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Cytophaga hutchinsonii遗传操作体系的构建及纤维素利用缺陷菌的筛选与鉴定

摘要第7-9页
ABSTRACT第9-11页
缩略词表(ABBREVIATION)第12-13页
第一章 绪论第13-28页
    1.1 纤维素材料的结构特征第13-15页
    1.2 降解纤维素的微生物第15-17页
        1.2.1 降解纤维素的细菌第15-17页
        1.2.2 降解纤维素的放线菌第17页
        1.2.3 降解纤维素的真菌第17页
    1.3 纤维素的微生物降解机制第17-22页
        1.3.1 纤维素酶降解纤维素的机理第17-18页
        1.3.2 微生物降解纤维素的策略第18-22页
    1.4 Cytophaga hutchinsonii研究背景第22-27页
    1.5 论文的立题依据和工作内容第27-28页
第二章 C.hutchinsonii生长条件及遗传转化体系的优化第28-45页
    2.1 材料与方法第28-34页
        2.1.1 菌株及质粒第28-29页
        2.1.2 培养基及缓冲液第29-30页
        2.1.3 培养方法第30页
        2.1.4 主要试剂与仪器第30-31页
        2.1.5 菌体生长测定第31页
        2.1.6 微镜观察第31页
        2.1.7 C.hutchinsonii原生质体制备与再生方法第31页
        2.1.8 接合供体菌的获得第31-32页
        2.1.9 C.hutchinsonii接合方法第32页
        2.1.10 C.hutchinsonii电转化方法第32-33页
        2.1.11 无细胞提取液(CFE)的制备第33页
        2.1.12 CFE对E.coli质粒的甲基修饰反应第33-34页
    2.2 结果与分析第34-43页
        2.2.1 培养基中不同碳氮源比例对菌体生长的影响第34-36页
        2.2.2 C.hutchinsonii在不同培养基中生长各个时期的细胞形态观察第36-37页
        2.2.3 C.hutchinsonii原生质体制备与再生第37-39页
        2.2.4 C.hutchinsonii与大肠杆菌接合实验第39-40页
        2.2.5 C.hutchinsonii电转化条件优化第40-43页
    2.3 小结与讨论第43-45页
第三章 C.hutchinsonii中纤维素降解相关基因的荧光定量PCR分析第45-56页
    3.1 材料与方法第45-48页
        3.1.1 菌株第45页
        3.1.2 培养基第45-46页
        3.1.3 C.hutchinsonii RNA提取方法第46页
        3.1.4 反转录PCR(RT-PCR)技术第46-47页
        3.1.5 荧光定量PCR技术第47-48页
    3.2 结果与分析第48-54页
        3.2.1 C.hutchinsonii RNA的提取第48-49页
        3.2.2 荧光定量PCR标准曲线实验第49-51页
        3.2.3 荧光定量PCR对纤维素降解相关基因转录水平的分析第51-54页
    3.3 小结与讨论第54-56页
第四章 C.hutchinsonii纤维素利用缺陷型突变株的性质研究第56-71页
    4.1 材料与方法第56-62页
        4.1.1 菌株及质粒第56页
        4.1.2 主要试剂及仪器第56-57页
        4.1.3 培养条件第57页
        4.1.4 基因克隆第57-60页
        4.1.5 转座诱变及纤维素利用缺陷突变株的筛选第60页
        4.1.6 转座诱变随机突变株转座子插入位置的分析第60页
        4.1.7 C.hutchinsonii RNA提取及反转录PCR技术第60页
        4.1.8 chu_1278序列分析方法第60-61页
        4.1.9 chu-1278突变株(C-34)的基因功能回补第61页
        4.1.10 回补菌株验证第61页
        4.1.11 回补菌株的荧光观察第61页
        4.1.12 回补菌株性质研究第61-62页
    4.2 结果与分析第62-70页
        4.2.1 C.hutchinsonii纤维素利用缺陷型突变株筛选第62-63页
        4.2.2 纤维素利用缺陷型突变株C-34中转座子插入位置分析第63页
        4.2.3 chu_1278基因序列的分析第63-64页
        4.2.4 纤维素利用缺陷型突变株C-34生长特性的研究第64-66页
        4.2.5 纤维素利用缺陷型突变株C-34的功能回补第66-70页
    4.3 小结与讨论第70-71页
第五章 C.hutchinsonii中滑动相关蛋白的研究及敲除体系的探索第71-95页
    5.1 材料与方法第71-77页
        5.1.1 菌株及质粒第71页
        5.1.2 培养基第71-73页
        5.1.3 基因克隆第73页
        5.1.4 重组载体构建第73-77页
        5.1.5 突变株MT0170UP的Southern Blot验证第77页
    5.2 结果与分析第77-93页
        5.2.1 C.hutchinsonii中滑动相关基因的分析第77-79页
        5.2.2 基因单插入失活载体的构建第79-80页
        5.2.3 同源双交换载体的构建第80-88页
        5.2.4 重组载体电转化C.hutchinsonii的验证第88页
        5.2.5 Cre-lox系统第88-93页
    5.3 小结与讨论第93-95页
全文总结第95-97页
参考文献第97-103页
致谢第103-104页
附表第104页

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