| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 1 前言 | 第9-27页 |
| 1.1 香蕉简介 | 第9页 |
| 1.2 香蕉尖孢镰刀菌枯萎病简介 | 第9-11页 |
| 1.3 香蕉枯萎病菌的致病过程 | 第11页 |
| 1.4 组学在植物-病原菌互作研究中的作用 | 第11-12页 |
| 1.5 香蕉枯萎镰刀菌相关组学研究 | 第12-14页 |
| 1.5.1 尖孢镰刀菌古巴专化型结构基因组学 | 第14页 |
| 1.5.2 尖孢镰刀菌古巴专化型功能基因组学 | 第14页 |
| 1.6 香蕉枯萎病菌致病机理及相关功能基因的研究 | 第14-20页 |
| 1.6.1 信号传导系统 | 第15-17页 |
| 1.6.2 细胞壁降解酶 | 第17-18页 |
| 1.6.3 病原菌定殖相关基因 | 第18页 |
| 1.6.4 氧化胁迫调节相关基因 | 第18页 |
| 1.6.5 毒素调节相关基因 | 第18-19页 |
| 1.6.6 其它 | 第19-20页 |
| 1.7 香蕉抗枯萎病相关组学研究 | 第20-24页 |
| 1.7.1 香蕉结构基因组学 | 第20-21页 |
| 1.7.2 基于转录组、蛋白组等的香蕉抗病机理及相关功能基因研究 | 第21-24页 |
| 1.8 香蕉抗病相关功能基因的研究 | 第24-25页 |
| 1.9 本实验的研究目的与意义 | 第25-26页 |
| 1.10 技术路线 | 第26-27页 |
| 2 材料和方法 | 第27-36页 |
| 2.1 材料和试剂 | 第27-28页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第27页 |
| 2.1.2 菌株与质粒 | 第27页 |
| 2.1.3 酶与试剂 | 第27-28页 |
| 2.1.4 培养基与试剂配置 | 第28页 |
| 2.2 仪器设备 | 第28-29页 |
| 2.3 方法和步骤 | 第29-36页 |
| 2.3.1 Foc4和Foc1的GFP标记方法 | 第29-30页 |
| 2.3.2 Foc4和Foc1致病过程比较分析方法 | 第30-31页 |
| 2.3.3 香蕉转录组测序方法 | 第31-32页 |
| 2.3.4 数字表达谱(DGE)测序方法 | 第32-33页 |
| 2.3.5 iTRAQ蛋白定量分析方法 | 第33-36页 |
| 3 结果与分析 | 第36-63页 |
| 3.1 Foc4和Foc1侵染巴西蕉过程比较分析 | 第36-42页 |
| 3.1.1 Foc4和Foc1菌株GFP标记 | 第36-38页 |
| 3.1.2 Foc4和Foc1侵染巴西蕉激光共聚焦显微观察 | 第38-40页 |
| 3.1.3 侵染过程扫描电镜观察 | 第40-42页 |
| 3.2 香蕉转录组分析 | 第42页 |
| 3.2.1 转录组分析和新基因鉴定 | 第42页 |
| 3.2.2 单核苷酸多态性(SNPs)和短插入/缺失(indels)鉴定 | 第42页 |
| 3.3 香蕉对枯萎病菌响应的数字基因表达谱分析 | 第42-50页 |
| 3.3.1 采样时间点的确定 | 第42-43页 |
| 3.3.2 样品相关性分析 | 第43-44页 |
| 3.3.3 Foc响应基因鉴定 | 第44-46页 |
| 3.3.4 Foc响应基因功能分类 | 第46-48页 |
| 3.3.5 实时荧光定量PCR基因表达分析 | 第48-50页 |
| 3.4 香蕉与枯萎病菌互作的iTRAQ蛋白组学分析 | 第50-63页 |
| 3.4.1 蛋白质鉴定 | 第50-54页 |
| 3.4.2 差异表达蛋白分析 | 第54-63页 |
| 4 讨论 | 第63-68页 |
| 4.1 Foc4和Foc1侵染巴西蕉过程的异同 | 第63-64页 |
| 4.2 香蕉转录组与数字基因表达谱分析 | 第64-66页 |
| 4.3 香蕉与枯萎病菌互作的蛋白组学分析 | 第66-67页 |
| 4.4 香蕉转录组与蛋白质组分析结果的的异同 | 第67-68页 |
| 结论 | 第68-69页 |
| 参考文献 | 第69-81页 |
| 致谢 | 第81-82页 |
| 发表论文 | 第82页 |
| 资助项目 | 第82页 |
