| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第12-22页 |
| 1.1 甲烷的污染 | 第12页 |
| 1.2 甲烷的生物氧化 | 第12-14页 |
| 1.2.1 甲烷有氧氧化 | 第12-13页 |
| 1.2.2 甲烷厌氧氧化 | 第13-14页 |
| 1.3 SAMO过程的研究进展 | 第14-18页 |
| 1.3.1 SAMO过程的研究历史 | 第14页 |
| 1.3.2 参与SAMO的微生物 | 第14-15页 |
| 1.3.3 SAMO过程的机理 | 第15-18页 |
| 1.4 DAMO过程的研究进展 | 第18-20页 |
| 1.4.1 DAMO过程的研究历史 | 第18页 |
| 1.4.2 参与DAMO过程的微生物 | 第18-19页 |
| 1.4.3 DAMO过程的机理 | 第19-20页 |
| 1.5 本课题的研究目的与研究意义 | 第20-22页 |
| 1.5.1 研究意义 | 第20-21页 |
| 1.5.2 研究内容和技术路线 | 第21-22页 |
| 第二章 mcrA基因克隆文库群落结构及丰度分析 | 第22-45页 |
| 2.1 引言 | 第22页 |
| 2.2 材料与方法 | 第22-30页 |
| 2.2.1 药品与仪器 | 第22-23页 |
| 2.2.2 沉积物的采集与预处理 | 第23页 |
| 2.2.3 总基因组DNA的提取 | 第23-24页 |
| 2.2.4 mcrA基因和aprA基因的扩增 | 第24-26页 |
| 2.2.5 mcrA基因克隆文库的构建与阳性克隆子筛选 | 第26-27页 |
| 2.2.6 mcrA基因克隆文库的片段多态性（RFLP）分析 | 第27-28页 |
| 2.2.7 mcrA基因克隆子测序及进化树构建 | 第28页 |
| 2.2.8 mcrA基因克隆文库多样性指数的计算 | 第28-29页 |
| 2.2.9 mcrA基因和aprA基因的绝对荧光定量 | 第29-30页 |
| 2.3 结果及讨论 | 第30-43页 |
| 2.3.1 珠江水体三点沉积物样品基因组提取结果 | 第30-31页 |
| 2.3.2 mcrA基因和aprA基因的PC R扩增 | 第31-33页 |
| 2.3.3 mcrA基因阳性克隆子的菌落PCR结果 | 第33-34页 |
| 2.3.4 双酶切PAGE电泳结果 | 第34-35页 |
| 2.3.5 mcrA基因阳性克隆子分类 | 第35-39页 |
| 2.3.6 mcrA基因文库多样性指数分析 | 第39-40页 |
| 2.3.7 mcrA基因克隆文库系统发育树分析 | 第40-42页 |
| 2.3.8 aprA基因和mcrA基因丰度分析 | 第42-43页 |
| 2.4 本章小结 | 第43-45页 |
| 第三章 pmoA基因和NC1016S rRNA基因克隆文库群落结构及丰度分析 | 第45-64页 |
| 3.1 引言 | 第45页 |
| 3.2 材料与方法 | 第45-49页 |
| 3.2.1 试剂与仪器 | 第45页 |
| 3.2.2 样品采集与预处理 | 第45页 |
| 3.2.3 总DNA提取 | 第45页 |
| 3.2.4 NC1016S rRNA基因和pmoA基因的扩增 | 第45-47页 |
| 3.2.5 NC1016S rRNA基因和pmoA基因的克隆文库的构建与阳性克隆子筛选 | 第47-48页 |
| 3.2.6 NC1016S rRNA基因和pmoA基因克隆文库的片段多态性（RFLP）分析 | 第48页 |
| 3.2.7 NC1016S rRNA基因和pmoA基因克隆子测序及进化树构建 | 第48页 |
| 3.2.8 NC1016S rRNA基因和pmoA基因克隆文库多样性指数的计算 | 第48-49页 |
| 3.2.9 NC1016S rRNA基因的绝对荧光定量 | 第49页 |
| 3.3 结果及讨论 | 第49-63页 |
| 3.3.1 珠江水体三点沉积物样品基因组提取结果 | 第49页 |
| 3.3.2 NC1016S rRNA基因和pmoA基因的PCR扩增 | 第49-50页 |
| 3.3.3 NC1016S rRNA基因和pmoA基因阳性克隆子的菌落PCR结果 | 第50-52页 |
| 3.3.4 双酶切PAGE电泳结果 | 第52-54页 |
| 3.3.5 NC1016S rRNA基因和pmoA基因阳性克隆子分类 | 第54-57页 |
| 3.3.6 NC1016S rRNA基因和pmoA基因文库多样性指数分析 | 第57-58页 |
| 3.3.7 NC1016S rRNA基因和pmoA基因克隆文库系统发育树分析 | 第58-62页 |
| 3.3.8 NC1016S rRNA基因丰度分析 | 第62-63页 |
| 3.4 本章小结 | 第63-64页 |
| 第四章 中大点不同时间、不同深度NC10 门细菌和ANME菌的群落结构变化及丰度分析 | 第64-77页 |
| 4.1 引言 | 第64页 |
| 4.2 材料与方法 | 第64-67页 |
| 4.2.1 仪器与试剂 | 第64页 |
| 4.2.2 样品的采集与预处理 | 第64-65页 |
| 4.2.3 基因组提取 | 第65页 |
| 4.2.4 mcrA、NC1016S rRNA基因PCR产物扩增 | 第65页 |
| 4.2.5 变性梯度凝胶电泳（DGGE） | 第65-67页 |
| 4.2.6 中大不同样品的NC1016S rRNA和mcrA、apr A的基因丰度分析 | 第67页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第67-76页 |
| 4.3.1 基因组DNA的提取结果 | 第67-68页 |
| 4.3.2 中大不同样品NC1016S rRNA基因和mcrA基因PCR的扩增结果 | 第68页 |
| 4.3.3 中大不同样品NC1016S rRNA基因和mcrA基因PCR产物DGGE结果 | 第68-69页 |
| 4.3.4 Quantity O ne软件分析DGGE电泳图 | 第69-73页 |
| 4.3.5 荧光定量PCR定量结果 | 第73-76页 |
| 4.4 本章小结 | 第76-77页 |
| 结论与展望 | 第77-80页 |
| 创新点 | 第77页 |
| 结论 | 第77-78页 |
| 展望 | 第78-80页 |
| 参考文献 | 第80-84页 |
| 攻读硕士学位期间取得的研究成果 | 第84-85页 |
| 致谢 | 第85-86页 |
| 附件 | 第86页 |
