蛋白质柔性对接中计算技术研究
| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 插图 | 第9-10页 |
| 表格 | 第10-11页 |
| 第一章 引言 | 第11-18页 |
| 1.1 课题背景 | 第11-14页 |
| 1.2 研究内容 | 第14-15页 |
| 1.3 研究意义 | 第15-16页 |
| 1.4 本文组织结构 | 第16-18页 |
| 第二章 蛋白质柔性对接相关计算技术概述 | 第18-30页 |
| 2.1 蛋白质结构描述及其计算机表达 | 第18-22页 |
| 2.1.1 蛋白质结构描述 | 第18-21页 |
| 2.1.2 蛋白质结构的计算机表达及预测 | 第21-22页 |
| 2.2 蛋白质柔性与对接预测的描述 | 第22-27页 |
| 2.2.1 蛋白质柔性描述 | 第22-24页 |
| 2.2.2 蛋白质对接预测描述 | 第24-27页 |
| 2.3 蛋白质对接结构的挑选 | 第27-29页 |
| 2.4 本章小结 | 第29-30页 |
| 第三章 GPCR 跨膜螺旋柔性形变的预测 | 第30-41页 |
| 3.1 引言 | 第30-31页 |
| 3.2 材料与方法 | 第31-36页 |
| 3.2.1 数据集 | 第31-32页 |
| 3.2.2 形变拓扑表示与计算 | 第32-33页 |
| 3.2.3 形变螺旋聚类与识别 | 第33-34页 |
| 3.2.4 形变弧度的连续von Mises建模 | 第34-35页 |
| 3.2.5 模型采样 | 第35-36页 |
| 3.3 结果分析与讨论 | 第36-40页 |
| 3.3.1 结果分析 | 第36-39页 |
| 3.3.2 讨论 | 第39-40页 |
| 3.4 本章小结 | 第40-41页 |
| 第四章 概率图模型BMF在柔性对接中应用研究 | 第41-67页 |
| 4.1 引言 | 第41-43页 |
| 4.2 实验材料 | 第43页 |
| 4.3 含骨架柔性的蛋白质-蛋白质对接 | 第43-50页 |
| 4.3.1 柔性对接方法设计 | 第43-48页 |
| 4.3.2 柔性对接结果分析 | 第48-50页 |
| 4.4 基于IG概率图模型的柔性对接结构的筛选 | 第50-57页 |
| 4.4.1 柔性对接结构挑选方法设计 | 第50-54页 |
| 4.4.2 柔性对接结构挑选结果分析 | 第54-57页 |
| 4.5 实验讨论 | 第57-65页 |
| 4.6 本章小结 | 第65-67页 |
| 第五章 总结与展望 | 第67-69页 |
| 5.1 工作总结 | 第67-68页 |
| 5.2 研究展望 | 第68-69页 |
| 参考文献 | 第69-77页 |
| 发表文章目录及科研项目 | 第77-78页 |
| 致谢 | 第78-79页 |
