识别计算数据的获得及处理 | 第57-58页 |
| ·启动子数据 | 第57页 |
| ·非启动子数据集 | 第57-58页 |
| ·编码方法在人类22号染色体启动子识别中的应用 | 第58页 |
| ·双层SVM在人类22号染色体启动子识别中的应用 | 第58-59页 |
| ·人类22号染色体启动子识别结果分析 | 第59-63页 |
| 第7章 结论与展望 | 第63-66页 |
| 致谢 | 第66-67页 |
| 参考文献 | 第67-72页 |
| 个人简历 在读期间发表的学术论文与研究成果 | 第72页 |
