| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 第一章 引言 | 第13-22页 |
| 1.三疣梭子蟹概述 | 第13-14页 |
| 1.1 三疣梭子蟹概述分类地位和地理分布 | 第13页 |
| 1.2 形态结构和特征 | 第13页 |
| 1.3 生活习性 | 第13页 |
| 1.4 养殖现状 | 第13-14页 |
| 1.5 生长与发育 | 第14页 |
| 2.盐度与水生甲壳类动物 | 第14-15页 |
| 2.1 盐度对水生甲壳动物的影响 | 第14-15页 |
| 2.2 水生甲壳动物盐度调节的主要器官 | 第15页 |
| 3.表观遗传学相关研究 | 第15-16页 |
| 3.1 表观遗传学概述 | 第15-16页 |
| 3.2 DNA甲基化调节模式 | 第16页 |
| 3.3 组蛋白修饰 | 第16页 |
| 4.DNMT家族蛋白 | 第16-18页 |
| 4.1 DNMT家族简介 | 第16-18页 |
| 5.全基因组DNA甲基化的研究方法 | 第18-20页 |
| 5.1 MethylRAD的原理简介 | 第18-20页 |
| 6.DNA甲基化的生物学作用 | 第20-21页 |
| 6.1 DNA甲基化与杂种优势 | 第20页 |
| 6.2 DNA甲基化与细胞增值 | 第20页 |
| 6.3 DNA甲基化与X染色体失活 | 第20-21页 |
| 7.研究的目的和意义 | 第21-22页 |
| 第二章 三疣梭子蟹DNMT1基因克隆及在低盐胁迫下的表达分析 | 第22-33页 |
| 1.材料和方法 | 第22-25页 |
| 1.1 实验材料 | 第22页 |
| 1.2 实验仪器 | 第22-23页 |
| 1.3 实验试剂 | 第23页 |
| 1.4 盐度胁迫实验 | 第23页 |
| 1.5 总RNA的提取及cDNA的合成 | 第23-24页 |
| 1.6 cDNA全长序列基因克隆方法 | 第24页 |
| 1.7 生物学序列分析 | 第24-25页 |
| 2.实验结果 | 第25-31页 |
| 2.1 三疣梭子蟹PtDNMT1基因cDNA全长的获得和序列分析 | 第25-28页 |
| 2.2 同源性及系统进化树分析 | 第28-29页 |
| 2.3 三疣梭子蟹PtDNMT1基因组织表达分析 | 第29页 |
| 2.4 盐度胁迫后PtDNMT1基因的在鳃、肝胰腺和肌肉组织中的表达分析 | 第29-31页 |
| 3.讨论 | 第31-33页 |
| 第三章 盐度胁迫下三疣梭子蟹鳃组织DNA甲基化分析与验证 | 第33-49页 |
| 1.材料和方法 | 第33-37页 |
| 1.1 实验动物 | 第33页 |
| 1.2 实验仪器 | 第33页 |
| 1.3 主要试剂 | 第33-34页 |
| 1.4 实验方法 | 第34页 |
| 1.5 MethylRAD建库和高通量测序 | 第34-35页 |
| 1.6 位点甲基化水平的相对定量 | 第35-36页 |
| 1.7 亚硫酸亚测序验证 | 第36页 |
| 1.8 qRT-PCR对基因组DNA甲基化检测 | 第36-37页 |
| 2.结果 | 第37-46页 |
| 2.1 基因组DNA提取 | 第37页 |
| 2.2 数据过滤与质控 | 第37页 |
| 2.3 甲基化位点测序深度 | 第37-39页 |
| 2.4 MethylRAD测序位点分布与分析 | 第39-41页 |
| 2.5 亚硫酸亚测序验证 | 第41-42页 |
| 2.6 qRT-PCR对基因组DNA甲基化检测 | 第42-46页 |
| 3.讨论 | 第46-49页 |
| 参考文献 | 第49-54页 |
| 致谢 | 第54-55页 |
| 硕士期间论文发表情况 | 第55页 |
