| 摘要 | 第11-13页 |
| Abstract | 第13-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-29页 |
| 1.1 黄瓜棒孢叶斑病 | 第15-18页 |
| 1.1.1 黄瓜棒孢叶斑病的发生与危害 | 第15页 |
| 1.1.2 黄瓜棒孢叶斑病的症状及特点 | 第15-16页 |
| 1.1.3 黄瓜棒孢叶斑病菌生理分化和遗传多样性 | 第16页 |
| 1.1.4 黄瓜棒孢叶斑病接种方式 | 第16-17页 |
| 1.1.5 黄瓜棒孢叶斑病的防治 | 第17-18页 |
| 1.1.6 黄瓜棒孢叶斑病抗性分子机制的研究 | 第18页 |
| 1.2 植物抗病研究 | 第18-20页 |
| 1.2.1 次生代谢与植物抗病 | 第19-20页 |
| 1.2.2 转录组测序在植物抗病中的应用 | 第20页 |
| 1.3 植物microRNAs与逆境应答 | 第20-27页 |
| 1.3.1 植物miRNAs的合成 | 第22-23页 |
| 1.3.2 miRNAs在植物中的作用机制 | 第23-24页 |
| 1.3.3 植物miRNAs与环境胁迫 | 第24-27页 |
| 1.4 研究目的及意义 | 第27-29页 |
| 第二章 黄瓜对棒孢叶斑病菌侵染的响应 | 第29-38页 |
| 2.1 材料与方法 | 第29-32页 |
| 2.1.1 棒孢叶斑病菌的活化与侵染 | 第29-30页 |
| 2.1.2 植物材料 | 第30页 |
| 2.1.3 供试黄瓜病情指数测定 | 第30页 |
| 2.1.4 所用试剂和培养基的配制 | 第30-31页 |
| 2.1.5 总DNA提取和黄瓜棒孢叶斑病菌的PCR检测 | 第31页 |
| 2.1.6 木质素组织化学染色 | 第31-32页 |
| 2.1.7 H_2O_2组织化学染色 | 第32页 |
| 2.1.8 O_2~(˙-)组织化学染色 | 第32页 |
| 2.2 结果与分析 | 第32-36页 |
| 2.2.1 接种黄瓜棒孢叶斑病菌后不同黄瓜品种间的抗性差异 | 第32-33页 |
| 2.2.2 黄瓜叶片中棒孢叶斑病菌的PCR检测 | 第33-34页 |
| 2.2.3 接种黄瓜棒孢叶斑病菌后黄瓜叶片木质素的变化 | 第34-35页 |
| 2.2.4 接种黄瓜棒孢叶斑病菌后黄瓜叶片H_2O_2的变化 | 第35页 |
| 2.2.5 接种黄瓜棒孢叶斑病菌的黄瓜叶片O_2~(˙-)的变化 | 第35-36页 |
| 2.3 讨论 | 第36-37页 |
| 2.4 本章小结 | 第37-38页 |
| 第三章 黄瓜响应棒孢叶斑病菌胁迫的转录组分析 | 第38-58页 |
| 3.1 材料与方法 | 第38-43页 |
| 3.1.1 植物材料 | 第38-39页 |
| 3.1.2 RNA提取 | 第39页 |
| 3.1.3 转录组测序 | 第39-40页 |
| 3.1.4 原始数据处理及质量评估 | 第40页 |
| 3.1.5 基因组比对 | 第40页 |
| 3.1.6 eggNOG分析 | 第40页 |
| 3.1.7 表达差异基因分析 | 第40页 |
| 3.1.8 表达差异基因GO富集 | 第40-41页 |
| 3.1.9 表达差异基因KEGG富集 | 第41页 |
| 3.1.10 实时荧光定量PCR(qRT-PCR) | 第41-43页 |
| 3.2 结果与分析 | 第43-54页 |
| 3.2.1 基因组比对分析 | 第43页 |
| 3.2.2 eggNOG功能分类分析 | 第43-45页 |
| 3.2.3 基因表达差异分析 | 第45-49页 |
| 3.2.4 候选基因qRT-PCR验证 | 第49-54页 |
