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软枣猕猴桃(Actinidia arguta)性别相关分子标记的开发及应用

摘要第6-7页
abstract第7-8页
第一章 引言第15-22页
    1.1 课题提出第15页
    1.2 前人研究进展第15-20页
        1.2.1 雌雄异株植物的性别决定机制第15-16页
        1.2.2 性别鉴定分子标记的研究进展第16-19页
            1.2.2.1 SSR及 ISSR的应用第16-17页
            1.2.2.2 RAPD标记的应用第17-18页
            1.2.2.3 AFLP标记的应用第18页
            1.2.2.4 SNP标记的应用第18-19页
            1.2.2.5 Small RNA的应用第19页
        1.2.3 猕猴桃性别鉴定分子标记通用性鉴定进展第19-20页
    1.3 本研究主要内容及技术路线第20-22页
        1.3.1 本论文主要研究内容第20页
        1.3.2 技术路线第20-22页
第二章 猕猴桃主要栽培种性别标记的通用性验证第22-31页
    2.1 材料与方法第22-24页
        2.1.1 试材及取样第22-23页
        2.1.2 基因组DNA的获取及检测第23页
        2.1.3 标记来源第23页
        2.1.4 分子标记的通用性验证第23-24页
            2.1.4.1 SmX、SmY1、A001、A002及A003 性别标记在中华猕猴桃复合体中的通用性验证第23-24页
            2.1.4.2 SmX、SmY1、A001、A002及A003 性别标记在软枣猕猴桃中的通用性验证第24页
        2.1.5 分子标记验证结果准确率计算方法第24页
    2.2 结果与分析第24-28页
        2.2.1 SmX、SmY1 性别标记在已知性别中华猕猴桃样品中的通用性验证第24-25页
        2.2.2 SmX、SmY1 标记在已知性别软枣猕猴桃样品中的体系优化和性别鉴定通用性验证第25页
        2.2.3 A001、A002和A003标记在已知性别中华猕猴桃性别鉴定中的通用性验证第25-27页
        2.2.4 A001、A002和A003在已知性别软枣猕猴桃性别鉴定中的体系优化和性别鉴定通用性验证第27-28页
    2.3 讨论第28-31页
第三章 软枣猕猴桃性别标记的开发第31-51页
    3.1 材料与方法第31-35页
        3.1.1 试材及取样第31-32页
        3.1.2 基因组DNA的获取及检测第32页
        3.1.3 性别标记开发方法第32-33页
            3.1.3.1 建库测序流程第32页
            3.1.3.2 测序数据分析第32-33页
        3.1.4 软枣猕猴桃性别决定基因鉴定分析第33-34页
        3.1.5 性别特异片段的筛选与验证第34页
        3.1.6 分子标记验证结果准确率计算方法第34页
        3.1.7 性别特异片段序列的获得第34-35页
            3.1.7.1 LB培养基的制备第34-35页
            3.1.7.2 DNA的回收纯化第35页
            3.1.7.3 连接和转化和测序第35页
    3.2 结果与分析第35-49页
        3.2.1 测序结果统计与分析第35-41页
            3.2.1.1 碱基质量分析第36-37页
            3.2.1.2 与参考基因组比对统计第37页
            3.2.1.3 SNP检测与注释第37页
            3.2.1.4 Small InDel检测与注释第37-39页
            3.2.1.5 SV检测与注释第39页
            3.2.1.6 各变异在基因组上的分布第39-41页
        3.2.2 候选性别特异序列的获得第41-45页
        3.2.3 性别特异PCR引物的筛选第45-46页
        3.2.4 软枣猕猴桃性别特异序列的获得及分析第46页
        3.2.5 软枣猕猴桃性别特异引物在中华猕猴桃复合体中的通用性验证第46-49页
    3.3 讨论第49-51页
第四章 全文结论第51-52页
    4.1 结论第51页
    4.2 创新点第51页
    4.3 下一步工作展望第51-52页
参考文献第52-59页
附录第59-60页
致谢第60-61页
作者简历第61页

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