| 摘要 | 第4-6页 |
| abstract | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第10-20页 |
| 1.1 本文的研究目的和意义 | 第10-14页 |
| 1.2 本文的主要工作 | 第14-17页 |
| 1.3 本文的结构 | 第17-20页 |
| 第2章 生物数据和相关计算方法简介 | 第20-36页 |
| 2.1 生物数据 | 第20-25页 |
| 2.1.1 生物数据概述 | 第20-21页 |
| 2.1.2 生物数据库简介 | 第21-25页 |
| 2.2 本文主要使用的拟合回归模型和其它相关算法 | 第25-36页 |
| 2.2.1 拟合回归 | 第25-28页 |
| 2.2.2 线性回归 | 第28-29页 |
| 2.2.3 支持向量机 | 第29-32页 |
| 2.2.4 本文使用的其它模型和算法 | 第32-36页 |
| 第3章 谷氨酰胺和谷氨酸在多种癌症中的代谢分析 | 第36-66页 |
| 3.1 研究背景 | 第36-38页 |
| 3.2 实验数据与研究方法 | 第38-43页 |
| 3.2.1 代谢分析流程 | 第38-39页 |
| 3.2.2 实验数据集 | 第39-40页 |
| 3.2.3 基因差异表达分析 | 第40-41页 |
| 3.2.4 衡量生物过程的整体代谢水平 | 第41-42页 |
| 3.2.5 基于多元多重线性回归模型衡量癌症组织中底物参与产物合成的程度.. | 第42-43页 |
| 3.3 实验结果 | 第43-63页 |
| 3.3.1 谷氨酰胺和谷氨酸在癌症组织中的摄入与合成显著增强 | 第43-45页 |
| 3.3.2 谷氨酰胺和谷氨酸在癌症组织中的基础代谢显著增强 | 第45-47页 |
| 3.3.3 谷氨酰胺和谷氨酸在癌症组织中主要参与7种合成代谢过程 | 第47-60页 |
| 3.3.4 谷氨酰胺和谷氨酸代谢增强与癌症组织中活性氧簇水平相关 | 第60-63页 |
| 3.4 结果分析与讨论 | 第63-64页 |
| 3.5 本章小结 | 第64-66页 |
| 第4章 基于拟合回归模型的基因间相关性研究 | 第66-100页 |
| 4.1 研究背景 | 第66-68页 |
| 4.2 研究方法 | 第68-80页 |
| 4.2.1 模型流程 | 第68-70页 |
| 4.2.2 模型样本整合 | 第70-71页 |
| 4.2.3 基因数据收集 | 第71-72页 |
| 4.2.4 验证集合和应用数据收集 | 第72-73页 |
| 4.2.5 基因对特征计算 | 第73-76页 |
| 4.2.6 多特征相似性模型构建 | 第76-80页 |
| 4.3 结果比较方法 | 第80-85页 |
| 4.3.1 逻辑回归 | 第81-82页 |
| 4.3.2 线性判别分析 | 第82-83页 |
| 4.3.3 Receiveroperatingcharacteristic曲线 | 第83页 |
| 4.3.4 高表达基因识别 | 第83页 |
| 4.3.5 快速贪婪模块度优化算法 | 第83-84页 |
| 4.3.6 生物通路富集分析 | 第84页 |
| 4.3.7 最短路径算法 | 第84-85页 |
| 4.4 实验结果 | 第85-95页 |
| 4.4.1 十倍交叉验证 | 第85页 |
| 4.4.2 验证集合实验 | 第85-86页 |
| 4.4.3 癌症基因网络构建 | 第86-93页 |
| 4.4.4 基因功能预测 | 第93-95页 |
| 4.5 结果分析与讨论 | 第95-97页 |
| 4.6 本章小结 | 第97-100页 |
| 第5章 总结与展望 | 第100-104页 |
| 参考文献 | 第104-120页 |
| 作者简介及攻读博士学位期间取得的科研成果 | 第120-122页 |
| 致谢 | 第122页 |