| 3.3 讨论 | 第54-57页 |
| 3.4 本章小结 | 第57-58页 |
| 第四章 黄瓜响应棒孢叶斑病菌胁迫的miRNAs分析 | 第58-77页 |
| 4.1 材料与方法 | 第58-62页 |
| 4.1.1 植物材料 | 第58页 |
| 4.1.2 RNA提取 | 第58页 |
| 4.1.3 miRNA测序 | 第58-59页 |
| 4.1.4 原始数据处理 | 第59页 |
| 4.1.5 已知miRNAs注释 | 第59-60页 |
| 4.1.6 新miRNAs预测 | 第60页 |
| 4.1.7 miRNAs的差异表达分析 | 第60页 |
| 4.1.8 miRNAs靶基因预测 | 第60页 |
| 4.1.9 实时荧光定量PCR(qRT-PCR) | 第60-62页 |
| 4.2 结果与分析 | 第62-73页 |
| 4.2.1 miRNA数据质量 | 第62页 |
| 4.2.2 已知miRNAs注释 | 第62-64页 |
| 4.2.3 已知miRNAs差异表达和靶基因分析 | 第64-70页 |
| 4.2.4 新预测miRNAs差异表达和靶基因分析 | 第70-73页 |
| 4.3 讨论 | 第73-75页 |
| 4.4 本章小结 | 第75-77页 |
| 第五章 miRNAs和靶基因互作调控黄瓜抗棒孢叶斑病的作用分析 | 第77-116页 |
| 5.1 材料与方法 | 第78-92页 |
| 5.1.1 植物材料 | 第78页 |
| 5.1.2 菌株及质粒 | 第78页 |
| 5.1.3 所用试剂和培养基的配制 | 第78-80页 |
| 5.1.4 植物过表达载体的构建 | 第80-83页 |
| 5.1.5 农杆菌介导的瞬时表达 | 第83-87页 |
| 5.1.6 TRV诱导沉默载体的构建 | 第87-89页 |
| 5.1.7 病毒诱导的miRNA沉默(VBMS) | 第89-90页 |
| 5.1.8 TRV-STTM植株qRT-PCR鉴定 | 第90页 |
| 5.1.9 VBMS沉默miRNA后黄瓜子叶对棒孢叶斑病菌响应分析 | 第90-92页 |
| 5.2 结果与分析 | 第92-113页 |
| 5.2.1 候选miRNAs和靶基因扩增 | 第92-94页 |
| 5.2.2 重组质粒的阳性克隆鉴定 | 第94-95页 |
| 5.2.3 重组载体农杆菌转化 | 第95-96页 |
| 5.2.4 候选miRNAs和靶基因的互作验证 | 第96-98页 |
| 5.2.5 瞬时表达候选miRNAs和靶基因的表达水平检测 | 第98-100页 |
| 5.2.6 瞬时表达候选miRNAs和靶基因在黄瓜与棒孢叶斑病菌互作中的作用.. | 第100-102页 |
| 5.2.7 瞬时表达Novel-miR1和Novel-miR7及靶基因对黄瓜木质素含量的影响 | 第102-104页 |
| 5.2.8 基于TRV的STTM载体构建 | 第104-106页 |
| 5.2.9 TRV诱导的miRNA沉默(VBMS) | 第106-107页 |
| 5.2.10 VBMS黄瓜子叶中miRNA和靶基因表达水平检测 | 第107-109页 |
| 5.2.11 VBMS沉默miRNA后黄瓜子叶对棒孢叶斑病菌响应 | 第109-113页 |
| 5.3 讨论 | 第113-114页 |
| 5.4 本章小结 | 第114-116页 |
| 全文总结 | 第116-119页 |
| 本论文的特色和创新之处 | 第119-120页 |
| 参考文献 | 第120-134页 |
| 附录 | 第134-144页 |
| 致谢 | 第144-145页 |
| 攻读学位期间发表学术论文 | 第145-147页 |
