| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第12-38页 |
| 1.1 细菌小RNA概述 | 第12-19页 |
| 1.1.1 细菌RNA种类和功能 | 第12-13页 |
| 1.1.2 细菌sRNA调控功能及作用机制 | 第13-19页 |
| 1.2 大肠杆菌小RNA研究进展 | 第19-23页 |
| 1.2.1 大肠杆菌持家类非编码RNA | 第20页 |
| 1.2.2 大肠杆菌调控反义RNA | 第20-22页 |
| 1.2.3 大肠杆菌与蛋白互作非编码RNA | 第22-23页 |
| 1.3 假单胞菌属小RNA研究进展 | 第23-32页 |
| 1.3.1 PrrFs维持细菌铁稳态平衡并间接调控群体感应 | 第24-26页 |
| 1.3.2 Gac/Rsm途径激活涉及次级代谢sRNA家族 | 第26-29页 |
| 1.3.3 CrcZ与CrcY参与碳代谢抑制调控 | 第29-31页 |
| 1.3.4 PhrS参与PQS正调控合成 | 第31-32页 |
| 1.4 固氮菌sRNA研究进展 | 第32-36页 |
| 1.5 本论文的立题依据和研究意义 | 第36-37页 |
| 1.6 技术路线 | 第37-38页 |
| 第二章 材料与方法 | 第38-73页 |
| 2.1 实验材料与仪器 | 第38-42页 |
| 2.2 实验方法 | 第42-73页 |
| 第三章 ArsZ的序列分析与鉴定 | 第73-91页 |
| 3.1 引言 | 第73页 |
| 3.2 材料与方法 | 第73页 |
| 3.3 结果与分析 | 第73-85页 |
| 3.3.1 转录组数据分析 | 第73-78页 |
| 3.3.2 ArsZ的结构特征 | 第78-80页 |
| 3.3.3 ArsZ在细菌染色体上的分布及进化分析 | 第80-81页 |
| 3.3.4 ArsZ基因的序列同源性分析及系统发育分析 | 第81-82页 |
| 3.3.5 arsZ基因的序列特征分析 | 第82-83页 |
| 3.3.6 Northern杂交验证ArsZ | 第83-84页 |
| 3.3.7 ArsZ转录起始位点的确定 | 第84-85页 |
| 3.4 ArsZ的转录调控模式 | 第85-89页 |
| 3.4.1 ArsZ在铵抑制条件下诱导表达 | 第85-86页 |
| 3.4.2 ArsZ在氮代谢调控节点突变株△rpoN和△ntrC中的表达 | 第86-87页 |
| 3.4.3 凝胶阻滞验证NtrC蛋白与arsZ启动子区互作 | 第87-88页 |
| 3.4.4 DNase I Foot printing实验 | 第88-89页 |
| 3.5 小结与讨论 | 第89-91页 |
| 第四章 ArsZ的功能鉴定 | 第91-106页 |
| 4.1 引言 | 第91页 |
| 4.2 材料与方法 | 第91页 |
| 4.3 结果与分析 | 第91-97页 |
| 4.3.1 arsZ缺失突变株构建 | 第91-95页 |
| 4.3.2 arsZ回补及过量表达菌株构建 | 第95-97页 |
| 4.4 ArsZ参与逆境(固氮、氧化及渗透)胁迫抗性 | 第97-105页 |
| 4.4.1 生长曲线的测定 | 第97-98页 |
| 4.4.2 固氮酶活的测定 | 第98-99页 |
| 4.4.3 反硝化曲线的测定 | 第99-100页 |
| 4.4.4 Biolog分析碳源(GN2)利用情况 | 第100-102页 |
| 4.4.5 Biolog分析氮源(PM3)利用情况 | 第102-103页 |
| 4.4.6 对菌体运动能力的影响 | 第103-104页 |
| 4.4.7 氧化冲击 | 第104页 |
| 4.4.8 山梨醇冲击 | 第104-105页 |
| 4.4.9 盐胁迫冲击 | 第105页 |
| 4.5 小结与讨论 | 第105-106页 |
| 第五章 ArsZ参与固氮调控的机制 | 第106-124页 |
| 5.1 引言 | 第106页 |
| 5.2 材料与方法 | 第106页 |
| 5.3 结果与分析 | 第106-124页 |
| 5.3.1 ArsZ固氮相关基因表达分析 | 第106-107页 |
| 5.3.2 ArsZ蛋白质组学分析 | 第107-118页 |
| 5.3.3 ArsZ靶标鉴定及半衰期 | 第118-119页 |
| 5.3.4 ArsZ靶标的免疫印迹鉴定 | 第119-120页 |
| 5.3.5 ArsZ定点突变回补株固氮酶活测定 | 第120-121页 |
| 5.3.6 ArsZ与靶标基因互作(sRNA-mRNA) | 第121-123页 |
| 5.3.7 ArsZ调控模式图 | 第123-124页 |
| 第六章 结论与展望 | 第124-126页 |
| 6.1 总结 | 第124页 |
| 6.2 创新点 | 第124-125页 |
| 6.3 展望 | 第125-126页 |
| 参考文献 | 第126-136页 |
| 致谢 | 第136-138页 |
| 个人简历 | 第138页 |
