| 致谢 | 第7-8页 |
| 摘要 | 第8-10页 |
| abstract | 第10-11页 |
| 第一章 绪论 | 第17-27页 |
| 1.1 测序技术的发展 | 第17-18页 |
| 1.1.1 第一代测序技术 | 第17页 |
| 1.1.2 第二代测序技术 | 第17-18页 |
| 1.1.3 第三代测序技术 | 第18页 |
| 1.1.4 第四代测序技术 | 第18页 |
| 1.2 转录组和转录组研究方法 | 第18-20页 |
| 1.2.1 转录组 | 第18-19页 |
| 1.2.2 转录组研究方法 | 第19-20页 |
| 1.3 RNA-Seq技术 | 第20-21页 |
| 1.3.1 预测新基因 | 第20页 |
| 1.3.2 基因表达水平研究 | 第20-21页 |
| 1.3.3 非编码区域功能研究 | 第21页 |
| 1.3.4 转录本结构变异 | 第21页 |
| 1.3.5 开发SNPs和SSR | 第21页 |
| 1.4 鸡胚抗氧化成分研究进展 | 第21-26页 |
| 1.4.1 活性氧来源 | 第21-22页 |
| 1.4.2 抗氧化成分研究进展 | 第22-26页 |
| 1.5 本课题研究目的及意义 | 第26-27页 |
| 第二章 鸡胚抗氧化酶活性测定 | 第27-34页 |
| 2.1 引言 | 第27页 |
| 2.2 材料与试剂 | 第27-28页 |
| 2.2.1 实验材料 | 第27页 |
| 2.2.2 实验试剂 | 第27页 |
| 2.2.3 实验仪器 | 第27-28页 |
| 2.3 实验方法 | 第28-30页 |
| 2.3.1 受精蛋孵化 | 第28页 |
| 2.3.2 整个鸡胚蛋、鸡胚肝脏组织、鸡胚心脏组织制备 | 第28页 |
| 2.3.3 超氧化物歧化酶(SOD)测定 | 第28页 |
| 2.3.4 谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)测定 | 第28-29页 |
| 2.3.5 过氧化物酶测定 | 第29页 |
| 2.3.6 试验数据处理 | 第29-30页 |
| 2.4 结果与讨论 | 第30-33页 |
| 2.4.1 孵化期间鸡胚超氧化物歧化酶活力变化 | 第30-31页 |
| 2.4.2 孵化期间谷胱甘肽过氧化物酶活性变化 | 第31-32页 |
| 2.4.3 孵化期间过氧化物酶活性变化 | 第32页 |
| 2.4.4 讨论 | 第32-33页 |
| 2.5 本章结论 | 第33-34页 |
| 第三章 基于转录组测序技术研究鸡胚肝脏抗氧化酶活性 | 第34-54页 |
| 3.1 引言 | 第34页 |
| 3.2 实验材料和试剂 | 第34-36页 |
| 3.2.1 实验材料 | 第34页 |
| 3.2.2 实验试剂 | 第34-35页 |
| 3.2.3 实验仪器 | 第35页 |
| 3.2.4 主要实验软件以及网址 | 第35-36页 |
| 3.3 实验方法 | 第36-40页 |
| 3.3.1 肝脏组织RNA提取 | 第36页 |
| 3.3.2 RNA质量检测 | 第36-37页 |
| 3.3.3 cDNA文库构建 | 第37页 |
| 3.3.4 聚类和测序 | 第37-38页 |
| 3.3.5 荧光定量PCR | 第38-40页 |
| 3.4 实验数据分析 | 第40-43页 |
| 3.4.1 原始测序数据 | 第40-41页 |
| 3.4.2 测序数据质量评估 | 第41-42页 |
| 3.4.3 参考序列比对 | 第42页 |
| 3.4.4 可变剪切分析 | 第42页 |
| 3.4.5 基因表达水平分析 | 第42页 |
| 3.4.6 差异表达分析 | 第42-43页 |
| 3.4.7 差异基因GO富集分析 | 第43页 |
| 3.5 实验结果与讨论 | 第43-53页 |
| 3.5.1 总RNA检测结果 | 第43-44页 |
| 3.5.2 转录组测序结果 | 第44-45页 |
| 3.5.3 参考序列比对结果 | 第45-46页 |
| 3.5.4 可变剪切分析 | 第46页 |
| 3.5.5 基因表达水平分析 | 第46-47页 |
| 3.5.6 差异基因表达分析 | 第47-48页 |
| 3.5.7 差异基因GO富集和KEGG通路分析 | 第48-50页 |
| 3.5.8 荧光定量PCR | 第50-51页 |
| 3.5.9 讨论 | 第51-53页 |
| 3.6 本章结论 | 第53-54页 |
| 第四章 GPX3基因的功能验证 | 第54-67页 |
| 4.1 引言 | 第54页 |
| 4.2 实验材料及试剂 | 第54-55页 |
| 4.2.1 实验材料 | 第54页 |
| 4.2.2 实验试剂 | 第54-55页 |
| 4.2.3 实验仪器 | 第55页 |
| 4.3 实验方法 | 第55-60页 |
| 4.3.1 培养基配制 | 第55页 |
| 4.3.2 培养基包被 | 第55-56页 |
| 4.3.3 鸡胚肝实质细胞分离培养 | 第56页 |
| 4.3.4 GPX3小干扰片段合成 | 第56页 |
| 4.3.5 SiRNA-FAM转染预实验 | 第56-57页 |
| 4.3.6 小RNA干扰片段转染鸡胚肝实质细胞 | 第57-58页 |
| 4.3.7 荧光定量PCR验证干扰效果 | 第58-59页 |
| 4.3.8 小RNA干扰片段对鸡胚肝细胞抗氧化酶活力的影响 | 第59页 |
| 4.3.9 数据处理 | 第59-60页 |
| 4.4 实验结果与讨论 | 第60-66页 |
| 4.4.1 原代鸡胚肝细胞分离培养 | 第60页 |
| 4.4.2 转染预实验 | 第60-62页 |
| 4.4.3 GPX3最佳干扰片段筛选对鸡胚肝实质细胞转染效果 | 第62-63页 |
| 4.4.4 GPX3有效干扰片段筛选 | 第63-64页 |
| 4.4.5 小RNA干扰片段对鸡胚肝实质细胞抗氧化酶活性的影响 | 第64-65页 |
| 4.4.6 讨论 | 第65-66页 |
| 4.5 本章结论 | 第66-67页 |
| 第五章 结论与展望 | 第67-69页 |
| 5.1 结论 | 第67页 |
| 5.2 展望 | 第67-69页 |
| 参考文献 | 第69-77页 |
| 附录1 | 第77-78页 |
| 攻读硕士学位期间的学术活动及成果情况 | 第78-79页 |
