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秦岭南北坡拉氏鱥及其寄生三代虫的谱系地理学初探

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
第1章 前言第9-17页
    1.1 拉氏鱥生物学研究进展第9-10页
        1.1.1 拉氏鱥简介及生物习性第9页
        1.1.2 拉氏鱥的研究现状第9-10页
        1.1.3 拉氏鱥的经济性及研究的必要性第10页
    1.2 三代虫生物学研究进展第10-13页
        1.2.1 三代虫简介及生物习性第11页
        1.2.2 三代虫的研究现状第11-12页
        1.2.3 三代虫的致病性及危害第12-13页
    1.3 谱系地理学第13-16页
        1.3.1 谱系地理学与比较系统发生生物地理学第13-14页
        1.3.2 存在寄生关系物种的协同进化研究第14-15页
        1.3.3 寄生关系中的宿主转换研究第15-16页
        1.3.4 拉氏鱥及三代虫类群常用的DNA分子标记基因第16页
    1.4 研究目的和意义第16-17页
第2章 实验材料与方法第17-23页
    2.1 实验材料第17-19页
        2.1.1 样品的采集与处理第17页
        2.1.2 实验仪器与试剂第17-19页
    2.2 实验方法第19-20页
        2.2.1 DNA的提取第19页
        2.2.2 引物设计和PCR扩增第19-20页
    2.3 DNA测序及序列的人工校正第20页
    2.4 数据的分析第20-23页
        2.4.1 序列的特征分析第20-21页
        2.4.2 基因的遗传多样性与种群分化分析第21页
        2.4.3 系统发育关系的构建第21页
        2.4.4 单倍型网络关系分析第21-22页
        2.4.5 种群的谱系地理分析第22页
        2.4.6 种群分歧时间的估算第22-23页
第3章 结果与分析第23-43页
    3.1 拉氏鱥及其寄生柯氏三代虫序列的特征第23-25页
        3.1.1 碱基组成分析第23-24页
        3.1.2 碱基替换饱和的定性分析第24-25页
        3.1.3 碱基组成异质性检验第25页
    3.2 拉氏鱥及其寄生柯氏三代虫种群的遗传多样性分析第25-29页
        3.2.1 单倍型多样性第25-26页
        3.2.2 群体间的遗传距离第26-28页
        3.2.3 种群间遗传结构差异的评估第28-29页
    3.3 拉氏鱥及其寄生柯氏三代虫地理种群间系统发育分析第29-34页
        3.3.1 单倍型构建系统发育树第29-34页
        3.3.2 单倍型网络关系分析第34页
    3.4 拉氏鱥及其寄生柯氏三代虫谱系地理学及种群的遗传分化第34-43页
        3.4.1 种群及进化分枝的遗传分化第34-37页
        3.4.2 种群及进化分枝的遗传结构第37页
        3.4.3 种群数量动态历史分析第37-42页
        3.4.4 分歧时间估算第42-43页
第4章 讨论第43-49页
    4.1 拉氏鱥及其寄生柯氏三代虫种群的遗传变异第43-44页
    4.2 拉氏鱥及其寄生柯氏三代虫种群的谱系地理结构第44-46页
    4.3 寄生关系中的放大镜假说第46-49页
第5章 主要结果与结论第49-51页
参考文献第51-61页
致谢第61-63页
攻读硕士学位期间科研成果第63页

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