| ABSTRACT | 第4-5页 |
| 摘要 | 第6-11页 |
| Abbreviations | 第11-13页 |
| Chapter Ⅰ. LITERATURE AND REVIEW | 第13-30页 |
| 1.1 History of astrovirus | 第13-15页 |
| 1.2 Mamastrovirus | 第15-17页 |
| 1.2.1 Human astrovirus | 第15-16页 |
| 1.2.2 Animal astrovirus | 第16-17页 |
| 1.3 Avastrovirus | 第17-18页 |
| 1.4 Astrovirus genome | 第18-21页 |
| 1.4.1 Non structural proteins(nsp1a,nsp1ab) | 第20-21页 |
| 1.4.2 Structural proteins(Capsid protein) | 第21页 |
| 1.5 Astrovirus pathogenesis | 第21-24页 |
| 1.5.1 Astrovirus pathogenesis in humans | 第22页 |
| 1.5.2 Astrovirus pathogenesis in animals | 第22-24页 |
| 1.6 Astrovirus hazard in the food-chain | 第24页 |
| 1.7 Astrovirus antigenicity | 第24-25页 |
| 1.8 Astrovirus diagnostic | 第25页 |
| 1.8.1 Electron microscopy and virus isolation | 第25页 |
| 1.8.2 Serological essay | 第25页 |
| 1.8.3 Biotechnology | 第25页 |
| 1.9 Astrovirus immunization and control | 第25-26页 |
| 1.10 Bovine astrovirus(BAstV) | 第26-28页 |
| 1.11 Brief history of water buffalo | 第28-29页 |
| 1.12 Aims and importance of the research | 第29-30页 |
| 1.12.1 Importance | 第29页 |
| 1.12.2 Aims | 第29-30页 |
| Chapter Ⅱ.MOLECULAR EPIDEMIOLOGY OF BOVINE ASTROVIRUS IN CATTLEAND WATER BUFFALO IN GUANGXI | 第30-53页 |
| 2.0 Experimental design and technical route | 第30-31页 |
| 2.1 Materials | 第31-34页 |
| 2.1.1 Samples | 第31页 |
| 2.1.2 Samples preparation | 第31页 |
| 2.1.3 Principal Reagents | 第31-32页 |
| 2.1.4 Reagents and culture media preparation | 第32-33页 |
| 2.1.5 Principal Instruments and Equipments | 第33-34页 |
| 2.2 Methods | 第34-41页 |
| 2.2.1 Primers design | 第34-35页 |
| 2.2.2 Total RNA extraction | 第35-36页 |
| 2.2.3 1st strand cDNA synthesis (RT) | 第36页 |
| 2.2.4 PCR detection for Astrovirus and gene amplification | 第36-38页 |
| 2.2.5 Agarose Gel Electrophoresis (AGE) | 第38页 |
| 2.2.6 Gene cloning | 第38-40页 |
| 2.2.7 Gene sequencing | 第40页 |
| 2.2.8 Results analysis and computation | 第40-41页 |
| 2.3 Results analysis | 第41-49页 |
| 2.3.1 RT-PCR detection results | 第41-42页 |
| 2.3.2 Partial ORF2 amplification results | 第42-43页 |
| 2.3.3 Trial study on co-infection of Astrovirus and other known viral enteropathogens | 第43-46页 |
| 2.3.4 Phylogenetic analysis based on partial ORF2 of the Guangxi BAstVs | 第46-49页 |
| 2.4 Discussion | 第49-53页 |
| Chapter Ⅲ. COMPLETE GENOME CLONING AND SEQUENCE ANALYSIS OF THEGUANGXI BOVINE ASTROVIRUSES (BAstV-GX/CHN/2014) | 第53-82页 |
| 3.0 Experimental design and technical route | 第53页 |
| 3.1 Introduction | 第53-54页 |
| 3.2 Materials | 第54页 |
| 3.2.1 Samples | 第54页 |
| 3.2.2 Principal Reagents, instruments and equipments | 第54页 |
| 3.3 Methods | 第54-59页 |
| 3.3.1 Primers design | 第54-55页 |
| 3.3.2 Total RNA extraction | 第55页 |
| 3.3.3 1~(st) strand cDNA bank synthesis | 第55页 |
| 3.3.4 3'-end amplification 1~(st) strand cDNA bank synthesis | 第55-56页 |
| 3.3.5 5'-end amplification 1~(st) strand cDNA bank synthesis | 第56-57页 |
| 3.3.6 The complete genome PCR amplification | 第57-59页 |
| 3.3.7 Gene cloning and sequencing | 第59页 |
| 3.3.8 Computation and analysis | 第59页 |
| 3.4 Results analysis | 第59-78页 |
| 3.4.1 ORF1a analysis | 第60-65页 |
| 3.4.2 ORF1b analysis | 第65-66页 |
| 3.4.3 ORF2 analysis | 第66-75页 |
| 3.4.4 Analysis of the ORF1b/ORF2 junction and the overlap region | 第75-76页 |
| 3.4.5 Complete genome sequences analysis | 第76-78页 |
| 3.5 Discussion | 第78-82页 |
| Chapter Ⅳ. GENERAL CONCLUSION | 第82-85页 |
| REFERENCES | 第85-96页 |
| ANNEXES | 第96-102页 |
| ACKOWLEDMENTS | 第102页 |
