高通量基因测序图像处理与数据分析
| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-13页 |
| 第一章 绪论 | 第13-33页 |
| ·基因测序技术的发展 | 第13-25页 |
| ·毛细管电泳测序技术 | 第13-16页 |
| ·高通量测序技术 | 第16-24页 |
| ·单分子测序技术 | 第24-25页 |
| ·高通量测序技术的应用前景 | 第25-26页 |
| ·研究目的及意义 | 第26-27页 |
| ·研究基础 | 第27-30页 |
| ·主要研究内容 | 第30-31页 |
| ·创新点 | 第31-32页 |
| ·论文章节安排 | 第32-33页 |
| 第二章 高通量基因测序图像预处理 | 第33-49页 |
| ·高通量图片的采集 | 第33-38页 |
| ·测序图像统计分析 | 第38-40页 |
| ·图像预处理的小波分析方法 | 第40-45页 |
| ·傅立叶变换与小波变换 | 第40-42页 |
| ·图像的小波分解与重构 | 第42-44页 |
| ·图像的小波去噪与锐化 | 第44-45页 |
| ·实验分析 | 第45-48页 |
| ·基本实验 | 第45-46页 |
| ·高通量测序原始图像预处理实验 | 第46页 |
| ·结果分析 | 第46-48页 |
| ·本章小结 | 第48-49页 |
| 第三章 荧光强度和噪声的估计 | 第49-63页 |
| ·水平集分割方法 | 第49-53页 |
| ·水平集分割方法原理 | 第49-51页 |
| ·水平集分割方法研究内容 | 第51-53页 |
| ·图像信息熵 | 第53-54页 |
| ·改进的水平集C-V模型分割方法 | 第54-57页 |
| ·C-V模型 | 第54-56页 |
| ·图像信息熵的引入 | 第56-57页 |
| ·分割实验 | 第57-59页 |
| ·单目标分割实验 | 第57-58页 |
| ·测序图像分割实验 | 第58-59页 |
| ·荧光强度的计算与噪声估计 | 第59-62页 |
| ·碱基簇判别与荧光强度的计算 | 第59-61页 |
| ·噪声估计 | 第61-62页 |
| ·本章小结 | 第62-63页 |
| 第四章 基于相关分析的碱基荧光基团信号解耦 | 第63-85页 |
| ·四色荧光DNA测序信号重叠情况 | 第63-75页 |
| ·高通量荧光基团分布 | 第64-67页 |
| ·碱基荧光基团强度分布分析 | 第67-75页 |
| ·碱基荧光基团信号解耦的原理 | 第75-76页 |
| ·交叉影响矩阵的构造 | 第76-81页 |
| ·相关分析方法 | 第77-79页 |
| ·交叉影响矩阵的校正 | 第79-81页 |
| ·实验分析 | 第81-83页 |
| ·本章小结 | 第83-85页 |
| 第五章 碱基相位校正 | 第85-96页 |
| ·相位问题 | 第85-86页 |
| ·相位校正的数学原理 | 第86-87页 |
| ·相位校正的概率矩阵的构造 | 第87-92页 |
| ·相位“超前”和“延迟”问题数据统计 | 第87-88页 |
| ·回归分析方法 | 第88-90页 |
| ·Markov过程 | 第90-92页 |
| ·实验分析 | 第92-94页 |
| ·本章小结 | 第94-96页 |
| 第六章 碱基位识别与质量评估 | 第96-104页 |
| ·碱基位识别 | 第96页 |
| ·荧光噪声分析 | 第96-100页 |
| ·碱基概率的最大似然估计 | 第100页 |
| ·碱基位信噪比和质量计算 | 第100-102页 |
| ·碱基位信噪比 | 第101页 |
| ·蒙特卡洛抽样法 | 第101-102页 |
| ·碱基位质量值 | 第102页 |
| ·本章小结 | 第102-104页 |
| 结论 | 第104-108页 |
| 参考文献 | 第108-128页 |
| 攻读博士学位期间取得的研究成果 | 第128-130页 |
| 致谢 | 第130-131页 |
