| 摘要 | 第3-4页 |
| ABSTRACT | 第4-5页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-15页 |
| 1 | 第9-10页 |
| 1.1 引言 | 第9页 |
| 1.2 植物内生放线菌 | 第9-10页 |
| 2 植物内生放线菌的分离 | 第10-15页 |
| 2.1 宿主植物的选择 | 第10-11页 |
| 2.2 内生菌的分离方法 | 第11-12页 |
| 2.3 植物内生放线菌的多样性 | 第12-13页 |
| 2.4 内生菌与宿主的关联性 | 第13-14页 |
| 2.5 内生放线菌的探究应用 | 第14-15页 |
| 第二章 高通量测序分析3种有毒植物细菌丰度 | 第15-25页 |
| 1 材料与方法 | 第15-17页 |
| 1.1 供试材料及预处理 | 第15页 |
| 1.2 高通量测序及分析方法 | 第15-17页 |
| 1.2.1 上机测序流程 | 第15-16页 |
| 1.2.1.1 植物样本DNA的提取 | 第15页 |
| 1.2.1.2 16S rRNA基因V4区PCR扩增 | 第15-16页 |
| 1.2.1.3 PCR产物的混样和纯化 | 第16页 |
| 1.2.1.4 文库构建与上机测序 | 第16页 |
| 1.2.2 信息分析流程 | 第16-17页 |
| 1.2.2.1 测序数据处理 | 第16页 |
| 1.2.2.2 OTUs聚类分析与物种注释 | 第16-17页 |
| 1.2.2.3 多样性分析方法 | 第17页 |
| 2 结果与讨论 | 第17-24页 |
| 2.1 高通量测序结果分析 | 第17-19页 |
| 2.1.1 测序结果注释与取样深度分析 | 第17页 |
| 2.1.2 稀释曲线 | 第17-18页 |
| 2.1.3 等级丰度曲线 | 第18-19页 |
| 2.2 Alha多样性分析 | 第19-20页 |
| 2.3 内生细菌群落结构分析 | 第20-21页 |
| 2.4 Beta多样性分析 | 第21-24页 |
| 2.4.1 主成分分析 | 第21-22页 |
| 2.4.2 物种丰度聚类热图 | 第22-23页 |
| 2.4.3 非加权组平均聚类分析 | 第23-24页 |
| 本章小结 | 第24-25页 |
| 第三章 有毒植物及根际土的纯培养放线菌 | 第25-41页 |
| 1 材料与方法 | 第25-29页 |
| 1.1 供试材料 | 第25页 |
| 1.1.1 有毒植物样本 | 第25页 |
| 1.1.2 有毒植物根际土样本 | 第25页 |
| 1.2 分离方法 | 第25-29页 |
| 1.2.1 植物样本表面清洗 | 第25页 |
| 1.2.2 植物样本表面消毒 | 第25-27页 |
| 1.2.3 表面消毒效果的检查 | 第27页 |
| 1.2.4 样本的预处理 | 第27页 |
| 1.2.4.1 植物样本的预处理 | 第27页 |
| 1.2.4.2 根际土样本的预处理 | 第27页 |
| 1.2.5 培养基的设计 | 第27-28页 |
| 1.2.6 分离菌株的初步鉴定 | 第28页 |
| 1.2.7 内生放线菌的多样性分析方式 | 第28-29页 |
| 1.2.7.1 内生放线菌DNA的提取 | 第28-29页 |
| 1.2.7.2 内生放线菌16S rRNA的扩增 | 第29页 |
| 1.2.7.3 16S rRNA扩增产物测序及结果比对 | 第29页 |
| 2 结果与讨论 | 第29-40页 |
| 2.1 植物表面消毒方法与分离效果 | 第29-30页 |
| 2.2 植物样本预处理方法与分离效果 | 第30-31页 |
| 2.3 分离培养基与分离效果 | 第31-32页 |
| 2.4 纯培养放线菌多样性分析 | 第32-40页 |
| 2.4.1 植物不同器官内生放线菌多样性 | 第32-35页 |
| 2.4.2 不同毒性植物内生放线菌的多样性 | 第35-36页 |
| 2.4.3 同种植物不同生境的内生放线菌多样性 | 第36-37页 |
| 2.4.4 本地特有植物的内生放线菌多样性 | 第37页 |
| 2.4.5 植物内生放线菌与根际土放线菌多样性 | 第37-38页 |
| 2.4.6 免培养与纯培养方式探究放线菌多样性的比较 | 第38-40页 |
| 本章小结 | 第40-41页 |
| 第四章 具有潜在生物活性的有毒植物及根际土放线菌的筛选 | 第41-50页 |
| 1 材料与方法 | 第41-43页 |
| 1.1 实验菌株 | 第41-42页 |
| 1.2 病原指示菌 | 第42页 |
| 1.3 培养基 | 第42页 |
| 1.4 放线菌的发酵产物 | 第42页 |
| 1.5 抑菌试验 | 第42页 |
| 1.6 功能基因的扩增 | 第42-43页 |
| 1.6.1 引物信息 | 第42-43页 |
| 1.6.2 功能基因的扩增及检测 | 第43页 |
| 2 结果与讨论 | 第43-49页 |
| 2.1 抗菌活性 | 第43-46页 |
| 2.1.1 有毒植物内生放线菌的抗菌活性 | 第43-45页 |
| 2.1.2 根际土内生放线菌的抗菌活性 | 第45-46页 |
| 2.2 功能基因扩增结果 | 第46-49页 |
| 2.2.1 有毒植物内生放线菌 | 第46-47页 |
| 2.2.2 有毒植物根际土内生放线菌 | 第47-49页 |
| 本章小结 | 第49-50页 |
| 总结与展望 | 第50-51页 |
| 附录 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-58页 |
| 攻读硕士学位期间的成果目录 | 第58-59页 |
| 致谢 | 第59页 |
