| 摘要 | 第8-9页 |
| ABSTRACT | 第9页 |
| 第一章 绪论 | 第10-27页 |
| 1.1 液相色谱-串联质谱联用平台组成和原理介绍 | 第10-16页 |
| 1.1.1 液相色谱分离技术 | 第11-12页 |
| 1.1.2 电离技术 | 第12-13页 |
| 1.1.3 质量分析器 | 第13-15页 |
| 1.1.4 离子检测器与数据处理系统 | 第15页 |
| 1.1.5 Q-Exactive质谱平台介绍 | 第15-16页 |
| 1.2 基于质谱的蛋白质组学实验策略与定量技术 | 第16-21页 |
| 1.2.1 基于质谱的蛋白质组学实验策略 | 第17-18页 |
| 1.2.2 基于质谱的蛋白质组学定量技术 | 第18-21页 |
| 1.3 基于质谱的数据采集模式介绍 | 第21-24页 |
| 1.4 论文的研究内容与结构 | 第24-27页 |
| 第二章 质谱数据处理方法应用 | 第27-37页 |
| 2.1 质谱数据特点及种类归纳 | 第27-30页 |
| 2.1.1 质谱数据特点 | 第27-28页 |
| 2.1.2 质谱数据种类 | 第28-30页 |
| 2.2 质谱数据处理方法应用 | 第30-37页 |
| 2.2.1 质谱数据预处理 | 第30-32页 |
| 2.2.2 数据库搜索 | 第32-35页 |
| 2.2.3 质谱数据质量控制 | 第35-36页 |
| 2.2.4 数据提取与整合 | 第36-37页 |
| 第三章 基于质谱DIA数据处理算法软件评估 | 第37-52页 |
| 3.1 实验数据集 | 第37-39页 |
| 3.2.1 BPRC数据集 | 第37-38页 |
| 3.2.2 SWATH数据集 | 第38-39页 |
| 3.2.3 MSE数据集 | 第39页 |
| 3.2 质谱DIA原理与方法比较研究 | 第39-45页 |
| 3.2.1 全离子裂解扫描(All-ion fragmentation scanning) | 第40-41页 |
| 3.2.2 逐步式窗口碎裂扫描(Stepwise-isolation windows scanning) | 第41-42页 |
| 3.2.3 随机式窗口碎裂扫描(Random-isolation windows scanning) | 第42-45页 |
| 3.3 基于质谱DIA数据处理算法软件评估 | 第45-51页 |
| 3.3.1 算法处理流程及分类 | 第45-48页 |
| 3.3.2 评估结果讨论 | 第48-51页 |
| 3.3.2.1 传统数据库搜索方法对DDA、DIA数据处理效果评估 | 第48-49页 |
| 3.3.2.2 基于质谱DIA与DDA模式的蛋白质组定性效果分析 | 第49-51页 |
| 3.4 小结 | 第51-52页 |
| 第四章 肽段定量信号提取算法研究 | 第52-67页 |
| 4.1 基于离子流色谱峰的肽段定量方法 | 第52-55页 |
| 4.1.1 基于离子流色谱峰的肽段定量算法研究 | 第52-53页 |
| 4.1.2 基于离子流色谱峰的肽段定量关键算法评估 | 第53-55页 |
| 4.2 一种新的快速肽段定量信号提取算法XICFinder | 第55-66页 |
| 4.2.1 XICFinder算法功能与流程分析 | 第55-57页 |
| 4.2.2 XICFinder数据结构与函数关系分析 | 第57-59页 |
| 4.2.3 XICFinder参数设置与输出文件分析 | 第59-62页 |
| 4.2.4 实验数据集 | 第62页 |
| 4.2.5 算法结果展示与评估 | 第62-66页 |
| 4.3 小结 | 第66-67页 |
| 第五章 总结与展望 | 第67-69页 |
| 5.1 论文工作总结 | 第67-68页 |
| 5.2 未来工作展望 | 第68-69页 |
| 致谢 | 第69-70页 |
| 参考文献 | 第70-76页 |
| 作者在学期间取得的学术成果 | 第76页 |
