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南瓜资源抗逆性评价及嫁接对西瓜果实品质影响的转录组和代谢组分析

摘要第8-10页
Abstract第10-12页
缩略词表第13-14页
1 前言第14-22页
    1.1 课题的提出第14-15页
    1.2 国内外研究进展第15-21页
        1.2.1 嫁接在西瓜生产中的应用第15-16页
        1.2.2 不同砧木嫁接对西瓜果实品质的影响第16-17页
        1.2.3 砧用南瓜耐旱性研究进展第17页
        1.2.4 砧用南瓜抗土传病害研究进展第17-18页
        1.2.5 西瓜果实糖酸研究进展第18-20页
        1.2.6 转录组和代谢组在植物果实研究中的应用第20-21页
    1.3 本研究的目的及主要内容第21-22页
        1.3.1 本研究的目的第21页
        1.3.2 本研究的主要内容第21-22页
2 材料与方法第22-37页
    2.1 南瓜属自交系苗期性状调查第22-25页
        2.1.1 试验材料第22-24页
        2.1.2 南瓜自交系幼苗培养第24页
        2.1.3 测量指标及方法第24页
        2.1.4 数据统计与分析第24-25页
    2.2 南瓜种质资源苗期耐旱性评价第25-28页
        2.2.1 试验材料第25-26页
        2.2.2 南瓜种质资源幼苗培育及干旱处理第26-27页
        2.2.3 相关指标测定及方法第27页
        2.2.4 数据处理及分析第27-28页
    2.3 南瓜种质资源抗根腐病鉴定第28-30页
        2.3.1 实验材料第28-29页
        2.3.2 供试菌株第29页
        2.3.3 菌株活化扩繁第29页
        2.3.4 西瓜根腐病菌的生殖生长(产孢方法)第29页
        2.3.5 相关培养基配方第29页
        2.3.6 接菌流程第29-30页
        2.3.7 病害分级第30页
        2.3.8 病原菌的鉴定第30页
    2.4 南瓜砧木对嫁接西瓜果实糖酸含量的影响第30-32页
        2.4.1 实验材料第30-31页
        2.4.2 材料培养第31-32页
    2.5 果实感官品质评价第32页
        2.5.1 试验材料第32页
        2.5.2 评价标准第32页
    2.6 RNA-Seq分析第32-34页
        2.6.1 试验材料及取样第32-33页
        2.6.2 RNA的提取和检测第33页
        2.6.3 链特异性文库的构建和库检第33页
        2.6.4 上机测序第33页
        2.6.5 差异表达基因的鉴定第33-34页
        2.6.6 GO富集分析和Pathway分析第34页
        2.6.7 糖酸积累相关基因的差异表达分析第34页
        2.6.8 RNA-Seq数据验证第34页
    2.7 代谢组分析第34-37页
        2.7.1 实验材料及取样第34页
        2.7.2 样品处理第34-35页
        2.7.3 GC-TOF-MS平台检测第35页
        2.7.4 原始数据预处理第35页
        2.7.5 主成分分析第35-36页
        2.7.6 正交偏最小二乘法-判别分析(OPLS-DA)第36页
        2.7.7 单变量统计分析筛选差异代谢物第36-37页
3 结果与分析第37-81页
    3.1 南瓜自交系幼苗苗期性状评价第37-39页
    3.2 南瓜砧木种质资源耐旱性评价第39-45页
    3.3 南瓜砧木种质资源抗根腐病评价第45-47页
        3.3.1 病原菌鉴定第45-46页
        3.3.2 南瓜种质资源根腐病抗性评价第46-47页
    3.4 南瓜砧木对嫁接西瓜果实品质影响第47-53页
        3.4.1 南瓜砧木对嫁接西瓜果实品质影响第47-49页
        3.4.2 南瓜砧木嫁接西瓜对西瓜果实综合口感的影响第49-52页
        3.4.3 四份嫁接组合果实糖酸含量测定第52-53页
    3.5 南瓜种质资源在转录水平对嫁接西瓜果实糖酸含量的影响第53-73页
        3.5.1 RNA-Seq测序及同参考基因组比对结果第53-55页
        3.5.2 样本相关性分析第55页
        3.5.3 差异表达基因的鉴定第55-58页
        3.5.4 GO富集分析第58-64页
        3.5.5 Pathway分析第64-71页
        3.5.6 qRT-PCR验证RNA-Seq数据第71-73页
    3.6 南瓜种质资源在代谢水平对嫁接西瓜果实糖酸含量的影响第73-81页
        3.6.1 样本质量控制第73-74页
        3.6.2 西瓜果实代谢组主成分分析(PCA)第74-75页
        3.6.3 代谢组数据样本相关性分析第75-76页
        3.6.4 样品信号相应的峰占比第76页
        3.6.5 样本差异代谢物Pathway分析第76-81页
4 讨论第81-86页
    4.1 南瓜属自交系苗期性状评价第81页
    4.2 南瓜种质资源耐旱性鉴定第81-82页
    4.3 南瓜种质资源抗根腐病鉴定第82-83页
    4.4 南瓜砧木对嫁接西瓜果实品质转录水平的影响第83-84页
    4.5 南瓜砧木对嫁接西瓜果实品质代谢水平的影响第84-86页
5 全文结论第86-87页
参考文献第87-94页
附录第94-98页
    附录 ⅠITS序列扩增的引物、体系和程序第94-95页
    附录 ⅡRNA质量检测结果第95-96页
    附录 Ⅲ 菌株、孢子及特征苗期发病照片第96-97页
    附录 Ⅳ 菌株测序及物种鉴定结果第97-98页
致谢第98-99页

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