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兰州大尾羊不同部位脂肪组织差异表达基因的筛选

摘要第4-6页
Abstract第6-7页
英文对照表第8-13页
第1章 文献综述第13-22页
    1.1 兰州大尾羊第13-14页
    1.2 脂肪组织第14-15页
    1.3 体脂分布对生产性能的影响第15-16页
    1.4 肌内脂肪对肉质的影响第16-17页
    1.5 脂肪代谢研究进展第17-18页
    1.6 转录组测序技术第18-20页
        1.6.1 转录组测序技术羊肉品质研究中的应用第19-20页
    1.7 本研究的目的和意义第20-21页
    1.8 研究内容和技术路线第21-22页
        1.8.1 研究内容第21页
        1.8.2 总技术路线第21-22页
第2章 材料与方法第22-31页
    2.1 试验材料第22-23页
        2.1.1 实验样品第22页
        2.1.2 仪器设备第22页
        2.1.3 实验试剂第22-23页
    2.2 总RNA提取第23页
    2.3 文库构建第23-27页
        2.3.1 rRNA的去除和RNA片段化第23-24页
        2.3.2 cDNA第一链合成第24页
        2.3.3 cDNA第二链的合成第24-25页
        2.3.4 末端修复第25页
        2.3.5 3’末端加腺苷酸第25页
        2.3.6 连接接头第25-26页
        2.3.7 富集纯化的cDNA模板第26-27页
    2.4 文库质检第27页
    2.5 cDNA文库测序第27页
    2.6 测序数据的处理与分析第27-31页
        2.6.1 测序序列格式及质量评估第27页
        2.6.2 数据预处理第27-28页
        2.6.3 参考基因组比对分析第28页
        2.6.4 基因水平表达分析第28页
        2.6.5 表达相关性分析第28-29页
        2.6.6 荧光定量PCR第29-30页
        2.6.7 基因差异表达分析第30页
        2.6.8 差异表达基因的GO富集分析第30页
        2.6.9 差异表达基因的KEGG富集分析第30-31页
第3章 结果与分析第31-67页
    3.1 总RNA提取与质量检测第31-33页
    3.2 测序数据与质量评估第33-35页
    3.3 数据预处理第35页
    3.4 参考基因组比对分析第35-38页
    3.5 基因水平表达分析第38页
    3.6 表达相关性分析第38-39页
    3.7 荧光定量PCR结果第39-40页
    3.8 基因差异表达分析第40-46页
        3.8.1 皮下脂肪组织与肌肉组织基因差异表达分析第41-43页
        3.8.2 内脏脂肪组织与肌肉组织基因差异表达分析第43-44页
        3.8.3 内脏脂肪组织与皮下脂肪组织基因差异表达分析第44-46页
    3.9 差异表达基因的GO富集分析第46-51页
        3.9.1 皮下脂肪组织与肌肉组织差异表达基因的GO富集分析第46-48页
        3.9.2 内脏脂肪组织与肌肉组织差异表达基因的GO富集分析第48-50页
        3.9.3 内脏脂肪组织与皮下脂肪组织差异表达基因的GO富集分析第50-51页
    3.10 差异表达基因的KEGG富集分析第51-67页
        3.10.1 皮下脂肪组织与肌肉组织差异表达基因的KEGG富集分析第51-58页
        3.10.2 内脏脂肪组织与肌肉组织差异表达基因的KEGG富集分析第58-61页
        3.10.3 内脏脂肪组织与皮下脂肪组织差异表达基因的KEGG富集分析第61-67页
第4章 讨论第67-70页
    4.1 差异表达基因分析第67-68页
    4.2 差异表达基因富集性分析第68-70页
第5章 结论第70-71页
参考文献第71-79页
作者简介第79页
硕士期间发表论文第79-80页
致谢第80页

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